RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000351328.7

CS-201, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 2,975 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-201ENST00000351328 LINC00313P59037 77 aa4.9□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 LINC01554Q52M75 96 aa4.9□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 TMEM141Q96I45 108 aa4.9□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 FBN3Q75N90 2809 aa4.9□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 TRAV21A0A0B4J279 112 aa4.89□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 MSRB1Q9NZV6 116 aa4.89□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 A0A087X002 238 aa4.89□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa4.89□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa4.89□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 LINC00467Q9BRT7 94 aa4.89□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa4.89□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa4.89□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 SPANXN1Q5VSR9 72 aa4.89□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 Q6ZRP5 223 aa4.89□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa4.89□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 DNAH9Q9NYC9 4486 aa4.88□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa4.88□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 Q6ZTC4 211 aa4.88□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 SMIM2Q9BVW6 85 aa4.88□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 A0A087WZ39 114 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 TRAV22A0A0B4J277 110 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 MIAQ16674 131 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 LINC00337Q8N6G1 96 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 C22orf24Q9Y442 160 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 SNURFQ9Y675 71 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 HTN1P15515 57 aa4.86□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 Q8NAQ8 132 aa4.86□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 C11orf21Q9P2W6 132 aa4.86□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa4.86□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 PRM2P04554 102 aa4.86□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 TMEM254Q8TBM7 123 aa4.86□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 C16orf74Q96GX8 76 aa4.86□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 UBL5Q9BZL1 73 aa4.86□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa4.86□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa4.86□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 GNRH2O43555 120 aa4.86□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 PRYO14603 147 aa4.85□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 TSPEAR-AS2P59090 65 aa4.85□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 LIMD2Q9BT23 127 aa4.85□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 C11orf72Q8NBR9 251 aa4.85□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa4.85□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa4.85□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 C16orf90A8MZG2 172 aa4.84□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 C2orf66Q6UXQ4 117 aa4.84□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 NDUFA12Q9UI09 145 aa4.84□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 COL7A1Q02388 2944 aa4.84□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa4.84□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 A0A0J9YWU9 116 aa4.84□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 DEFB4AO15263 64 aa4.84□□□□□ -1.63
CS-201ENST00000351328 TENM3Q9P273 2699 aa4.84□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 LITAFQ99732 161 aa4.83□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa4.83□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 PRR3P79522 188 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 ENHOQ6UWT2 76 aa4.83□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa4.83□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 NACAE9PAV3 2078 aa4.83□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 PSPHP1O15172 72 aa4.83□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 SPART-AS1P0CW21 52 aa4.83□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 Q9HAA7 133 aa4.83□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa4.82□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 HCG22E2RYF7 251 aa4.82□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 Q5VV11 94 aa4.81□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.81□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 CELA1Q9UNI1 258 aa4.81□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 LINC00612Q8N6U2 182 aa4.81□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa4.8□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 H0YGX0 51 aa4.8□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 C3orf84H3BNL1 204 aa4.8□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 GYPEP15421 78 aa4.8□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 C6orf99Q4VX62 202 aa4.8□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa4.8□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 Q6ZTI0 123 aa4.8□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 SPTSSBQ8NFR3 76 aa4.8□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 C14orf132Q9NPU4 83 aa4.8□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa4.8□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 MUC4Q99102 2169 aa4.8□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 STAB2Q8WWQ8 2551 aa4.8□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 DEFB130BP0DP73 79 aa4.8□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 DEFB130AP0DP74 79 aa4.8□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 Q75L30 129 aa4.8□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 NREPQ16612 68 aa4.79□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 TGP01266 2768 aa4.79□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 TRGV2A0A075B6R0 118 aa4.79□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 SCXQ7RTU7 201 aa4.79□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa4.79□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa4.78□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 PSCAO43653 123 aa4.78□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa4.78□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa4.78□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 MGPP08493 103 aa4.78□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa4.78□□□□□ -1.64
CS-201ENST00000351328 DNAH7Q8WXX0 4024 aa4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms