RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC00269Q8N2A0 174 aa15.96■□□□□ 0.15
CAPNS1-216ENST00000628306 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa15.95■□□□□ 0.14
CAPNS1-216ENST00000628306 REG3AQ06141 175 aa15.95■□□□□ 0.14
CAPNS1-216ENST00000628306 FAT3Q8TDW7 4589 aa15.95■□□□□ 0.14
CAPNS1-216ENST00000628306 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC01556Q5JQF7 62 aa15.94■□□□□ 0.14
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A087WZ39 114 aa15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1-216ENST00000628306 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa15.93■□□□□ 0.14
CAPNS1-216ENST00000628306 M0R143 59 aa15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1-216ENST00000628306 TTTY13Q9BZ97 58 aa15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1-216ENST00000628306 UBR4Q5T4S7 5183 aa15.92■□□□□ 0.14
CAPNS1-216ENST00000628306 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa15.91■□□□□ 0.14
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF815PA8K554 130 aa15.91■□□□□ 0.14
CAPNS1-216ENST00000628306 SMIM1B2RUZ4 78 aa15.91■□□□□ 0.14
CAPNS1-216ENST00000628306 CD164L2Q6UWJ8 174 aa15.91■□□□□ 0.14
CAPNS1-216ENST00000628306 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CAPNS1-216ENST00000628306 SPINK8P0C7L1 97 aa15.9■□□□□ 0.14
CAPNS1-216ENST00000628306 TSPEAR-AS2P59090 65 aa15.9■□□□□ 0.14
CAPNS1-216ENST00000628306 C10orf126Q8N4M7 172 aa15.9■□□□□ 0.14
CAPNS1-216ENST00000628306 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CAPNS1-216ENST00000628306 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa15.88■□□□□ 0.13
CAPNS1-216ENST00000628306 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa15.88■□□□□ 0.13
CAPNS1-216ENST00000628306 J3QL48 77 aa15.88■□□□□ 0.13
CAPNS1-216ENST00000628306 TAL2Q16559 108 aa15.88■□□□□ 0.13
CAPNS1-216ENST00000628306 Q8N814 137 aa15.88■□□□□ 0.13
CAPNS1-216ENST00000628306 Q8N3U1 123 aa15.87■□□□□ 0.13
CAPNS1-216ENST00000628306 TP73-AS1Q9UF72 201 aa15.87■□□□□ 0.13
CAPNS1-216ENST00000628306 KLK12Q9UKR0 248 aa15.87■□□□□ 0.13
CAPNS1-216ENST00000628306 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa15.87■□□□□ 0.13
CAPNS1-216ENST00000628306 HSD52Q0P140 79 aa15.87■□□□□ 0.13
CAPNS1-216ENST00000628306 ENHOQ6UWT2 76 aa15.87■□□□□ 0.13
CAPNS1-216ENST00000628306 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CAPNS1-216ENST00000628306 MIAQ16674 131 aa15.86■□□□□ 0.13
CAPNS1-216ENST00000628306 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CAPNS1-216ENST00000628306 Q6ZSA8 131 aa15.85■□□□□ 0.13
CAPNS1-216ENST00000628306 SNHG12Q9BXW3 62 aa15.85■□□□□ 0.13
CAPNS1-216ENST00000628306 NDUFA12Q9UI09 145 aa15.85■□□□□ 0.13
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CAPNS1-216ENST00000628306 IGHV3-30P01768 117 aa15.84■□□□□ 0.13
CAPNS1-216ENST00000628306 IGHV3-33P01772 117 aa15.84■□□□□ 0.13
CAPNS1-216ENST00000628306 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa15.84■□□□□ 0.13
CAPNS1-216ENST00000628306 WFDC2Q14508 124 aa15.84■□□□□ 0.13
CAPNS1-216ENST00000628306 NDUFA1O15239 70 aa15.83■□□□□ 0.12
CAPNS1-216ENST00000628306 XCL1P47992 114 aa15.83■□□□□ 0.12
CAPNS1-216ENST00000628306 SCGB1D4Q6XE38 83 aa15.83■□□□□ 0.12
CAPNS1-216ENST00000628306 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa15.82■□□□□ 0.12
CAPNS1-216ENST00000628306 PSCAO43653 123 aa15.82■□□□□ 0.12
CAPNS1-216ENST00000628306 CRPP02741 224 aa15.82■□□□□ 0.12
CAPNS1-216ENST00000628306 SFTA2Q6UW10 78 aa15.82■□□□□ 0.12
