RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 COX7B2Q8TF08 81 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 PRSS2P07478 247 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 BAGE3Q86Y29 109 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 XAGE1AQ9HD64 81 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC01549A6NIU2 74 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 F8VRH5 84 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIAP1O43715 76 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB5BP61020 215 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 CKS1BP61024 79 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 HERV-K104P63124 156 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 PKIGQ9Y2B9 76 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 SERF1AO75920 110 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP5LO75964 103 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP10-8P60410 259 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 C1orf137Q5JT78 98 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 Q8NDZ9 215 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 IFI27L1Q96BM0 104 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 C22orf24Q9Y442 160 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 M0QXV9 152 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 SPINK6Q6UWN8 80 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC01600Q96MT4 127 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM223A0PJW6 202 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 IGLV7-43P04211 117 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 CXCL5P42830 114 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM170BQ5T4T1 132 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 H3BRM9 83 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 HSBP1O75506 76 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 FABP4P15090 132 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 PFN2P35080 140 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00167Q96N53 147 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 TSPEAR-AS2P59090 65 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 UBE2BP63146 152 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 PMCHL2Q9BQD1 86 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A0A0MQY5 61 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 RPL37AP8A6NKH3 93 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM238C9JI98 176 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 HIST1H2BKO60814 126 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 LEPROTL1O95214 131 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 HIST1H2BJP06899 126 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 HIST1H2BOP23527 126 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 HIST1H2BBP33778 126 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 HIST1H2BDP58876 126 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 HIST1H2BCP62807 126 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 HIST2H2BEQ16778 126 aa4.22□□□□□ -1.73
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RABGEF1-206ENST00000461017 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 BOD1L2Q8IYS8 172 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 HIST1H2BHQ93079 126 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 HIST1H2BNQ99877 126 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 HIST1H2BMQ99879 126 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 ERG28Q9UKR5 140 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1-206ENST00000461017 H0Y9J4 135 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGEF1-206ENST00000461017 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGEF1-206ENST00000461017 PRR26Q8N8Z3 221 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGEF1-206ENST00000461017 TP73-AS1Q9UF72 201 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGEF1-206ENST00000461017 PRYO14603 147 aa4.2□□□□□ -1.74
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RABGEF1-206ENST00000461017 UBE2V1Q13404 147 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGEF1-206ENST00000461017 REG3GQ6UW15 175 aa4.2□□□□□ -1.74
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RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF861PO60384 105 aa4.19□□□□□ -1.74
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RABGEF1-206ENST00000461017 COX17Q14061 63 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGEF1-206ENST00000461017 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa4.18□□□□□ -1.74
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RABGEF1-206ENST00000461017 LEPROTO15243 131 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGEF1-206ENST00000461017 IGKV2D-28P01615 120 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGEF1-206ENST00000461017 IGKCP01834 107 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGEF1-206ENST00000461017 DIRC1Q969H9 104 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGEF1-206ENST00000461017 ANAPC11Q9NYG5 84 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGEF1-206ENST00000461017 NDUFA12Q9UI09 145 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGEF1-206ENST00000461017 HSPB8Q9UJY1 196 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGEF1-206ENST00000461017 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGEF1-206ENST00000461017 BCE1O60756 84 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGEF1-206ENST00000461017 DPM2O94777 84 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGEF1-206ENST00000461017 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGEF1-206ENST00000461017 DAND5Q8N907 189 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A087X002 238 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1-206ENST00000461017 J3QQQ9 107 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1-206ENST00000461017 M0R378 163 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1-206ENST00000461017 C3orf79P0CE67 100 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1-206ENST00000461017 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
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