RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299687.9

ZNF407-201, Transcript of zinc finger protein 407, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF407, Length 7,948 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF407-201ENST00000299687 CRIPTQ9P021 101 aa8.67□□□□□ -1.02
ZNF407-201ENST00000299687 KIAA0087Q14695 138 aa8.67□□□□□ -1.02
ZNF407-201ENST00000299687 PCSK5Q92824 1860 aa8.66□□□□□ -1.02
ZNF407-201ENST00000299687 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.66□□□□□ -1.02
ZNF407-201ENST00000299687 LINC00846Q9NV44 126 aa8.66□□□□□ -1.02
ZNF407-201ENST00000299687 Q6ZRU5 148 aa8.66□□□□□ -1.02
ZNF407-201ENST00000299687 CENPFP49454 3210 aa8.65□□□□□ -1.02
ZNF407-201ENST00000299687 TRAV22A0A0B4J277 110 aa8.63□□□□□ -1.03
ZNF407-201ENST00000299687 Q6ZRP5 223 aa8.63□□□□□ -1.03
ZNF407-201ENST00000299687 APLNQ9ULZ1 77 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF407-201ENST00000299687 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF407-201ENST00000299687 NCOR2Q9Y618 2525 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF407-201ENST00000299687 Q96NJ1 140 aa8.61□□□□□ -1.03
ZNF407-201ENST00000299687 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.61□□□□□ -1.03
ZNF407-201ENST00000299687 MTORP42345 2549 aa8.61□□□□□ -1.03
ZNF407-201ENST00000299687 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF407-201ENST00000299687 AMELXQ99217 191 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF407-201ENST00000299687 AVPP01185 164 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF407-201ENST00000299687 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
ZNF407-201ENST00000299687 Q8NBF4 154 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF407-201ENST00000299687 SPTBN4Q9H254 2564 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF407-201ENST00000299687 PCNTO95613 3336 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF407-201ENST00000299687 A0A1B0GW54 56 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF407-201ENST00000299687 Q6ZPA2 131 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF407-201ENST00000299687 SPATA3Q8NHX4 192 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF407-201ENST00000299687 LINC01600Q96MT4 127 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF407-201ENST00000299687 IGF2RP11717 2491 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF407-201ENST00000299687 RTL8CO15255 209 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF407-201ENST00000299687 CHTF8P0CG12 524 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF407-201ENST00000299687 ZNF580Q9UK33 172 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF407-201ENST00000299687 H3BPC8 53 aa8.57□□□□□ -1.04
ZNF407-201ENST00000299687 C4orf26Q17RF5 130 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF407-201ENST00000299687 KRTAP10-9P60411 292 aa8.56□□□□□ -1.04
ZNF407-201ENST00000299687 COL4A3Q01955 1670 aa8.55□□□□□ -1.04
ZNF407-201ENST00000299687 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
ZNF407-201ENST00000299687 LINC00167Q96N53 147 aa8.54□□□□□ -1.04
ZNF407-201ENST00000299687 CR1P17927 2039 aa8.53□□□□□ -1.04
ZNF407-201ENST00000299687 Q6ZSN1 163 aa8.53□□□□□ -1.04
ZNF407-201ENST00000299687 USP24Q9UPU5 2620 aa8.52□□□□□ -1.05
ZNF407-201ENST00000299687 LUZP6Q538Z0 58 aa8.52□□□□□ -1.05
ZNF407-201ENST00000299687 EPM2AB3EWF7 344 aa8.51□□□□□ -1.05
ZNF407-201ENST00000299687 UQCR11O14957 56 aa8.51□□□□□ -1.05
ZNF407-201ENST00000299687 POLQO75417 2590 aa8.51□□□□□ -1.05
ZNF407-201ENST00000299687 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
ZNF407-201ENST00000299687 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.51□□□□□ -1.05
ZNF407-201ENST00000299687 EP400Q96L91 3159 aa8.5□□□□□ -1.05
ZNF407-201ENST00000299687 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ZNF407-201ENST00000299687 H3BNG1 76 aa8.5□□□□□ -1.05
ZNF407-201ENST00000299687 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ZNF407-201ENST00000299687 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa8.5□□□□□ -1.05
