RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639956.1

SPIN3-232, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,998 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-232ENST00000639956 KRTAP1-1Q07627 177 aa8.71□□□□□ -1.02
SPIN3-232ENST00000639956 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.71□□□□□ -1.02
SPIN3-232ENST00000639956 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
SPIN3-232ENST00000639956 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SPIN3-232ENST00000639956 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.7□□□□□ -1.02
SPIN3-232ENST00000639956 LECT2O14960 151 aa8.7□□□□□ -1.02
SPIN3-232ENST00000639956 DNAL4O96015 105 aa8.7□□□□□ -1.02
SPIN3-232ENST00000639956 KRTAP10-3P60369 221 aa8.7□□□□□ -1.02
SPIN3-232ENST00000639956 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SPIN3-232ENST00000639956 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.7□□□□□ -1.02
SPIN3-232ENST00000639956 DEFB135Q30KP9 77 aa8.69□□□□□ -1.02
SPIN3-232ENST00000639956 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa8.69□□□□□ -1.02
SPIN3-232ENST00000639956 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa8.69□□□□□ -1.02
SPIN3-232ENST00000639956 C22orf24Q9Y442 160 aa8.68□□□□□ -1.02
SPIN3-232ENST00000639956 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.68□□□□□ -1.02
SPIN3-232ENST00000639956 COPS9Q8WXC6 57 aa8.68□□□□□ -1.02
SPIN3-232ENST00000639956 FAM222AQ5U5X8 452 aa8.67□□□□□ -1.02
SPIN3-232ENST00000639956 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.67□□□□□ -1.02
SPIN3-232ENST00000639956 NCR3O14931 201 aa8.67□□□□□ -1.02
SPIN3-232ENST00000639956 MALP21145 153 aa8.67□□□□□ -1.02
SPIN3-232ENST00000639956 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.67□□□□□ -1.02
SPIN3-232ENST00000639956 OVOL2Q9BRP0 275 aa8.67□□□□□ -1.02
SPIN3-232ENST00000639956 A0A087WZ39 114 aa8.65□□□□□ -1.02
SPIN3-232ENST00000639956 TRACP01848 142 aa8.65□□□□□ -1.02
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SPIN3-232ENST00000639956 HIVEP1P15822 2718 aa8.64□□□□□ -1.03
SPIN3-232ENST00000639956 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa8.64□□□□□ -1.03
SPIN3-232ENST00000639956 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SPIN3-232ENST00000639956 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa8.64□□□□□ -1.03
SPIN3-232ENST00000639956 SS18Q15532 418 aa8.64□□□□□ -1.03
SPIN3-232ENST00000639956 LINC01600Q96MT4 127 aa8.64□□□□□ -1.03
SPIN3-232ENST00000639956 DEFB121Q5J5C9 76 aa8.63□□□□□ -1.03
SPIN3-232ENST00000639956 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.63□□□□□ -1.03
SPIN3-232ENST00000639956 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
SPIN3-232ENST00000639956 X6R8D5 127 aa8.62□□□□□ -1.03
SPIN3-232ENST00000639956 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.61□□□□□ -1.03
SPIN3-232ENST00000639956 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa8.61□□□□□ -1.03
SPIN3-232ENST00000639956 HILS1P60008 231 aa8.61□□□□□ -1.03
SPIN3-232ENST00000639956 C6orf223Q8N319 242 aa8.61□□□□□ -1.03
SPIN3-232ENST00000639956 PRO0255Q9UI72 69 aa8.61□□□□□ -1.03
SPIN3-232ENST00000639956 Q6Q795 121 aa8.6□□□□□ -1.03
SPIN3-232ENST00000639956 C16orf95Q9H693 158 aa8.6□□□□□ -1.03
SPIN3-232ENST00000639956 CELA1Q9UNI1 258 aa8.6□□□□□ -1.03
SPIN3-232ENST00000639956 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SPIN3-232ENST00000639956 A0A087WVE0 104 aa8.59□□□□□ -1.03
SPIN3-232ENST00000639956 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SPIN3-232ENST00000639956 CFAP161Q6P656 301 aa8.58□□□□□ -1.04
SPIN3-232ENST00000639956 SMIM20Q8N5G0 67 aa8.58□□□□□ -1.04
SPIN3-232ENST00000639956 INAFM1C9JVW0 142 aa8.57□□□□□ -1.04
SPIN3-232ENST00000639956 DAD1P61803 113 aa8.57□□□□□ -1.04
SPIN3-232ENST00000639956 REG3AQ06141 175 aa8.57□□□□□ -1.04
SPIN3-232ENST00000639956 C10orf25Q5T742 122 aa8.57□□□□□ -1.04
SPIN3-232ENST00000639956 LINC00643Q86TS7 51 aa8.57□□□□□ -1.04
SPIN3-232ENST00000639956 Q8NDZ9 215 aa8.57□□□□□ -1.04
SPIN3-232ENST00000639956 LINC00846Q9NV44 126 aa8.57□□□□□ -1.04
SPIN3-232ENST00000639956 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.57□□□□□ -1.04
SPIN3-232ENST00000639956 INAFM2P0DMQ5 153 aa8.57□□□□□ -1.04
SPIN3-232ENST00000639956 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.56□□□□□ -1.04
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SPIN3-232ENST00000639956 LY6G6DO95868 133 aa8.56□□□□□ -1.04
SPIN3-232ENST00000639956 ACYP1P07311 99 aa8.56□□□□□ -1.04
SPIN3-232ENST00000639956 CXCL5P42830 114 aa8.56□□□□□ -1.04
SPIN3-232ENST00000639956 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.56□□□□□ -1.04
SPIN3-232ENST00000639956 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa8.56□□□□□ -1.04
SPIN3-232ENST00000639956 KLK12Q9UKR0 248 aa8.55□□□□□ -1.04
SPIN3-232ENST00000639956 H0YGX0 51 aa8.55□□□□□ -1.04
SPIN3-232ENST00000639956 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SPIN3-232ENST00000639956 FAM110AQ9BQ89 295 aa8.55□□□□□ -1.04
SPIN3-232ENST00000639956 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SPIN3-232ENST00000639956 C6orf99Q4VX62 202 aa8.54□□□□□ -1.04
SPIN3-232ENST00000639956 Q8IZM0 81 aa8.54□□□□□ -1.04
SPIN3-232ENST00000639956 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.53□□□□□ -1.04
SPIN3-232ENST00000639956 ORMDL1Q9P0S3 153 aa8.53□□□□□ -1.04
SPIN3-232ENST00000639956 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
SPIN3-232ENST00000639956 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
SPIN3-232ENST00000639956 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.53□□□□□ -1.04
SPIN3-232ENST00000639956 NOTCH1P46531 2555 aa8.53□□□□□ -1.04
SPIN3-232ENST00000639956 KIAA0087Q14695 138 aa8.52□□□□□ -1.04
SPIN3-232ENST00000639956 A0A1B0GUV1 79 aa8.52□□□□□ -1.05
SPIN3-232ENST00000639956 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.52□□□□□ -1.05
SPIN3-232ENST00000639956 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
SPIN3-232ENST00000639956 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.52□□□□□ -1.05
SPIN3-232ENST00000639956 STAB1Q9NY15 2570 aa8.51□□□□□ -1.05
SPIN3-232ENST00000639956 J3QKU1 62 aa8.51□□□□□ -1.05
SPIN3-232ENST00000639956 SPAG11BQ08648 103 aa8.5□□□□□ -1.05
SPIN3-232ENST00000639956 MAST4O15021 2626 aa8.5□□□□□ -1.05
SPIN3-232ENST00000639956 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.49□□□□□ -1.05
SPIN3-232ENST00000639956 RETNQ9HD89 108 aa8.49□□□□□ -1.05
SPIN3-232ENST00000639956 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.49□□□□□ -1.05
SPIN3-232ENST00000639956 TENM3Q9P273 2699 aa8.49□□□□□ -1.05
SPIN3-232ENST00000639956 CYSRT1A8MQ03 144 aa8.49□□□□□ -1.05
SPIN3-232ENST00000639956 Q8N814 137 aa8.49□□□□□ -1.05
SPIN3-232ENST00000639956 F8P00451 2351 aa8.48□□□□□ -1.05
SPIN3-232ENST00000639956 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SPIN3-232ENST00000639956 TMEM126AQ9H061 195 aa8.47□□□□□ -1.05
SPIN3-232ENST00000639956 C9orf66Q5T8R8 295 aa8.47□□□□□ -1.05
SPIN3-232ENST00000639956 A0A1B0GX51 115 aa8.46□□□□□ -1.05
SPIN3-232ENST00000639956 LYRM9A8MSI8 78 aa8.46□□□□□ -1.05
SPIN3-232ENST00000639956 IMUPQ9GZP8 106 aa8.46□□□□□ -1.06
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