RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HTN3P15516 51 aa8.15□□□□□ -1.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.15□□□□□ -1.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM218AQ96MZ4 157 aa8.15□□□□□ -1.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANK2Q01484 3957 aa8.15□□□□□ -1.1
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NOTCH1P46531 2555 aa8.15□□□□□ -1.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MAST4O15021 2626 aa8.15□□□□□ -1.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCL18P55774 89 aa8.15□□□□□ -1.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SCGB1A1P11684 91 aa8.14□□□□□ -1.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CKS1BP61024 79 aa8.14□□□□□ -1.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 H3BT86 120 aa8.14□□□□□ -1.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1B0GUV1 79 aa8.13□□□□□ -1.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LYRM9A8MSI8 78 aa8.13□□□□□ -1.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DAD1P61803 113 aa8.13□□□□□ -1.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LINC01600Q96MT4 127 aa8.13□□□□□ -1.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TENM3Q9P273 2699 aa8.13□□□□□ -1.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SS18Q15532 418 aa8.13□□□□□ -1.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CITED1Q99966 193 aa8.13□□□□□ -1.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.13□□□□□ -1.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CRPP02741 224 aa8.13□□□□□ -1.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q9HAA7 133 aa8.12□□□□□ -1.11
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANGP03950 147 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 APOC4P55056 127 aa8.12□□□□□ -1.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.11□□□□□ -1.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q8NAQ8 132 aa8.11□□□□□ -1.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.1□□□□□ -1.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa8.1□□□□□ -1.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.1□□□□□ -1.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1B0GV72 72 aa8.1□□□□□ -1.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATP5G1P05496 136 aa8.09□□□□□ -1.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR13C6PQ8NH95 151 aa8.09□□□□□ -1.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BAALC-AS2P0C853 105 aa8.09□□□□□ -1.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 REG3AQ06141 175 aa8.09□□□□□ -1.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.08□□□□□ -1.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.08□□□□□ -1.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.08□□□□□ -1.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A087WYN8 130 aa8.07□□□□□ -1.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C22orf24Q9Y442 160 aa8.07□□□□□ -1.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TTC32Q5I0X7 151 aa8.07□□□□□ -1.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q8IZM0 81 aa8.07□□□□□ -1.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.07□□□□□ -1.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRACP01848 142 aa8.06□□□□□ -1.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPART-AS1P0CW21 52 aa8.06□□□□□ -1.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MIFP14174 115 aa8.06□□□□□ -1.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KIAA0087Q14695 138 aa8.06□□□□□ -1.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.06□□□□□ -1.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COL6A5A8TX70 2615 aa8.06□□□□□ -1.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SNCGO76070 127 aa8.06□□□□□ -1.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MALP21145 153 aa8.06□□□□□ -1.12
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.06□□□□□ -1.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RETNQ9HD89 108 aa8.05□□□□□ -1.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DEFB121Q5J5C9 76 aa8.04□□□□□ -1.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C6orf223Q8N319 242 aa8.04□□□□□ -1.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KLK12Q9UKR0 248 aa8.04□□□□□ -1.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa8.03□□□□□ -1.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLPIP03973 132 aa8.03□□□□□ -1.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GAGE2BQ13066 116 aa8.03□□□□□ -1.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GAGE2EQ4V326 116 aa8.03□□□□□ -1.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.03□□□□□ -1.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C10orf25Q5T742 122 aa8.02□□□□□ -1.12
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LECT2O14960 151 aa8.02□□□□□ -1.13
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP10-11P60412 298 aa8.02□□□□□ -1.13
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q8NDZ9 215 aa8.02□□□□□ -1.13
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DNAL4O96015 105 aa8.01□□□□□ -1.13
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.01□□□□□ -1.13
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LELP1Q5T871 98 aa8.01□□□□□ -1.13
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa7.99□□□□□ -1.13
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.99□□□□□ -1.13
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ENHOQ6UWT2 76 aa7.99□□□□□ -1.13
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.99□□□□□ -1.13
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.99□□□□□ -1.13
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 B5MCH6 92 aa7.99□□□□□ -1.13
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 H0YGX0 51 aa7.99□□□□□ -1.13
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WIPF1O43516 503 aa7.99□□□□□ -1.13
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.99□□□□□ -1.13
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NCR3O14931 201 aa7.98□□□□□ -1.13
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPAG11BQ08648 103 aa7.98□□□□□ -1.13
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CMYA5Q8N3K9 4069 aa7.98□□□□□ -1.13
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CYSRT1A8MQ03 144 aa7.98□□□□□ -1.13
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.97□□□□□ -1.13
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C14orf132Q9NPU4 83 aa7.97□□□□□ -1.13
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q6ZTC4 211 aa7.97□□□□□ -1.13
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.97□□□□□ -1.13
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CXCL5P42830 114 aa7.96□□□□□ -1.13
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRR34Q9NV39 138 aa7.96□□□□□ -1.13
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COX17Q14061 63 aa7.96□□□□□ -1.14
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C3orf56Q8N813 242 aa7.96□□□□□ -1.14
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.96□□□□□ -1.14
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
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