RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424636.2

TRDMT1-204, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRDMT1, Length 333 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-204ENST00000424636 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa-1.15□□□□□ -2.59
TRDMT1-204ENST00000424636 MAP3K1Q13233 1512 aa-1.15□□□□□ -2.59
TRDMT1-204ENST00000424636 TLN2Q9Y4G6 2542 aa-1.15□□□□□ -2.59
TRDMT1-204ENST00000424636 CSMD1Q96PZ7 3565 aa-1.15□□□□□ -2.59
TRDMT1-204ENST00000424636 A0A1B0GU69 56 aa-1.15□□□□□ -2.59
TRDMT1-204ENST00000424636 C5orf38Q86SI9 138 aa-1.15□□□□□ -2.59
TRDMT1-204ENST00000424636 COPS9Q8WXC6 57 aa-1.15□□□□□ -2.59
TRDMT1-204ENST00000424636 RERGLQ9H628 205 aa-1.15□□□□□ -2.59
TRDMT1-204ENST00000424636 HIGD1BQ9P298 99 aa-1.15□□□□□ -2.59
TRDMT1-204ENST00000424636 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa-1.15□□□□□ -2.59
TRDMT1-204ENST00000424636 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP-1.15□□□□□ -2.59
TRDMT1-204ENST00000424636 SHPRHQ149N8 1683 aa-1.16□□□□□ -2.59
TRDMT1-204ENST00000424636 LRBAP50851 2863 aa-1.16□□□□□ -2.59
TRDMT1-204ENST00000424636 BPTFQ12830 3046 aa-1.16□□□□□ -2.59
TRDMT1-204ENST00000424636 H0YAA0 97 aa-1.16□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 COMMD6Q7Z4G1 85 aa-1.16□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 KIF20BQ96Q89 1820 aa-1.17□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 MBD5Q9P267 1494 aa-1.17□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 C4AP0C0L4 1744 aa-1.17□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 C4BP0C0L5 1744 aa-1.17□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP-1.17□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 FAM223BA6NKX1 122 aa-1.17□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP-1.17□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 MT1XP80297 61 aa-1.17□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 HEPN1Q6WQI6 88 aa-1.17□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 AKAP14Q86UN6 197 aa-1.17□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 ARL11Q969Q4 196 aa-1.17□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 PPP3R2Q96LZ3 170 aa-1.17□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 PDCD10Q9BUL8 212 aa-1.17□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP-1.17□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 UQCR10Q9UDW1 63 aa-1.17□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 CLIP1P30622 1438 aa-1.17□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 TOP2BQ02880 1626 aa-1.18□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 MAPKBP1O60336 1514 aa-1.18□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa-1.18□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa-1.18□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 A0A1B0GWA3 101 aa-1.18□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 C9orf153Q5TBE3 101 aa-1.18□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 C6orf201Q7Z4U5 140 aa-1.18□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 KNDC1Q76NI1 1749 aa-1.18□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 DNAH10Q8IVF4 4471 aa-1.19□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP-1.19□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 MYO9AB2RTY4 2548 aa-1.19□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 CUX1P39880 1505 aa-1.19□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 DEFB1P60022 68 aa-1.19□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 DR1Q01658 176 aa-1.19□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 QSER1Q2KHR3 1735 aa-1.19□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP-1.19□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 A2ML1A8K2U0 1454 aa-1.19□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 MON2Q7Z3U7 1717 aa-1.2□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 A0A087WVE0 104 aa-1.2□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 K7EP34 96 aa-1.2□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 SNCAP37840 140 aa-1.2□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 Q56UQ5 140 aa-1.2□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP-1.2□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 S4R3F8 94 aa-1.2□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 PREX1Q8TCU6 1659 aa-1.2□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 CFAP46Q8IYW2 2715 aa-1.21□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 ALKQ9UM73 1620 aa-1.21□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 A0A0G2JND7 137 aa-1.21□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa-1.21□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP-1.21□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 F6UZH7 168 aa-1.21□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 COX6CP09669 75 aa-1.21□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 ARPC4P59998 168 aa-1.21□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 Q0VG73 95 aa-1.21□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 CATR1Q13166 79 aa-1.21□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 SMIM21Q3B7S5 101 aa-1.21□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 CHD1O14646 1710 aa-1.21□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP-1.21□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 RGPD5Q99666 1765 aa-1.21□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 SCN11AQ9UI33 1791 aa-1.21□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 EYSQ5T1H1 3165 aa-1.22□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 C5P01031 1676 aa-1.22□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 H0Y9P7 68 aa-1.22□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 APOC2P02655 101 aa-1.22□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 TRAPPC2P0DI81 140 aa-1.22□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 TRAPPC2BP0DI82 140 aa-1.22□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 MEIG1Q5JSS6 88 aa-1.22□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 SFTA2Q6UW10 78 aa-1.22□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 PP6455Q8WZ26 134 aa-1.22□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 PFDN5Q99471 154 aa-1.22□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 PRO1854Q9UHT4 67 aa-1.22□□□□□ -2.6
TRDMT1-204ENST00000424636 SAMD9Q5K651 1589 aa-1.22□□□□□ -2.61
TRDMT1-204ENST00000424636 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP-1.23□□□□□ -2.61
TRDMT1-204ENST00000424636 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa-1.23□□□□□ -2.61
TRDMT1-204ENST00000424636 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa-1.23□□□□□ -2.61
TRDMT1-204ENST00000424636 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa-1.23□□□□□ -2.61
TRDMT1-204ENST00000424636 OOSP1A8MZH6 123 aa-1.23□□□□□ -2.61
TRDMT1-204ENST00000424636 H3BQF6 201 aa-1.23□□□□□ -2.61
TRDMT1-204ENST00000424636 ARMS2P0C7Q2 107 aa-1.23□□□□□ -2.61
TRDMT1-204ENST00000424636 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP-1.23□□□□□ -2.61
TRDMT1-204ENST00000424636 DEFB110Q30KQ9 67 aa-1.23□□□□□ -2.61
TRDMT1-204ENST00000424636 COX6B2Q6YFQ2 88 aa-1.23□□□□□ -2.61
TRDMT1-204ENST00000424636 DPH3P1Q9H4G8 78 aa-1.23□□□□□ -2.61
TRDMT1-204ENST00000424636 MANBALQ9NQG1 85 aa-1.23□□□□□ -2.61
TRDMT1-204ENST00000424636 UBR3Q6ZT12 1888 aa-1.23□□□□□ -2.61
TRDMT1-204ENST00000424636 CUL7Q14999 1698 aa-1.23□□□□□ -2.61
TRDMT1-204ENST00000424636 SCAPERQ9BY12 1400 aa-1.23□□□□□ -2.61
TRDMT1-204ENST00000424636 PLXNC1O60486 1568 aa-1.24□□□□□ -2.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76 ms