RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227667.7

APOC3-201, Transcript of apolipoprotein C3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOC3, Length 550 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3-201ENST00000227667 HIST1H4GQ99525 98 aa6.91□□□□□ -1.3
APOC3-201ENST00000227667 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.91□□□□□ -1.3
APOC3-201ENST00000227667 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.91□□□□□ -1.3
APOC3-201ENST00000227667 A0A1B0GWB2 263 aa6.9□□□□□ -1.3
APOC3-201ENST00000227667 TMEM238C9JI98 176 aa6.9□□□□□ -1.3
APOC3-201ENST00000227667 APOMO95445 188 aa6.9□□□□□ -1.3
APOC3-201ENST00000227667 MALP21145 153 aa6.9□□□□□ -1.3
APOC3-201ENST00000227667 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.9□□□□□ -1.3
APOC3-201ENST00000227667 Q6ZVH6 145 aa6.9□□□□□ -1.3
APOC3-201ENST00000227667 LINC01600Q96MT4 127 aa6.9□□□□□ -1.3
APOC3-201ENST00000227667 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.9□□□□□ -1.3
APOC3-201ENST00000227667 CXCL5P42830 114 aa6.89□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 BATFQ16520 125 aa6.89□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.89□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 C15orf56Q8N910 161 aa6.89□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 RMI2Q96E14 147 aa6.89□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.88□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 A0A0U1RQV1 116 aa6.88□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 PRSS2P07478 247 aa6.88□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 SPAG11BQ08648 103 aa6.88□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.88□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 C2orf82Q6UX34 121 aa6.88□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 SMIM13P0DJ93 91 aa6.87□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 IFITM1P13164 125 aa6.87□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.87□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 TAX1BP3O14907 124 aa6.86□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 C14orf177Q52M58 125 aa6.86□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 C10orf25Q5T742 122 aa6.86□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.86□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 ERG28Q9UKR5 140 aa6.86□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.85□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 A6NDN8 102 aa6.85□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 F8WDY8 70 aa6.85□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 CKS1BP61024 79 aa6.85□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 COX17Q14061 63 aa6.85□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.85□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 CFAP161Q6P656 301 aa6.85□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.85□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.85□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.85□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 C2orf48Q96LS8 159 aa6.85□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 A4D1N5 150 aa6.84□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 PANO1I0J062 215 aa6.84□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 CFC1BP0CG36 223 aa6.84□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 CFC1P0CG37 223 aa6.84□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 DAND5Q8N907 189 aa6.84□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.84□□□□□ -1.31
APOC3-201ENST00000227667 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.83□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 A6NJY4 79 aa6.83□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 KRTAP10-8P60410 259 aa6.83□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.83□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.83□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 DPH3Q96FX2 82 aa6.83□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.83□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 A0A0B4J2C4 111 aa6.82□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.82□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 A0A0U1RRA0 63 aa6.82□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.82□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 K7ERJ3 54 aa6.82□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 USP17L23D6RBM5 183 aa6.81□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 SLPIP03973 132 aa6.81□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 PFN2P35080 140 aa6.81□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 LINC00158P58513 81 aa6.81□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.81□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 A0A1B0GV90 55 aa6.8□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 C9orf118A6NHY6 69 aa6.8□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 NPC2P61916 151 aa6.8□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 COPS9Q8WXC6 57 aa6.8□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.8□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 RNF151Q2KHN1 245 aa6.79□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.79□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.78□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.78□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 SYCNQ0VAF6 134 aa6.78□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 RAB37Q96AX2 223 aa6.78□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.78□□□□□ -1.32
APOC3-201ENST00000227667 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.77□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 IGKV2D-28P01615 120 aa6.77□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 REG3GQ6UW15 175 aa6.77□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 C7orf33Q8WU49 177 aa6.77□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.77□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 A0A087WYN8 130 aa6.76□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 NDUFC2O95298 119 aa6.76□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 TSPAN13O95857 204 aa6.76□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 Q8NDZ9 215 aa6.76□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.75□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 H3BUT2 72 aa6.75□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 CARD19Q96LW7 228 aa6.75□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 A0A1W2PPM0 123 aa6.74□□□□□ -1.33
APOC3-201ENST00000227667 Q6ZRP5 223 aa6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms