RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640501.1

PNKP-231, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 5

Gene PNKP, Length 151 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-231	ENST00000640501	TCL1B	O95988	128 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501		Q6ZTC4	211 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	DAND5	Q8N907	189 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	VPS25	Q9BRG1	176 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	RETN	Q9HD89	108 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	PRR34	Q9NV39	138 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	KLK12	Q9UKR0	248 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501		F8WDY8	70 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	TRIAP1	O43715	76 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	SLC25A20	O43772	301 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	SNCG	O76070	127 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	PFN2	P35080	140 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	RNF151	Q2KHN1	245 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	UBE2W	Q96B02	151 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501		C9JAW5	83 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501		H3BT86	120 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	SPAG11B	Q08648	103 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	FOXI1	Q12951	378 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	WFDC2	Q14508	124 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	LINC01620	Q4KN68	170 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	TEN1	Q86WV5	123 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	CARD19	Q96LW7	228 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	MAST4	O15021	2626 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501		H0YGX0	51 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	LST1	O00453	97 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	NDUFC2	O95298	119 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	CCL18	P55774	89 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	ETDB	Q3ZM63	59 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	RMI2	Q96E14	147 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	PRO0461	Q9UI25	63 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	TRAC	P01848	142 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	STAB1	Q9NY15	2570 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501		K7EIL1	84 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	DNAL4	O96015	105 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	KIAA0087	Q14695	138 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	ENHO	Q6UWT2	76 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	C2orf82	Q6UX34	121 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	LINC01600	Q96MT4	127 aa		5.65	□□□□□ -1.5
PNKP-231	ENST00000640501	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PNKP-231	ENST00000640501	ESRG	Q1W209	222 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PNKP-231	ENST00000640501	C2orf48	Q96LS8	159 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PNKP-231	ENST00000640501	TMEM126A	Q9H061	195 aa		5.64	□□□□□ -1.51
PNKP-231	ENST00000640501	MTURN	Q8N3F0	131 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PNKP-231	ENST00000640501	MRAP	Q8TCY5	172 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PNKP-231	ENST00000640501	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		5.63	□□□□□ -1.51
PNKP-231	ENST00000640501		A0A1B0GX51	115 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PNKP-231	ENST00000640501	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PNKP-231	ENST00000640501	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PNKP-231	ENST00000640501		Q8N3U1	123 aa		5.62	□□□□□ -1.51
PNKP-231	ENST00000640501	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	5.62	□□□□□ -1.51
PNKP-231	ENST00000640501	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
PNKP-231	ENST00000640501	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PNKP-231	ENST00000640501	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PNKP-231	ENST00000640501	GHRH	P01286	108 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PNKP-231	ENST00000640501	IGKV2D-28	P01615	120 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PNKP-231	ENST00000640501	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	5.61	□□□□□ -1.51
PNKP-231	ENST00000640501	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	5.61	□□□□□ -1.51
PNKP-231	ENST00000640501	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PNKP-231	ENST00000640501	CLEC2B	Q92478	149 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PNKP-231	ENST00000640501	COL6A5	A8TX70	2615 aa		5.61	□□□□□ -1.51
PNKP-231	ENST00000640501	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		5.6	□□□□□ -1.51
PNKP-231	ENST00000640501	B9D2	Q9BPU9	175 aa		5.6	□□□□□ -1.51
PNKP-231	ENST00000640501	UPK3B	Q9BT76	320 aa		5.6	□□□□□ -1.51
PNKP-231	ENST00000640501	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		5.59	□□□□□ -1.51
PNKP-231	ENST00000640501		H3BQ85	93 aa		5.59	□□□□□ -1.51
PNKP-231	ENST00000640501	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	5.59	□□□□□ -1.51
PNKP-231	ENST00000640501	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		5.59	□□□□□ -1.51
PNKP-231	ENST00000640501	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		5.59	□□□□□ -1.51
PNKP-231	ENST00000640501	ACYP1	P07311	99 aa		5.58	□□□□□ -1.52
PNKP-231	ENST00000640501	SIGMAR1	Q99720	223 aa		5.58	□□□□□ -1.52
PNKP-231	ENST00000640501	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		5.57	□□□□□ -1.52
PNKP-231	ENST00000640501	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		5.57	□□□□□ -1.52
PNKP-231	ENST00000640501	SYCN	Q0VAF6	134 aa		5.57	□□□□□ -1.52
PNKP-231	ENST00000640501	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		5.57	□□□□□ -1.52
PNKP-231	ENST00000640501	C6orf223	Q8N319	242 aa		5.57	□□□□□ -1.52
PNKP-231	ENST00000640501	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		5.57	□□□□□ -1.52
PNKP-231	ENST00000640501	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		5.56	□□□□□ -1.52
PNKP-231	ENST00000640501	NUPR2	A6NF83	97 aa		5.56	□□□□□ -1.52

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