RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614484.4

SRRT-215, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRRT, Length 2,964 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-215ENST00000614484 C9orf66Q5T8R8 295 aa8.63□□□□□ -1.03
SRRT-215ENST00000614484 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.62□□□□□ -1.03
SRRT-215ENST00000614484 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa8.62□□□□□ -1.03
SRRT-215ENST00000614484 K7EQG2 157 aa8.62□□□□□ -1.03
SRRT-215ENST00000614484 PRSS2P07478 247 aa8.62□□□□□ -1.03
SRRT-215ENST00000614484 MPLKIPQ8TAP9 179 aa8.62□□□□□ -1.03
SRRT-215ENST00000614484 IGIPA6NJ69 53 aa8.62□□□□□ -1.03
SRRT-215ENST00000614484 PPP1R17O96001 155 aa8.62□□□□□ -1.03
SRRT-215ENST00000614484 COX6CP09669 75 aa8.62□□□□□ -1.03
SRRT-215ENST00000614484 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.62□□□□□ -1.03
SRRT-215ENST00000614484 MAP6D1Q9H9H5 199 aa8.62□□□□□ -1.03
SRRT-215ENST00000614484 SOCS3O14543 225 aa8.61□□□□□ -1.03
SRRT-215ENST00000614484 TMEM141Q96I45 108 aa8.61□□□□□ -1.03
SRRT-215ENST00000614484 WFDC9Q8NEX5 89 aa8.61□□□□□ -1.03
SRRT-215ENST00000614484 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.61□□□□□ -1.03
SRRT-215ENST00000614484 LEPROTO15243 131 aa8.61□□□□□ -1.03
SRRT-215ENST00000614484 SPINK13Q1W4C9 94 aa8.61□□□□□ -1.03
SRRT-215ENST00000614484 ICOSQ9Y6W8 199 aa8.6□□□□□ -1.03
SRRT-215ENST00000614484 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
SRRT-215ENST00000614484 PRR9Q5T870 116 aa8.6□□□□□ -1.03
SRRT-215ENST00000614484 ZNF876PQ49A33 203 aa8.59□□□□□ -1.03
SRRT-215ENST00000614484 DAND5Q8N907 189 aa8.59□□□□□ -1.03
SRRT-215ENST00000614484 CLEC2BQ92478 149 aa8.59□□□□□ -1.03
SRRT-215ENST00000614484 TENM3Q9P273 2699 aa8.59□□□□□ -1.03
SRRT-215ENST00000614484 TGP01266 2768 aa8.59□□□□□ -1.03
SRRT-215ENST00000614484 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa8.59□□□□□ -1.03
SRRT-215ENST00000614484 TIMM17AQ99595 171 aa8.59□□□□□ -1.03
SRRT-215ENST00000614484 GHRHP01286 108 aa8.58□□□□□ -1.04
SRRT-215ENST00000614484 Q6JHZ5 121 aa8.58□□□□□ -1.04
SRRT-215ENST00000614484 A0A087WVE0 104 aa8.58□□□□□ -1.04
SRRT-215ENST00000614484 TMEM223A0PJW6 202 aa8.57□□□□□ -1.04
SRRT-215ENST00000614484 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa8.57□□□□□ -1.04
SRRT-215ENST00000614484 TRAV21A0A0B4J279 112 aa8.57□□□□□ -1.04
SRRT-215ENST00000614484 VCYO14598 125 aa8.57□□□□□ -1.04
SRRT-215ENST00000614484 F5H697 171 aa8.56□□□□□ -1.04
SRRT-215ENST00000614484 LST1O00453 97 aa8.56□□□□□ -1.04
SRRT-215ENST00000614484 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SRRT-215ENST00000614484 VSIG2Q96IQ7 327 aa8.56□□□□□ -1.04
SRRT-215ENST00000614484 COL7A1Q02388 2944 aa8.56□□□□□ -1.04
SRRT-215ENST00000614484 A0A0J9YXY3 114 aa8.56□□□□□ -1.04
SRRT-215ENST00000614484 M0R378 163 aa8.56□□□□□ -1.04
SRRT-215ENST00000614484 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SRRT-215ENST00000614484 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.55□□□□□ -1.04
SRRT-215ENST00000614484 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa8.55□□□□□ -1.04
SRRT-215ENST00000614484 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.55□□□□□ -1.04
SRRT-215ENST00000614484 GNRH2O43555 120 aa8.55□□□□□ -1.04
SRRT-215ENST00000614484 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.55□□□□□ -1.04
SRRT-215ENST00000614484 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.55□□□□□ -1.04
SRRT-215ENST00000614484 A0A0J9YX75 114 aa8.55□□□□□ -1.04
SRRT-215ENST00000614484 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.55□□□□□ -1.04
SRRT-215ENST00000614484 DEFB4AO15263 64 aa8.55□□□□□ -1.04
SRRT-215ENST00000614484 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa8.55□□□□□ -1.04
SRRT-215ENST00000614484 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SRRT-215ENST00000614484 INAFM2P0DMQ5 153 aa8.54□□□□□ -1.04
SRRT-215ENST00000614484 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.54□□□□□ -1.04
SRRT-215ENST00000614484 KLKP1Q107X0 134 aa8.54□□□□□ -1.04
SRRT-215ENST00000614484 I3L3M4 83 aa8.53□□□□□ -1.04
SRRT-215ENST00000614484 A0A0J9YXV3 536 aa8.53□□□□□ -1.04
SRRT-215ENST00000614484 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.53□□□□□ -1.04
SRRT-215ENST00000614484 LENEPQ9Y5L5 61 aa8.53□□□□□ -1.04
SRRT-215ENST00000614484 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.52□□□□□ -1.04
SRRT-215ENST00000614484 DEFB135Q30KP9 77 aa8.52□□□□□ -1.04
SRRT-215ENST00000614484 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa8.52□□□□□ -1.04
SRRT-215ENST00000614484 MUC4Q99102 2169 aa8.52□□□□□ -1.05
SRRT-215ENST00000614484 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
SRRT-215ENST00000614484 NDUFS5O43920 106 aa8.51□□□□□ -1.05
SRRT-215ENST00000614484 MED14OSP0DP75 135 aa8.51□□□□□ -1.05
SRRT-215ENST00000614484 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SRRT-215ENST00000614484 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.51□□□□□ -1.05
SRRT-215ENST00000614484 F8WEM9 126 aa8.51□□□□□ -1.05
SRRT-215ENST00000614484 NXPH4O95158 308 aa8.51□□□□□ -1.05
SRRT-215ENST00000614484 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa8.51□□□□□ -1.05
SRRT-215ENST00000614484 NDUFC1O43677 76 aa8.5□□□□□ -1.05
SRRT-215ENST00000614484 LINC00315P59091 139 aa8.5□□□□□ -1.05
SRRT-215ENST00000614484 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.5□□□□□ -1.05
SRRT-215ENST00000614484 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.5□□□□□ -1.05
SRRT-215ENST00000614484 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.5□□□□□ -1.05
SRRT-215ENST00000614484 K7EIL1 84 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-215ENST00000614484 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SRRT-215ENST00000614484 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-215ENST00000614484 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-215ENST00000614484 LITAFQ99732 161 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-215ENST00000614484 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-215ENST00000614484 STAB2Q8WWQ8 2551 aa8.49□□□□□ -1.05
SRRT-215ENST00000614484 FBN3Q75N90 2809 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-215ENST00000614484 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-215ENST00000614484 DNAH3Q8TD57 4116 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-215ENST00000614484 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SRRT-215ENST00000614484 MIAQ16674 131 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-215ENST00000614484 NACAE9PAV3 2078 aa8.48□□□□□ -1.05
SRRT-215ENST00000614484 UBE2L6O14933 153 aa8.47□□□□□ -1.05
SRRT-215ENST00000614484 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa8.46□□□□□ -1.05
SRRT-215ENST00000614484 ESRGQ1W209 222 aa8.46□□□□□ -1.05
SRRT-215ENST00000614484 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.46□□□□□ -1.06
SRRT-215ENST00000614484 FAM222AQ5U5X8 452 aa8.46□□□□□ -1.06
SRRT-215ENST00000614484 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.46□□□□□ -1.06
SRRT-215ENST00000614484 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.45□□□□□ -1.06
SRRT-215ENST00000614484 LYRM9A8MSI8 78 aa8.45□□□□□ -1.06
SRRT-215ENST00000614484 BCE1O60756 84 aa8.45□□□□□ -1.06
SRRT-215ENST00000614484 Q6ZVQ6 151 aa8.45□□□□□ -1.06
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