RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 MPLKIPQ8TAP9 179 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRU-201ENST00000345512 LINC01600Q96MT4 127 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRU-201ENST00000345512 CELA1Q9UNI1 258 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRU-201ENST00000345512 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRU-201ENST00000345512 CHD6Q8TD26 2715 aa10.68□□□□□ -0.7
PTPRU-201ENST00000345512 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
PTPRU-201ENST00000345512 PLAC8L1A1L4L8 177 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRU-201ENST00000345512 NDUFC1O43677 76 aa10.67□□□□□ -0.7
PTPRU-201ENST00000345512 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRU-201ENST00000345512 OXLD1Q5BKU9 147 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRU-201ENST00000345512 WFDC10BQ8IUB3 73 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRU-201ENST00000345512 HIGD2AQ9BW72 106 aa10.66□□□□□ -0.7
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PTPRU-201ENST00000345512 BRK1Q8WUW1 75 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRU-201ENST00000345512 DCHS1Q96JQ0 3298 aa10.66□□□□□ -0.7
PTPRU-201ENST00000345512 LYPD5Q6UWN5 251 aa10.65□□□□□ -0.7
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PTPRU-201ENST00000345512 ASPMQ8IZT6 3477 aa10.65□□□□□ -0.7
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PTPRU-201ENST00000345512 F8P00451 2351 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRU-201ENST00000345512 CFAP46Q8IYW2 2715 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRU-201ENST00000345512 DMDP11532 3685 aa10.63□□□□□ -0.71
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PTPRU-201ENST00000345512 SPATA3Q8NHX4 192 aa10.62□□□□□ -0.71
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PTPRU-201ENST00000345512 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRU-201ENST00000345512 C6orf48Q9UBA6 75 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRU-201ENST00000345512 SERP1Q9Y6X1 66 aa10.61□□□□□ -0.71
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PTPRU-201ENST00000345512 SMIM26A0A096LP01 95 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRU-201ENST00000345512 A0A0J9YWU9 116 aa10.58□□□□□ -0.72
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PTPRU-201ENST00000345512 FAM30AQ9NZY2 134 aa10.58□□□□□ -0.72
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PTPRU-201ENST00000345512 ITPR1Q14643 2758 aa10.57□□□□□ -0.72
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PTPRU-201ENST00000345512 C2orf48Q96LS8 159 aa10.54□□□□□ -0.72
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PTPRU-201ENST00000345512 A0A0U1RQV1 116 aa10.52□□□□□ -0.72
PTPRU-201ENST00000345512 H0Y9J4 135 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRU-201ENST00000345512 NDUFB1O75438 58 aa10.52□□□□□ -0.73
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PTPRU-201ENST00000345512 IGLV6-57P01721 117 aa10.51□□□□□ -0.73
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PTPRU-201ENST00000345512 C4orf26Q17RF5 130 aa10.51□□□□□ -0.73
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PTPRU-201ENST00000345512 PRYO14603 147 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRU-201ENST00000345512 Q8NAQ8 132 aa10.5□□□□□ -0.73
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PTPRU-201ENST00000345512 LAMA5O15230 3695 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRU-201ENST00000345512 LRCOL1A6NCL2 159 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRU-201ENST00000345512 TM2D3Q9BRN9 247 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRU-201ENST00000345512 BCE1O60756 84 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRU-201ENST00000345512 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
PTPRU-201ENST00000345512 ESRGQ1W209 222 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRU-201ENST00000345512 LINC00612Q8N6U2 182 aa10.47□□□□□ -0.73
PTPRU-201ENST00000345512 C7orf33Q8WU49 177 aa10.47□□□□□ -0.73
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PTPRU-201ENST00000345512 ZANQ9Y493 2812 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRU-201ENST00000345512 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRU-201ENST00000345512 VPREB1P12018 145 aa10.43□□□□□ -0.74
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PTPRU-201ENST00000345512 LINC00167Q96N53 147 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRU-201ENST00000345512 RELNP78509 3460 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRU-201ENST00000345512 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
PTPRU-201ENST00000345512 REG3GQ6UW15 175 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRU-201ENST00000345512 F8WDY8 70 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRU-201ENST00000345512 PRR34Q9NV39 138 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRU-201ENST00000345512 M0R2N4 97 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRU-201ENST00000345512 LINC01556Q5JQF7 62 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRU-201ENST00000345512 C14orf177Q52M58 125 aa10.4□□□□□ -0.75
PTPRU-201ENST00000345512 Q6ZRP5 223 aa10.39□□□□□ -0.75
PTPRU-201ENST00000345512 SMIM29Q86T20 159 aa10.39□□□□□ -0.75
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