RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477700.1

RALGPS1-213, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 3

Gene RALGPS1, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-213ENST00000477700 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 A0A0U1RRA0 63 aa6.54□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 PFN2P35080 140 aa6.54□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 SYCNQ0VAF6 134 aa6.54□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 Q6ZRU5 148 aa6.54□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.53□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 SLPIP03973 132 aa6.53□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 WFDC2Q14508 124 aa6.53□□□□□ -1.36
RALGPS1-213ENST00000477700 K7ERJ3 54 aa6.52□□□□□ -1.37
RALGPS1-213ENST00000477700 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.52□□□□□ -1.37
RALGPS1-213ENST00000477700 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RALGPS1-213ENST00000477700 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.52□□□□□ -1.37
RALGPS1-213ENST00000477700 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.51□□□□□ -1.37
RALGPS1-213ENST00000477700 C9orf118A6NHY6 69 aa6.51□□□□□ -1.37
RALGPS1-213ENST00000477700 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.51□□□□□ -1.37
RALGPS1-213ENST00000477700 NDUFC2O95298 119 aa6.51□□□□□ -1.37
RALGPS1-213ENST00000477700 NPC2P61916 151 aa6.51□□□□□ -1.37
RALGPS1-213ENST00000477700 C14orf177Q52M58 125 aa6.51□□□□□ -1.37
RALGPS1-213ENST00000477700 CARD19Q96LW7 228 aa6.51□□□□□ -1.37
RALGPS1-213ENST00000477700 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.51□□□□□ -1.37
RALGPS1-213ENST00000477700 PSCAO43653 123 aa6.5□□□□□ -1.37
RALGPS1-213ENST00000477700 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.5□□□□□ -1.37
RALGPS1-213ENST00000477700 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.49□□□□□ -1.37
RALGPS1-213ENST00000477700 M0R2N4 97 aa6.49□□□□□ -1.37
RALGPS1-213ENST00000477700 LECT2O14960 151 aa6.49□□□□□ -1.37
RALGPS1-213ENST00000477700 LY6G6CO95867 125 aa6.49□□□□□ -1.37
RALGPS1-213ENST00000477700 IGKV2D-28P01615 120 aa6.49□□□□□ -1.37
RALGPS1-213ENST00000477700 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.49□□□□□ -1.37
RALGPS1-213ENST00000477700 A0A1B0GV90 55 aa6.48□□□□□ -1.37
RALGPS1-213ENST00000477700 TSPAN13O95857 204 aa6.48□□□□□ -1.37
RALGPS1-213ENST00000477700 RAB37Q96AX2 223 aa6.48□□□□□ -1.37
RALGPS1-213ENST00000477700 Q6ZRP5 223 aa6.47□□□□□ -1.37
RALGPS1-213ENST00000477700 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.47□□□□□ -1.37
RALGPS1-213ENST00000477700 Q8NDZ9 215 aa6.47□□□□□ -1.37
RALGPS1-213ENST00000477700 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.47□□□□□ -1.37
RALGPS1-213ENST00000477700 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.47□□□□□ -1.37
RALGPS1-213ENST00000477700 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.46□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 A0A087WTM6 91 aa6.46□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.46□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 H3BUT2 72 aa6.46□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 LCE1DQ5T752 114 aa6.46□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.46□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.45□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.45□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 A0A1W2PPM0 123 aa6.45□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 Q8N814 137 aa6.45□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.45□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 VPREB1P12018 145 aa6.44□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.44□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.44□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.43□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 LCE6AA0A183 80 aa6.42□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 FABP2P12104 132 aa6.42□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.42□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.41□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 C16orf90A8MZG2 172 aa6.41□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 RTL8CO15255 209 aa6.41□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 TRIAP1O43715 76 aa6.41□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 IGLV6-57P01721 117 aa6.41□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 GAGE2EQ4V326 116 aa6.41□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 TMEM126AQ9H061 195 aa6.41□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.41□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.41□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 PKD1P98161 4303 aa6.4□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 K7EP34 96 aa6.4□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.4□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.4□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.4□□□□□ -1.38
RALGPS1-213ENST00000477700 A0A096LNI7 61 aa6.39□□□□□ -1.39
RALGPS1-213ENST00000477700 H7C2G1 150 aa6.39□□□□□ -1.39
RALGPS1-213ENST00000477700 M0R378 163 aa6.39□□□□□ -1.39
RALGPS1-213ENST00000477700 VAMP3Q15836 100 aa6.39□□□□□ -1.39
RALGPS1-213ENST00000477700 Q1RN00 199 aa6.39□□□□□ -1.39
RALGPS1-213ENST00000477700 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.39□□□□□ -1.39
RALGPS1-213ENST00000477700 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.39□□□□□ -1.39
RALGPS1-213ENST00000477700 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.38□□□□□ -1.39
RALGPS1-213ENST00000477700 NCR3O14931 201 aa6.38□□□□□ -1.39
RALGPS1-213ENST00000477700 GAGE2BQ13066 116 aa6.38□□□□□ -1.39
RALGPS1-213ENST00000477700 UBE2V1Q13404 147 aa6.38□□□□□ -1.39
RALGPS1-213ENST00000477700 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.38□□□□□ -1.39
RALGPS1-213ENST00000477700 RYR2Q92736 4967 aa6.37□□□□□ -1.39
RALGPS1-213ENST00000477700 GAGE10A6NGK3 116 aa6.37□□□□□ -1.39
RALGPS1-213ENST00000477700 EPM2AB3EWF7 344 aa6.37□□□□□ -1.39
RALGPS1-213ENST00000477700 COX6CP09669 75 aa6.37□□□□□ -1.39
RALGPS1-213ENST00000477700 PSMB2P49721 201 aa6.37□□□□□ -1.39
RALGPS1-213ENST00000477700 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.37□□□□□ -1.39
RALGPS1-213ENST00000477700 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.36□□□□□ -1.39
RALGPS1-213ENST00000477700 TCL1BO95988 128 aa6.36□□□□□ -1.39
RALGPS1-213ENST00000477700 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.36□□□□□ -1.39
RALGPS1-213ENST00000477700 FAM168BA1KXE4 195 aa6.35□□□□□ -1.39
RALGPS1-213ENST00000477700 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.35□□□□□ -1.39
RALGPS1-213ENST00000477700 C7orf33Q8WU49 177 aa6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms