RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324659.12

NLRC3-201, Transcript of NLR family CARD domain containing 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NLRC3, Length 3,414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3-201ENST00000324659 IGLV1-51P01701 117 aa8.37□□□□□ -1.07
NLRC3-201ENST00000324659 PDZD2O15018 2839 aa8.37□□□□□ -1.07
NLRC3-201ENST00000324659 UBL5Q9BZL1 73 aa8.37□□□□□ -1.07
NLRC3-201ENST00000324659 PRO0628Q9UI54 55 aa8.37□□□□□ -1.07
NLRC3-201ENST00000324659 Q8N3U1 123 aa8.36□□□□□ -1.07
NLRC3-201ENST00000324659 SPATA3Q8NHX4 192 aa8.36□□□□□ -1.07
NLRC3-201ENST00000324659 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa8.36□□□□□ -1.07
NLRC3-201ENST00000324659 F8WDY8 70 aa8.36□□□□□ -1.07
NLRC3-201ENST00000324659 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
NLRC3-201ENST00000324659 COL6A5A8TX70 2615 aa8.36□□□□□ -1.07
NLRC3-201ENST00000324659 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
NLRC3-201ENST00000324659 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.35□□□□□ -1.07
NLRC3-201ENST00000324659 RMI2Q96E14 147 aa8.35□□□□□ -1.07
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NLRC3-201ENST00000324659 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.35□□□□□ -1.07
NLRC3-201ENST00000324659 MGAM2Q2M2H8 2515 aa8.34□□□□□ -1.07
NLRC3-201ENST00000324659 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.34□□□□□ -1.07
NLRC3-201ENST00000324659 SS18Q15532 418 aa8.34□□□□□ -1.07
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NLRC3-201ENST00000324659 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.33□□□□□ -1.08
NLRC3-201ENST00000324659 KRTAP10-3P60369 221 aa8.33□□□□□ -1.08
NLRC3-201ENST00000324659 F8WEM9 126 aa8.33□□□□□ -1.08
NLRC3-201ENST00000324659 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.33□□□□□ -1.08
NLRC3-201ENST00000324659 V9GYY9 64 aa8.32□□□□□ -1.08
NLRC3-201ENST00000324659 SCXQ7RTU7 201 aa8.32□□□□□ -1.08
NLRC3-201ENST00000324659 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8.32□□□□□ -1.08
NLRC3-201ENST00000324659 SERP1Q9Y6X1 66 aa8.32□□□□□ -1.08
NLRC3-201ENST00000324659 DAD1P61803 113 aa8.31□□□□□ -1.08
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NLRC3-201ENST00000324659 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.29□□□□□ -1.08
NLRC3-201ENST00000324659 C16orf95Q9H693 158 aa8.29□□□□□ -1.08
NLRC3-201ENST00000324659 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.28□□□□□ -1.08
NLRC3-201ENST00000324659 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.28□□□□□ -1.08
NLRC3-201ENST00000324659 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.28□□□□□ -1.08
NLRC3-201ENST00000324659 C6orf99Q4VX62 202 aa8.28□□□□□ -1.08
NLRC3-201ENST00000324659 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
NLRC3-201ENST00000324659 C9orf66Q5T8R8 295 aa8.27□□□□□ -1.09
NLRC3-201ENST00000324659 Q8IZM0 81 aa8.27□□□□□ -1.09
NLRC3-201ENST00000324659 SMIM26A0A096LP01 95 aa8.27□□□□□ -1.09
NLRC3-201ENST00000324659 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
NLRC3-201ENST00000324659 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.27□□□□□ -1.09
NLRC3-201ENST00000324659 C6orf223Q8N319 242 aa8.26□□□□□ -1.09
NLRC3-201ENST00000324659 Q8N814 137 aa8.26□□□□□ -1.09
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NLRC3-201ENST00000324659 Q8NDZ9 215 aa8.26□□□□□ -1.09
NLRC3-201ENST00000324659 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.26□□□□□ -1.09
NLRC3-201ENST00000324659 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
NLRC3-201ENST00000324659 PRO0255Q9UI72 69 aa8.26□□□□□ -1.09
NLRC3-201ENST00000324659 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.25□□□□□ -1.09
NLRC3-201ENST00000324659 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8.25□□□□□ -1.09
NLRC3-201ENST00000324659 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa8.25□□□□□ -1.09
NLRC3-201ENST00000324659 M0R2N4 97 aa8.24□□□□□ -1.09
NLRC3-201ENST00000324659 REG3AQ06141 175 aa8.24□□□□□ -1.09
NLRC3-201ENST00000324659 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.24□□□□□ -1.09
NLRC3-201ENST00000324659 C1orf195Q5TG92 126 aa8.24□□□□□ -1.09
NLRC3-201ENST00000324659 C10orf25Q5T742 122 aa8.23□□□□□ -1.09
NLRC3-201ENST00000324659 X6R8D5 127 aa8.23□□□□□ -1.09
NLRC3-201ENST00000324659 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
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NLRC3-201ENST00000324659 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.23□□□□□ -1.09
NLRC3-201ENST00000324659 RETNQ9HD89 108 aa8.23□□□□□ -1.09
NLRC3-201ENST00000324659 A0A1B0GUV1 79 aa8.22□□□□□ -1.09
NLRC3-201ENST00000324659 APOC4P55056 127 aa8.22□□□□□ -1.09
NLRC3-201ENST00000324659 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
NLRC3-201ENST00000324659 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.22□□□□□ -1.09
NLRC3-201ENST00000324659 TM2D3Q9BRN9 247 aa8.22□□□□□ -1.09
NLRC3-201ENST00000324659 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
NLRC3-201ENST00000324659 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.2□□□□□ -1.1
NLRC3-201ENST00000324659 KLK12Q9UKR0 248 aa8.2□□□□□ -1.1
NLRC3-201ENST00000324659 CELA1Q9UNI1 258 aa8.2□□□□□ -1.1
NLRC3-201ENST00000324659 SPAG11BQ08648 103 aa8.2□□□□□ -1.1
NLRC3-201ENST00000324659 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.2□□□□□ -1.1
NLRC3-201ENST00000324659 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
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NLRC3-201ENST00000324659 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
NLRC3-201ENST00000324659 SPART-AS1P0CW21 52 aa8.17□□□□□ -1.1
NLRC3-201ENST00000324659 MIFP14174 115 aa8.17□□□□□ -1.1
NLRC3-201ENST00000324659 CYSRT1A8MQ03 144 aa8.17□□□□□ -1.1
NLRC3-201ENST00000324659 Q8N9L7 120 aa8.17□□□□□ -1.1
NLRC3-201ENST00000324659 KLKP1Q107X0 134 aa8.17□□□□□ -1.1
NLRC3-201ENST00000324659 Q6ZQY7 126 aa8.17□□□□□ -1.1
NLRC3-201ENST00000324659 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.17□□□□□ -1.1
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NLRC3-201ENST00000324659 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.16□□□□□ -1.1
NLRC3-201ENST00000324659 LINC00167Q96N53 147 aa8.16□□□□□ -1.1
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NLRC3-201ENST00000324659 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.15□□□□□ -1.1
NLRC3-201ENST00000324659 Q6ZQT0 140 aa8.15□□□□□ -1.11
NLRC3-201ENST00000324659 NREPQ16612 68 aa8.13□□□□□ -1.11
NLRC3-201ENST00000324659 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa8.13□□□□□ -1.11
NLRC3-201ENST00000324659 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.13□□□□□ -1.11
NLRC3-201ENST00000324659 TMEM254Q8TBM7 123 aa8.13□□□□□ -1.11
NLRC3-201ENST00000324659 LYRM9A8MSI8 78 aa8.12□□□□□ -1.11
NLRC3-201ENST00000324659 BAHCC1Q9P281 2608 aa8.12□□□□□ -1.11
NLRC3-201ENST00000324659 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.11□□□□□ -1.11
NLRC3-201ENST00000324659 BPY2O14599 106 aa8.11□□□□□ -1.11
NLRC3-201ENST00000324659 EPM2AB3EWF7 344 aa8.1□□□□□ -1.11
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