ZNF407-201ENST00000299687 CDSNQ15517 529 aa8.49□□□□□ -1.05
ZNF407-201ENST00000299687 C11orf72Q8NBR9 251 aa8.49□□□□□ -1.05
ZNF407-201ENST00000299687 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF407-201ENST00000299687 CDIP1Q9H305 208 aa8.48□□□□□ -1.05
ZNF407-201ENST00000299687 LINC00315P59091 139 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF407-201ENST00000299687 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF407-201ENST00000299687 BCE1O60756 84 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF407-201ENST00000299687 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF407-201ENST00000299687 LINC01554Q52M75 96 aa8.47□□□□□ -1.05
ZNF407-201ENST00000299687 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
ZNF407-201ENST00000299687 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF407-201ENST00000299687 CRIP3Q6Q6R5 217 aa8.45□□□□□ -1.06
ZNF407-201ENST00000299687 RPS28P62857 69 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
ZNF407-201ENST00000299687 MIR22HGQ0VDD5 57 aa8.44□□□□□ -1.06
ZNF407-201ENST00000299687 Q6ZRX8 168 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF407-201ENST00000299687 IGLV6-57P01721 117 aa8.43□□□□□ -1.06
ZNF407-201ENST00000299687 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
ZNF407-201ENST00000299687 TM2D3Q9BRN9 247 aa8.42□□□□□ -1.06
ZNF407-201ENST00000299687 COX8CQ7Z4L0 72 aa8.41□□□□□ -1.06
ZNF407-201ENST00000299687 COA5Q86WW8 74 aa8.41□□□□□ -1.06
ZNF407-201ENST00000299687 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.41□□□□□ -1.06
ZNF407-201ENST00000299687 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa8.41□□□□□ -1.06
ZNF407-201ENST00000299687 Q6ZQT0 140 aa8.4□□□□□ -1.06
ZNF407-201ENST00000299687 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.39□□□□□ -1.07
ZNF407-201ENST00000299687 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.39□□□□□ -1.07
ZNF407-201ENST00000299687 A8MWP4 228 aa8.39□□□□□ -1.07
ZNF407-201ENST00000299687 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ZNF407-201ENST00000299687 LINC00304Q8N9R0 145 aa8.39□□□□□ -1.07
ZNF407-201ENST00000299687 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.38□□□□□ -1.07
ZNF407-201ENST00000299687 PRO3102Q9H379 93 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF407-201ENST00000299687 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.37□□□□□ -1.07
ZNF407-201ENST00000299687 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
ZNF407-201ENST00000299687 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.36□□□□□ -1.07
ZNF407-201ENST00000299687 CHD8Q9HCK8 2581 aa8.36□□□□□ -1.07
ZNF407-201ENST00000299687 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa8.35□□□□□ -1.07
ZNF407-201ENST00000299687 LINC00310P59036 64 aa8.35□□□□□ -1.07
ZNF407-201ENST00000299687 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa8.35□□□□□ -1.07
ZNF407-201ENST00000299687 K7EQZ3 153 aa8.35□□□□□ -1.07
ZNF407-201ENST00000299687 C9orf92A6NGG3 77 aa8.34□□□□□ -1.07
ZNF407-201ENST00000299687 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
ZNF407-201ENST00000299687 FASNP49327 2511 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
ZNF407-201ENST00000299687 A0A0D9SG42 100 aa8.34□□□□□ -1.07
ZNF407-201ENST00000299687 A8MUN3 132 aa8.34□□□□□ -1.07
ZNF407-201ENST00000299687 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.33□□□□□ -1.08
ZNF407-201ENST00000299687 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.32□□□□□ -1.08
ZNF407-201ENST00000299687 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.31□□□□□ -1.08
ZNF407-201ENST00000299687 FAM218AQ96MZ4 157 aa8.31□□□□□ -1.08
ZNF407-201ENST00000299687 A0A096LNJ9 63 aa8.31□□□□□ -1.08
ZNF407-201ENST00000299687 DSCR10P59022 87 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF407-201ENST00000299687 ERC2-IT1O76042 136 aa8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms