RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-201ENST00000220888 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-201ENST00000220888 CDIP1Q9H305 208 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-201ENST00000220888 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-201ENST00000220888 Q96NJ1 140 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-201ENST00000220888 A0A1B0GU69 56 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-201ENST00000220888 ACYP2P14621 99 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-201ENST00000220888 EPM2AB3EWF7 344 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-201ENST00000220888 MTORP42345 2549 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-201ENST00000220888 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-201ENST00000220888 CCDC179H3BU77 68 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-201ENST00000220888 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-201ENST00000220888 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-201ENST00000220888 PSPHP1O15172 72 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-201ENST00000220888 PTPRSQ13332 1948 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-201ENST00000220888 LRP4O75096 1905 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-201ENST00000220888 C1orf195Q5TG92 126 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-201ENST00000220888 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-201ENST00000220888 BCE1O60756 84 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-201ENST00000220888 POLQO75417 2590 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-201ENST00000220888 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-201ENST00000220888 YPEL4Q96NS1 127 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-201ENST00000220888 CXCL6P80162 114 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-201ENST00000220888 Q8NAQ8 132 aa7.23□□□□□ -1.25
TRPS1-201ENST00000220888 SMIM29Q86T20 159 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-201ENST00000220888 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-201ENST00000220888 CEP295Q9C0D2 2601 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-201ENST00000220888 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-201ENST00000220888 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.22□□□□□ -1.25
TRPS1-201ENST00000220888 Q6ZRX8 168 aa7.21□□□□□ -1.25
TRPS1-201ENST00000220888 LINC00476Q8WZB0 136 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-201ENST00000220888 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-201ENST00000220888 LINC00846Q9NV44 126 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-201ENST00000220888 Q9UF83 564 aa7.21□□□□□ -1.26
TRPS1-201ENST00000220888 A0A1B0GW54 56 aa7.2□□□□□ -1.26
TRPS1-201ENST00000220888 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-201ENST00000220888 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TRPS1-201ENST00000220888 SPTBN4Q9H254 2564 aa7.18□□□□□ -1.26
TRPS1-201ENST00000220888 C8orf87E5RJ46 101 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-201ENST00000220888 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-201ENST00000220888 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-201ENST00000220888 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-201ENST00000220888 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-201ENST00000220888 K7EIL1 84 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-201ENST00000220888 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.17□□□□□ -1.26
TRPS1-201ENST00000220888 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TRPS1-201ENST00000220888 A0A096LNJ9 63 aa7.15□□□□□ -1.26
TRPS1-201ENST00000220888 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.15□□□□□ -1.27
TRPS1-201ENST00000220888 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.14□□□□□ -1.27
TRPS1-201ENST00000220888 H3BPC8 53 aa7.13□□□□□ -1.27
TRPS1-201ENST00000220888 LINC00310P59036 64 aa7.13□□□□□ -1.27
TRPS1-201ENST00000220888 EML5Q05BV3 1969 aa7.13□□□□□ -1.27
TRPS1-201ENST00000220888 ACANP16112 2415 aa7.12□□□□□ -1.27
TRPS1-201ENST00000220888 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.12□□□□□ -1.27
TRPS1-201ENST00000220888 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7.11□□□□□ -1.27
TRPS1-201ENST00000220888 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-201ENST00000220888 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.1□□□□□ -1.27
TRPS1-201ENST00000220888 C9orf92A6NGG3 77 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-201ENST00000220888 KRTAP10-11P60412 298 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-201ENST00000220888 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.09□□□□□ -1.27
TRPS1-201ENST00000220888 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.08□□□□□ -1.28
TRPS1-201ENST00000220888 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.08□□□□□ -1.28
TRPS1-201ENST00000220888 A0A087WTM6 91 aa7.08□□□□□ -1.28
TRPS1-201ENST00000220888 FAM168BA1KXE4 195 aa7.08□□□□□ -1.28
TRPS1-201ENST00000220888 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF861PO60384 105 aa7.07□□□□□ -1.28
TRPS1-201ENST00000220888 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.06□□□□□ -1.28
TRPS1-201ENST00000220888 A8MWP4 228 aa7.06□□□□□ -1.28
TRPS1-201ENST00000220888 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.05□□□□□ -1.28
TRPS1-201ENST00000220888 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
TRPS1-201ENST00000220888 Q6ZQT0 140 aa7.05□□□□□ -1.28
TRPS1-201ENST00000220888 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.05□□□□□ -1.28
TRPS1-201ENST00000220888 APLNQ9ULZ1 77 aa7.05□□□□□ -1.28
TRPS1-201ENST00000220888 DSCR10P59022 87 aa7.04□□□□□ -1.28
TRPS1-201ENST00000220888 VPREB1P12018 145 aa7.04□□□□□ -1.28
TRPS1-201ENST00000220888 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.04□□□□□ -1.28
TRPS1-201ENST00000220888 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.04□□□□□ -1.28
TRPS1-201ENST00000220888 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.04□□□□□ -1.28
TRPS1-201ENST00000220888 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.03□□□□□ -1.28
TRPS1-201ENST00000220888 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa7.03□□□□□ -1.28
TRPS1-201ENST00000220888 LINC01546A6NGU7 62 aa7.03□□□□□ -1.28
TRPS1-201ENST00000220888 LINC01600Q96MT4 127 aa7.02□□□□□ -1.29
TRPS1-201ENST00000220888 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
TRPS1-201ENST00000220888 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.02□□□□□ -1.29
TRPS1-201ENST00000220888 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.02□□□□□ -1.29
TRPS1-201ENST00000220888 COL4A2P08572 1712 aa7.01□□□□□ -1.29
TRPS1-201ENST00000220888 EPG5Q9HCE0 2579 aa7.01□□□□□ -1.29
TRPS1-201ENST00000220888 IGLV6-57P01721 117 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-201ENST00000220888 C9orf163Q8N9P6 203 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-201ENST00000220888 IGLV7-43P04211 117 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-201ENST00000220888 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-201ENST00000220888 CRIPTQ9P021 101 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-201ENST00000220888 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-201ENST00000220888 LINC01554Q52M75 96 aa6.98□□□□□ -1.29
TRPS1-201ENST00000220888 M0R2T5 61 aa6.97□□□□□ -1.29
TRPS1-201ENST00000220888 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.97□□□□□ -1.29
TRPS1-201ENST00000220888 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.97□□□□□ -1.29
TRPS1-201ENST00000220888 K7EQZ3 153 aa6.96□□□□□ -1.3
TRPS1-201ENST00000220888 PTPRBP23467 1997 aa6.96□□□□□ -1.3
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