RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 SMPXQ9UHP9 88 aa-2.24□□□□□ -2.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa-2.25□□□□□ -2.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A0G2JND7 137 aa-2.25□□□□□ -2.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP-2.25□□□□□ -2.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A1B0GV72 72 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 J3QR89 54 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARMS2P0C7Q2 107 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 DPH3Q96FX2 82 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPANXCQ9NY87 97 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 GINS2Q9Y248 185 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPEF2Q9C093 1822 aa-2.26□□□□□ -2.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 K7ERU9 68 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 GNG10P50151 68 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 SFTA2Q6UW10 78 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 COX6B2Q6YFQ2 88 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 SMIM3Q9BZL3 60 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 PSENENQ9NZ42 101 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 ANKRD36A6QL64 1941 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAPKBP1O60336 1514 aa-2.27□□□□□ -2.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 SCN7AQ01118 1682 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 E5RI56 91 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 PP6455Q8WZ26 134 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARL11Q969Q4 196 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 HSPB11Q9Y547 144 aa-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP-2.28□□□□□ -2.77
RNU6-170P-201ENST00000362832 H0Y9P7 68 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 DEFB107AQ8IZN7 70 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 C4AP0C0L4 1744 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 C4BP0C0L5 1744 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 NUP188Q5SRE5 1749 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 TSTD3H0UI37 97 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 H3BQF6 201 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 M0R2Z0 102 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRAPPC2P0DI81 140 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRAPPC2BP0DI82 140 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 GNGT1P63211 74 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 COMMD6Q7Z4G1 85 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPP3R2Q96LZ3 170 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 PDCD10Q9BUL8 212 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 DDA1Q9BW61 102 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 CENPHQ9H3R5 247 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 SERP1Q9Y6X1 66 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 ATMQ13315 3056 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 RGPD2P0DJD1 1756 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 SCGB1A1P11684 91 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 HSD52Q0P140 79 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 SMCO1Q147U7 214 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 RERGLQ9H628 205 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 MANBALQ9NQG1 85 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 CFTRP13569 1480 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 COX6CP09669 75 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 Q56UQ5 140 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCDC167Q9P0B6 97 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 SCN11AQ9UI33 1791 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 CUX1P39880 1505 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 A2ML1A8K2U0 1454 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 MRC2Q9UBG0 1479 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 C7orf77A4D0Y5 90 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 COPS9Q8WXC6 57 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 GSKIPQ9P0R6 139 aa-2.33□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 FHAD1B1AJZ9 1412 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 SHROOM2Q13796 1616 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 MGAQ8IWI9 3026 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 COPZ1P61923 177 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 Q0VG73 95 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 SMIM21Q3B7S5 101 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 TCEAL4Q96EI5 215 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 C12orf57Q99622 126 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPANXA1Q9NS26 97 aa-2.34□□□□□ -2.78
RNU6-170P-201ENST00000362832 NBEAP1P0C6P0 100 aa-2.35□□□□□ -2.79
RNU6-170P-201ENST00000362832 LINC00158P58513 81 aa-2.35□□□□□ -2.79
RNU6-170P-201ENST00000362832 GNG11P61952 73 aa-2.35□□□□□ -2.79
RNU6-170P-201ENST00000362832 RPS25P62851 125 aaKnown RBP-2.35□□□□□ -2.79
RNU6-170P-201ENST00000362832 PSMG4Q5JS54 123 aa-2.35□□□□□ -2.79
RNU6-170P-201ENST00000362832 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP-2.35□□□□□ -2.79
RNU6-170P-201ENST00000362832 DEFB106AQ8N104 65 aa-2.35□□□□□ -2.79
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRO3102Q9H379 93 aa-2.35□□□□□ -2.79
RNU6-170P-201ENST00000362832 PBRM1Q86U86 1689 aa-2.35□□□□□ -2.79
RNU6-170P-201ENST00000362832 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa-2.36□□□□□ -2.79
RNU6-170P-201ENST00000362832 TCHHQ07283 1943 aa-2.36□□□□□ -2.79
RNU6-170P-201ENST00000362832 CSMD2Q7Z408 3487 aa-2.36□□□□□ -2.79
RNU6-170P-201ENST00000362832 PREX1Q8TCU6 1659 aa-2.36□□□□□ -2.79
RNU6-170P-201ENST00000362832 F6UZH7 168 aa-2.36□□□□□ -2.79
RNU6-170P-201ENST00000362832 FABP1P07148 127 aa-2.36□□□□□ -2.79
RNU6-170P-201ENST00000362832 TNP1P09430 55 aa-2.36□□□□□ -2.79
RNU6-170P-201ENST00000362832 C3orf79P0CE67 100 aa-2.36□□□□□ -2.79
RNU6-170P-201ENST00000362832 CKS1BP61024 79 aa-2.36□□□□□ -2.79
RNU6-170P-201ENST00000362832 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP-2.36□□□□□ -2.79
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRO1854Q9UHT4 67 aa-2.36□□□□□ -2.79
RNU6-170P-201ENST00000362832 ABCC5O15440 1437 aa-2.36□□□□□ -2.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms