RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468576.1

PTPRG-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRG, Length 854 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-202ENST00000468576 C3P01024 1663 aa0.25□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 MYOM1P52179 1685 aa0.25□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 LMO7Q8WWI1 1683 aa0.25□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 ALS2Q96Q42 1657 aa0.25□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 CLTCL1P53675 1640 aa0.25□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 USP32Q8NFA0 1604 aa0.25□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa0.25□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP0.25□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 NRXN1Q9ULB1 1477 aa0.25□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 HFM1A2PYH4 1435 aa0.25□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 ABCC5O15440 1437 aa0.25□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 ANKARQ7Z5J8 1434 aa0.25□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 VPS8Q8N3P4 1428 aa0.25□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 NSD3Q9BZ95 1437 aa0.25□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 LINC00032P0C843 101 aa0.25□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 SEC11AP67812 179 aa0.25□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 C10orf113Q5VZT2 155 aa0.25□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 DEFB123Q8N688 67 aa0.25□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 USMG5Q96IX5 58 aa0.25□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 LINC00472Q9H8W2 130 aa0.25□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 CEP290O15078 2479 aa0.25□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa0.25□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 PKDREJQ9NTG1 2253 aa0.25□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 EP400Q96L91 3159 aa0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 PSME4Q14997 1843 aa0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 NUP188Q5SRE5 1749 aa0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 NRAPQ86VF7 1730 aa0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 ABCA3Q99758 1704 aa0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 FMN2Q9NZ56 1722 aa0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 NFAT5O94916 1531 aa0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 TULP4Q9NRJ4 1543 aa0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 CREBBPQ92793 2442 aa0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 C2CD3Q4AC94 2353 aa0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 AKAP6Q13023 2319 aa0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 PLCE1Q9P212 2302 aa0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 M0R2T5 61 aa0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 SPINK4O60575 86 aa0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 COX8AP10176 69 aa0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 RYR2Q92736 4967 aa0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 MUC3AQ02505 3323 aa0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 PLXNB2O15031 1838 aa0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 LRRK2Q5S007 2527 aa0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 RGPD5Q99666 1765 aa0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 SPTA1P02549 2419 aa0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 LY75O60449 1722 aa0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 MON2Q7Z3U7 1717 aa0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 PKD1L3Q7Z443 1732 aa0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 C5P01031 1676 aa0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 SCN7AQ01118 1682 aa0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 NHSQ6T4R5 1651 aa0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP0.24□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 PCNTO95613 3336 aa0.23□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP0.23□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 RYR1P21817 5038 aa0.23□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP0.23□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 EPG5Q9HCE0 2579 aa0.23□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 STAB1Q9NY15 2570 aa0.23□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa0.23□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 CCNB3Q8WWL7 1395 aa0.23□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 BRCA2P51587 3418 aa0.23□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 TSC2P49815 1807 aa0.23□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 ZNF236Q9UL36 1845 aa0.23□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 UQCRHP07919 91 aa0.23□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 PMCHL1Q16048 86 aa0.23□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 DEFB121Q5J5C9 76 aa0.23□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 SPRR4Q96PI1 79 aa0.23□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 A0A1B0GUL6 1792 aa0.23□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 LTN1O94822 1766 aa0.23□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa0.23□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 BCORQ6W2J9 1755 aa0.23□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 LRRC37AA6NMS7 1700 aa0.23□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa0.23□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa0.23□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 COL4A6Q14031 1691 aa0.23□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 HECTD1Q9ULT8 2610 aa0.23□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP0.23□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 CDH23Q9H251 3354 aa0.23□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 LAMA3Q16787 3333 aa0.23□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 CEP250Q9BV73 2442 aa0.23□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 CENPFP49454 3210 aa0.23□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa0.23□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 COL6A5A8TX70 2615 aa0.22□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 SPTBN4Q9H254 2564 aa0.22□□□□□ -2.37
PTPRG-202ENST00000468576 CHD8Q9HCK8 2581 aa0.22□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.9 ms