CAPNS1-216ENST00000628306 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
CAPNS1-216ENST00000628306 COX7A2LO14548 114 aa15.81■□□□□ 0.12
CAPNS1-216ENST00000628306 CLPSL2Q6UWE3 100 aa15.81■□□□□ 0.12
CAPNS1-216ENST00000628306 HERV-K104P63124 156 aa15.8■□□□□ 0.12
CAPNS1-216ENST00000628306 FOXI1Q12951 378 aa15.8■□□□□ 0.12
CAPNS1-216ENST00000628306 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa15.8■□□□□ 0.12
CAPNS1-216ENST00000628306 C5orf38Q86SI9 138 aa15.8■□□□□ 0.12
CAPNS1-216ENST00000628306 TM2D2Q9BX73 214 aa15.8■□□□□ 0.12
CAPNS1-216ENST00000628306 Q9HAA7 133 aa15.8■□□□□ 0.12
CAPNS1-216ENST00000628306 TIMM17BO60830 172 aa15.79■□□□□ 0.12
CAPNS1-216ENST00000628306 UBE2WQ96B02 151 aa15.79■□□□□ 0.12
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A0J9YXY3 114 aa15.78■□□□□ 0.12
CAPNS1-216ENST00000628306 COX7B2Q8TF08 81 aa15.78■□□□□ 0.12
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
CAPNS1-216ENST00000628306 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
CAPNS1-216ENST00000628306 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC00528Q8N1L1 170 aa15.77■□□□□ 0.12
CAPNS1-216ENST00000628306 Q6ZVH6 145 aa15.76■□□□□ 0.11
CAPNS1-216ENST00000628306 Q8IZM0 81 aa15.76■□□□□ 0.11
CAPNS1-216ENST00000628306 GAGE12HA6NDE8 117 aa15.75■□□□□ 0.11
CAPNS1-216ENST00000628306 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM238C9JI98 176 aa15.75■□□□□ 0.11
CAPNS1-216ENST00000628306 APOMO95445 188 aa15.75■□□□□ 0.11
CAPNS1-216ENST00000628306 ORAOV1Q8WV07 137 aa15.75■□□□□ 0.11
CAPNS1-216ENST00000628306 HIST1H4GQ99525 98 aa15.75■□□□□ 0.11
CAPNS1-216ENST00000628306 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa15.74■□□□□ 0.11
CAPNS1-216ENST00000628306 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa15.74■□□□□ 0.11
CAPNS1-216ENST00000628306 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa15.74■□□□□ 0.11
CAPNS1-216ENST00000628306 CEND1Q8N111 149 aa15.74■□□□□ 0.11
CAPNS1-216ENST00000628306 MALP21145 153 aa15.73■□□□□ 0.11
CAPNS1-216ENST00000628306 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP15.72■□□□□ 0.11
CAPNS1-216ENST00000628306 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
CAPNS1-216ENST00000628306 CXCL5P42830 114 aa15.71■□□□□ 0.11
CAPNS1-216ENST00000628306 C6orf226Q5I0X4 101 aa15.71■□□□□ 0.11
CAPNS1-216ENST00000628306 LITAFQ99732 161 aa15.71■□□□□ 0.11
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA0087Q14695 138 aa15.7■□□□□ 0.1
CAPNS1-216ENST00000628306 C1orf43Q9BWL3 253 aa15.7■□□□□ 0.1
CAPNS1-216ENST00000628306 SPANXDQ9BXN6 97 aa15.7■□□□□ 0.1
CAPNS1-216ENST00000628306 SPANXCQ9NY87 97 aa15.7■□□□□ 0.1
CAPNS1-216ENST00000628306 PRSS2P07478 247 aa15.69■□□□□ 0.1
CAPNS1-216ENST00000628306 PTTG1IPP53801 180 aa15.69■□□□□ 0.1
CAPNS1-216ENST00000628306 BATFQ16520 125 aa15.69■□□□□ 0.1
CAPNS1-216ENST00000628306 PPDPFQ9H3Y8 114 aa15.69■□□□□ 0.1
CAPNS1-216ENST00000628306 A6NDN8 102 aa15.68■□□□□ 0.1
CAPNS1-216ENST00000628306 SCXQ7RTU7 201 aa15.68■□□□□ 0.1
CAPNS1-216ENST00000628306 RMI2Q96E14 147 aa15.68■□□□□ 0.1
CAPNS1-216ENST00000628306 LECT2O14960 151 aa15.67■□□□□ 0.1
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC01620Q4KN68 170 aa15.67■□□□□ 0.1
CAPNS1-216ENST00000628306 TOMM7Q9P0U1 55 aa15.67■□□□□ 0.1
CAPNS1-216ENST00000628306 IFITM1P13164 125 aa15.66■□□□□ 0.1
CAPNS1-216ENST00000628306 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa15.65■□□□□ 0.1
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