RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358071.8

RAD9B-201, Transcript of RAD9 checkpoint clamp component B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAD9B, Length 2,843 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9B-201ENST00000358071 A0A087WYN8 130 aa4.79□□□□□ -1.64
RAD9B-201ENST00000358071 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
RAD9B-201ENST00000358071 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa4.79□□□□□ -1.64
RAD9B-201ENST00000358071 ANKRD29Q8N6D5 301 aa4.79□□□□□ -1.64
RAD9B-201ENST00000358071 CARD19Q96LW7 228 aa4.79□□□□□ -1.64
RAD9B-201ENST00000358071 SMAGPQ0VAQ4 97 aa4.79□□□□□ -1.64
RAD9B-201ENST00000358071 Q8IZM0 81 aa4.79□□□□□ -1.64
RAD9B-201ENST00000358071 SLC25A20O43772 301 aa4.78□□□□□ -1.64
RAD9B-201ENST00000358071 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RAD9B-201ENST00000358071 FAM168BA1KXE4 195 aa4.78□□□□□ -1.64
RAD9B-201ENST00000358071 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RAD9B-201ENST00000358071 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.65
RAD9B-201ENST00000358071 TRAV10A0A0B4J240 114 aa4.78□□□□□ -1.65
RAD9B-201ENST00000358071 CAMK2N2Q96S95 79 aa4.78□□□□□ -1.65
RAD9B-201ENST00000358071 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa4.77□□□□□ -1.65
RAD9B-201ENST00000358071 TIMM17BO60830 172 aa4.77□□□□□ -1.65
RAD9B-201ENST00000358071 F8W1H4 67 aa4.76□□□□□ -1.65
RAD9B-201ENST00000358071 Q6ZRP5 223 aa4.76□□□□□ -1.65
RAD9B-201ENST00000358071 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RAD9B-201ENST00000358071 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa4.76□□□□□ -1.65
RAD9B-201ENST00000358071 IFITM1P13164 125 aa4.76□□□□□ -1.65
RAD9B-201ENST00000358071 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa4.75□□□□□ -1.65
RAD9B-201ENST00000358071 DNAH10OSP0CZ25 163 aa4.74□□□□□ -1.65
RAD9B-201ENST00000358071 LINC01556Q5JQF7 62 aa4.74□□□□□ -1.65
RAD9B-201ENST00000358071 RPL37AP8A6NKH3 93 aa4.74□□□□□ -1.65
RAD9B-201ENST00000358071 USP17L23D6RBM5 183 aa4.74□□□□□ -1.65
RAD9B-201ENST00000358071 ATXN8Q156A1 80 aa4.74□□□□□ -1.65
RAD9B-201ENST00000358071 C6orf99Q4VX62 202 aa4.74□□□□□ -1.65
RAD9B-201ENST00000358071 LST1O00453 97 aa4.73□□□□□ -1.65
RAD9B-201ENST00000358071 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa4.73□□□□□ -1.65
RAD9B-201ENST00000358071 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RAD9B-201ENST00000358071 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.73□□□□□ -1.65
RAD9B-201ENST00000358071 K7ERU9 68 aa4.73□□□□□ -1.65
RAD9B-201ENST00000358071 C22orf24Q9Y442 160 aa4.73□□□□□ -1.65
RAD9B-201ENST00000358071 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.73□□□□□ -1.65
RAD9B-201ENST00000358071 COX6CP09669 75 aa4.73□□□□□ -1.65
RAD9B-201ENST00000358071 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa4.73□□□□□ -1.65
RAD9B-201ENST00000358071 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa4.72□□□□□ -1.65
RAD9B-201ENST00000358071 H3BNG1 76 aa4.72□□□□□ -1.65
RAD9B-201ENST00000358071 GAGE2BQ13066 116 aa4.72□□□□□ -1.65
RAD9B-201ENST00000358071 C4orf48Q5BLP8 95 aa4.72□□□□□ -1.65
RAD9B-201ENST00000358071 S100A7L2Q5SY68 101 aa4.72□□□□□ -1.65
RAD9B-201ENST00000358071 CHTF8P0CG12 524 aa4.72□□□□□ -1.65
RAD9B-201ENST00000358071 TEN1Q86WV5 123 aa4.72□□□□□ -1.65
RAD9B-201ENST00000358071 B9D2Q9BPU9 175 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 APLNQ9ULZ1 77 aa4.71□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 BAALC-AS2P0C853 105 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 SYCNQ0VAF6 134 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4.7□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 MT-ATP8P03928 68 aa4.69□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 RPL28P46779 137 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 PSCAO43653 123 aa4.69□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 XGP55808 180 aa4.69□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 C15orf53Q8NAA6 179 aa4.69□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 CDIP1Q9H305 208 aa4.69□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 C14orf132Q9NPU4 83 aa4.69□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 DNAH11Q96DT5 4516 aa4.69□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 PKHD1P08F94 4074 aa4.69□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 LYRM7Q5U5X0 104 aa4.68□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 DNAH17Q9UFH2 4485 aa4.68□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 PANO1I0J062 215 aa4.68□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 CXCL5P42830 114 aa4.68□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 TTC32Q5I0X7 151 aa4.68□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 FAT2Q9NYQ8 4349 aa4.67□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.67□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 HAMPP81172 84 aa4.67□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 C3orf22Q8N5N4 141 aa4.67□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 PPDPFLQ8WWR9 84 aa4.67□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 DNAL4O96015 105 aa4.67□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 VPREB1P12018 145 aa4.67□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 COX17Q14061 63 aa4.67□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 SMIM20Q8N5G0 67 aa4.67□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 A0A0G2JQZ4 141 aa4.66□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 A0A1W2PNN7 141 aa4.66□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 TMEM126AQ9H061 195 aa4.66□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 DNAH8Q96JB1 4490 aa4.66□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 DEFB105AQ8NG35 78 aa4.66□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 A0A096LNI7 61 aa4.65□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa4.65□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 V9GYY9 64 aa4.65□□□□□ -1.66
RAD9B-201ENST00000358071 Q6ZQY7 126 aa4.65□□□□□ -1.67
RAD9B-201ENST00000358071 Q8N814 137 aa4.65□□□□□ -1.67
RAD9B-201ENST00000358071 COPS9Q8WXC6 57 aa4.65□□□□□ -1.67
RAD9B-201ENST00000358071 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.64□□□□□ -1.67
RAD9B-201ENST00000358071 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.64□□□□□ -1.67
RAD9B-201ENST00000358071 LINC01561Q8N1V8 128 aa4.64□□□□□ -1.67
RAD9B-201ENST00000358071 SMCR5Q8TEV8 140 aa4.64□□□□□ -1.67
RAD9B-201ENST00000358071 SS18L2Q9UHA2 77 aa4.64□□□□□ -1.67
RAD9B-201ENST00000358071 IGLV6-57P01721 117 aa4.64□□□□□ -1.67
RAD9B-201ENST00000358071 C7orf33Q8WU49 177 aa4.64□□□□□ -1.67
RAD9B-201ENST00000358071 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
RAD9B-201ENST00000358071 LY6G6CO95867 125 aa4.64□□□□□ -1.67
RAD9B-201ENST00000358071 DNAH5Q8TE73 4624 aa4.63□□□□□ -1.67
RAD9B-201ENST00000358071 NDUFC2O95298 119 aa4.63□□□□□ -1.67
RAD9B-201ENST00000358071 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.8 ms