RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349984.6

CCR6-202, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 2,980 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-202ENST00000349984 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.1□□□□□ -1.59
CCR6-202ENST00000349984 TRAV22A0A0B4J277 110 aa5.09□□□□□ -1.59
CCR6-202ENST00000349984 STARD9Q9P2P6 4700 aa5.09□□□□□ -1.59
CCR6-202ENST00000349984 A6NN06 94 aa5.09□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 A0A0J9YXV3 536 aa5.08□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 F5H697 171 aa5.08□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 VCYO14598 125 aa5.08□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 DIRC1Q969H9 104 aa5.08□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 ZFAND3Q9H8U3 227 aa5.08□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 NCR3O14931 201 aa5.08□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 GNRH2O43555 120 aa5.08□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa5.08□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.08□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 UBL5Q9BZL1 73 aa5.08□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 F6UB75 175 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 C4orf3Q8WVX3 66 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 PRYO14603 147 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 SUMO4Q6EEV6 95 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 LINC00269Q8N2A0 174 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 LINC00308Q8TCZ7 52 aa5.07□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 TRAV21A0A0B4J279 112 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 C16orf90A8MZG2 172 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 DEFB1P60022 68 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 TENM2Q9NT68 2774 aa5.06□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 LINC00315P59091 139 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 FAM74A4Q5TZK3 123 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 UBE2AP49459 152 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa5.05□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 NREPQ16612 68 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 A0A087WYN8 130 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 C11orf72Q8NBR9 251 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 WFDC10AQ9H1F0 79 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 HYDINQ4G0P3 5121 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 LRCOL1A6NCL2 159 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 RPL11P62913 178 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa5.04□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 Q5VV11 94 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 Q8N3U1 123 aa5.03□□□□□ -1.6
CCR6-202ENST00000349984 NDUFA1O15239 70 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 LENEPQ9Y5L5 61 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 H0YGX0 51 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 MED14OSP0DP75 135 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 C20orf203Q8NBC4 194 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 ORMDL1Q9P0S3 153 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 MUC4Q99102 2169 aa5.02□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 HCG22E2RYF7 251 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 CXCL6P80162 114 aa5.01□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 SACSQ9NZJ4 4579 aa5□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa5□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 M0QY20 66 aa5□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 C9orf66Q5T8R8 295 aa5□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 Q9H8V8 135 aa5□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 LECT2O14960 151 aa4.99□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 PSCAO43653 123 aa4.99□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 LINC00313P59037 77 aa4.98□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa4.98□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 BPY2O14599 106 aa4.98□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 CRPP02741 224 aa4.98□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 Q6ZTI0 123 aa4.98□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 RYR2Q92736 4967 aa4.98□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 IGLV1-51P01701 117 aa4.98□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 HAMPP81172 84 aa4.98□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 LINC01554Q52M75 96 aa4.98□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.97□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 FAM104AQ969W3 186 aa4.97□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 FRAS1Q86XX4 4008 aa4.97□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 K7EQG2 157 aa4.97□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 SLPIP03973 132 aa4.97□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa4.97□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 USMG5Q96IX5 58 aa4.97□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa4.96□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 OCR1Q9BZK8 76 aa4.96□□□□□ -1.61
CCR6-202ENST00000349984 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa4.96□□□□□ -1.62
CCR6-202ENST00000349984 LINC00337Q8N6G1 96 aa4.96□□□□□ -1.62
CCR6-202ENST00000349984 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa4.96□□□□□ -1.62
CCR6-202ENST00000349984 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CCR6-202ENST00000349984 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CCR6-202ENST00000349984 LINC00167Q96N53 147 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-202ENST00000349984 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-202ENST00000349984 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa4.95□□□□□ -1.62
CCR6-202ENST00000349984 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CCR6-202ENST00000349984 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.9 ms