RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 COX11Q9Y6N1 276 aa16.51■□□□□ 0.23
CAPNS1-215ENST00000628018 EREGO14944 169 aa16.5■□□□□ 0.23
CAPNS1-215ENST00000628018 C2orf82Q6UX34 121 aa16.5■□□□□ 0.23
CAPNS1-215ENST00000628018 CKS1BP61024 79 aa16.5■□□□□ 0.23
CAPNS1-215ENST00000628018 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP16.5■□□□□ 0.23
CAPNS1-215ENST00000628018 CEND1Q8N111 149 aa16.49■□□□□ 0.23
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa16.48■□□□□ 0.23
CAPNS1-215ENST00000628018 TM2D2Q9BX73 214 aa16.48■□□□□ 0.23
CAPNS1-215ENST00000628018 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CAPNS1-215ENST00000628018 BATFQ16520 125 aa16.47■□□□□ 0.23
CAPNS1-215ENST00000628018 C6orf223Q8N319 242 aa16.47■□□□□ 0.23
CAPNS1-215ENST00000628018 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
CAPNS1-215ENST00000628018 LINC00526Q96FQ7 95 aa16.47■□□□□ 0.23
CAPNS1-215ENST00000628018 GCSHP23434 173 aa16.46■□□□□ 0.23
CAPNS1-215ENST00000628018 MEIG1Q5JSS6 88 aa16.46■□□□□ 0.23
CAPNS1-215ENST00000628018 SPANXDQ9BXN6 97 aa16.46■□□□□ 0.23
CAPNS1-215ENST00000628018 SPANXCQ9NY87 97 aa16.46■□□□□ 0.23
CAPNS1-215ENST00000628018 HIGD2BQ4VC39 106 aa16.45■□□□□ 0.22
CAPNS1-215ENST00000628018 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa16.45■□□□□ 0.22
CAPNS1-215ENST00000628018 SMIM13P0DJ93 91 aa16.44■□□□□ 0.22
CAPNS1-215ENST00000628018 Q6ZVH6 145 aa16.44■□□□□ 0.22
CAPNS1-215ENST00000628018 FXYD2P54710 66 aa16.43■□□□□ 0.22
CAPNS1-215ENST00000628018 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa16.42■□□□□ 0.22
CAPNS1-215ENST00000628018 ERG28Q9UKR5 140 aa16.42■□□□□ 0.22
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A0U1RRA0 63 aa16.41■□□□□ 0.22
CAPNS1-215ENST00000628018 C10orf25Q5T742 122 aa16.41■□□□□ 0.22
CAPNS1-215ENST00000628018 C2orf48Q96LS8 159 aa16.41■□□□□ 0.22
CAPNS1-215ENST00000628018 USP17L23D6RBM5 183 aa16.4■□□□□ 0.22
CAPNS1-215ENST00000628018 DAND5Q8N907 189 aa16.4■□□□□ 0.22
CAPNS1-215ENST00000628018 LINC00476Q8WZB0 136 aa16.4■□□□□ 0.22
CAPNS1-215ENST00000628018 MUSTN1Q8IVN3 82 aa16.4■□□□□ 0.22
CAPNS1-215ENST00000628018 M0R2N4 97 aa16.39■□□□□ 0.21
CAPNS1-215ENST00000628018 LY6G6CO95867 125 aa16.39■□□□□ 0.21
CAPNS1-215ENST00000628018 F8WDY8 70 aa16.38■□□□□ 0.21
CAPNS1-215ENST00000628018 PTTG1IPP53801 180 aa16.38■□□□□ 0.21
CAPNS1-215ENST00000628018 Q6ZR54 194 aa16.38■□□□□ 0.21
CAPNS1-215ENST00000628018 PFN2P35080 140 aa16.37■□□□□ 0.21
CAPNS1-215ENST00000628018 LINC00158P58513 81 aa16.37■□□□□ 0.21
CAPNS1-215ENST00000628018 CAMK2N2Q96S95 79 aa16.37■□□□□ 0.21
CAPNS1-215ENST00000628018 PSCAO43653 123 aa16.36■□□□□ 0.21
CAPNS1-215ENST00000628018 IFITM1P13164 125 aa16.36■□□□□ 0.21
CAPNS1-215ENST00000628018 COX17Q14061 63 aa16.36■□□□□ 0.21
CAPNS1-215ENST00000628018 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
CAPNS1-215ENST00000628018 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
CAPNS1-215ENST00000628018 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
CAPNS1-215ENST00000628018 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa16.35■□□□□ 0.21
CAPNS1-215ENST00000628018 LINC00308Q8TCZ7 52 aa16.35■□□□□ 0.21
CAPNS1-215ENST00000628018 C6orf48Q9UBA6 75 aa16.35■□□□□ 0.21
CAPNS1-215ENST00000628018 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
CAPNS1-215ENST00000628018 NPC2P61916 151 aa16.34■□□□□ 0.21
CAPNS1-215ENST00000628018 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa16.34■□□□□ 0.21
CAPNS1-215ENST00000628018 Q6ZRU5 148 aa16.34■□□□□ 0.21
CAPNS1-215ENST00000628018 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa16.33■□□□□ 0.2
CAPNS1-215ENST00000628018 A6NDN8 102 aa16.33■□□□□ 0.2
CAPNS1-215ENST00000628018 LECT2O14960 151 aa16.33■□□□□ 0.2
CAPNS1-215ENST00000628018 RPL24P83731 157 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa16.32■□□□□ 0.2
CAPNS1-215ENST00000628018 A6NJY4 79 aa16.32■□□□□ 0.2
CAPNS1-215ENST00000628018 WFDC2Q14508 124 aa16.32■□□□□ 0.2
CAPNS1-215ENST00000628018 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa16.32■□□□□ 0.2
CAPNS1-215ENST00000628018 PPDPFQ9H3Y8 114 aa16.31■□□□□ 0.2
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAH10Q8IVF4 4471 aa16.31■□□□□ 0.2
CAPNS1-215ENST00000628018 ALMS1Q8TCU4 4167 aa16.31■□□□□ 0.2
CAPNS1-215ENST00000628018 A4D1N5 150 aa16.3■□□□□ 0.2
CAPNS1-215ENST00000628018 SYCNQ0VAF6 134 aa16.3■□□□□ 0.2
CAPNS1-215ENST00000628018 COPS9Q8WXC6 57 aa16.3■□□□□ 0.2
CAPNS1-215ENST00000628018 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1B0GWB2 263 aa16.29■□□□□ 0.2
CAPNS1-215ENST00000628018 SLPIP03973 132 aa16.29■□□□□ 0.2
CAPNS1-215ENST00000628018 LRCOL1A6NCL2 159 aa16.26■□□□□ 0.19
CAPNS1-215ENST00000628018 KMT2AQ03164 3969 aa16.25■□□□□ 0.19
CAPNS1-215ENST00000628018 K7ERJ3 54 aa16.24■□□□□ 0.19
CAPNS1-215ENST00000628018 CFC1BP0CG36 223 aa16.24■□□□□ 0.19
CAPNS1-215ENST00000628018 CFC1P0CG37 223 aa16.24■□□□□ 0.19
CAPNS1-215ENST00000628018 CARD19Q96LW7 228 aa16.24■□□□□ 0.19
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAH6Q9C0G6 4158 aa16.24■□□□□ 0.19
CAPNS1-215ENST00000628018 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
CAPNS1-215ENST00000628018 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa16.24■□□□□ 0.19
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF151Q2KHN1 245 aa16.24■□□□□ 0.19
CAPNS1-215ENST00000628018 C14orf177Q52M58 125 aa16.24■□□□□ 0.19
CAPNS1-215ENST00000628018 ARL17AQ8IVW1 177 aa16.24■□□□□ 0.19
CAPNS1-215ENST00000628018 TAX1BP3O14907 124 aa16.23■□□□□ 0.19
CAPNS1-215ENST00000628018 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa16.22■□□□□ 0.19
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A0B4J2C4 111 aa16.2■□□□□ 0.18
CAPNS1-215ENST00000628018 C1orf134Q5TEV5 83 aa16.2■□□□□ 0.18
CAPNS1-215ENST00000628018 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa16.19■□□□□ 0.18
CAPNS1-215ENST00000628018 CNBPP62633 177 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB37Q96AX2 223 aa16.19■□□□□ 0.18
CAPNS1-215ENST00000628018 TLX1NBP0CAT3 122 aa16.17■□□□□ 0.18
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAH2Q9P225 4427 aa16.15■□□□□ 0.18
CAPNS1-215ENST00000628018 PRO1854Q9UHT4 67 aa16.15■□□□□ 0.18
CAPNS1-215ENST00000628018 Q6ZRP5 223 aa16.14■□□□□ 0.18
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A087WTM6 91 aa16.14■□□□□ 0.17
CAPNS1-215ENST00000628018 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
CAPNS1-215ENST00000628018 Q8N814 137 aa16.12■□□□□ 0.17
CAPNS1-215ENST00000628018 XAGE1AQ9HD64 81 aa16.12■□□□□ 0.17
CAPNS1-215ENST00000628018 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa16.11■□□□□ 0.17
CAPNS1-215ENST00000628018 C9orf118A6NHY6 69 aa16.11■□□□□ 0.17
CAPNS1-215ENST00000628018 NDUFC2O95298 119 aa16.11■□□□□ 0.17
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