RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603949.1

SMC2-AS1-202, Transcript of SMC2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

Gene SMC2-AS1, Length 672 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2-AS1-202ENST00000603949 CKS1BP61024 79 aa7.41□□□□□ -1.22
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SMC2-AS1-202ENST00000603949 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.41□□□□□ -1.22
SMC2-AS1-202ENST00000603949 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.41□□□□□ -1.22
SMC2-AS1-202ENST00000603949 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.4□□□□□ -1.22
SMC2-AS1-202ENST00000603949 DNAH3Q8TD57 4116 aa7.4□□□□□ -1.22
SMC2-AS1-202ENST00000603949 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.4□□□□□ -1.22
SMC2-AS1-202ENST00000603949 CYSRT1A8MQ03 144 aa7.4□□□□□ -1.22
SMC2-AS1-202ENST00000603949 J3QR89 54 aa7.4□□□□□ -1.22
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SMC2-AS1-202ENST00000603949 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.38□□□□□ -1.23
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SMC2-AS1-202ENST00000603949 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.36□□□□□ -1.23
SMC2-AS1-202ENST00000603949 PRO0461Q9UI25 63 aa7.36□□□□□ -1.23
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SMC2-AS1-202ENST00000603949 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.35□□□□□ -1.23
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SMC2-AS1-202ENST00000603949 CARD19Q96LW7 228 aa7.31□□□□□ -1.24
SMC2-AS1-202ENST00000603949 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.31□□□□□ -1.24
SMC2-AS1-202ENST00000603949 C9JAW5 83 aa7.3□□□□□ -1.24
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SMC2-AS1-202ENST00000603949 C2orf82Q6UX34 121 aa7.3□□□□□ -1.24
SMC2-AS1-202ENST00000603949 RMI2Q96E14 147 aa7.3□□□□□ -1.24
SMC2-AS1-202ENST00000603949 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.29□□□□□ -1.24
SMC2-AS1-202ENST00000603949 TRACP01848 142 aa7.29□□□□□ -1.24
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SMC2-AS1-202ENST00000603949 IGKV2D-28P01615 120 aa7.28□□□□□ -1.24
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SMC2-AS1-202ENST00000603949 RNF151Q2KHN1 245 aa7.28□□□□□ -1.24
SMC2-AS1-202ENST00000603949 UPK3BQ9BT76 320 aa7.28□□□□□ -1.24
SMC2-AS1-202ENST00000603949 COL6A5A8TX70 2615 aa7.27□□□□□ -1.25
SMC2-AS1-202ENST00000603949 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.27□□□□□ -1.25
SMC2-AS1-202ENST00000603949 MTURNQ8N3F0 131 aa7.27□□□□□ -1.25
SMC2-AS1-202ENST00000603949 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.27□□□□□ -1.25
SMC2-AS1-202ENST00000603949 B9D2Q9BPU9 175 aa7.27□□□□□ -1.25
SMC2-AS1-202ENST00000603949 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.26□□□□□ -1.25
SMC2-AS1-202ENST00000603949 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.26□□□□□ -1.25
SMC2-AS1-202ENST00000603949 MDFIQ99750 246 aa7.26□□□□□ -1.25
SMC2-AS1-202ENST00000603949 TMEM126AQ9H061 195 aa7.26□□□□□ -1.25
SMC2-AS1-202ENST00000603949 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SMC2-AS1-202ENST00000603949 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.25□□□□□ -1.25
SMC2-AS1-202ENST00000603949 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.25□□□□□ -1.25
SMC2-AS1-202ENST00000603949 CLEC2BQ92478 149 aa7.25□□□□□ -1.25
SMC2-AS1-202ENST00000603949 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.24□□□□□ -1.25
SMC2-AS1-202ENST00000603949 A0A1B0GX51 115 aa7.24□□□□□ -1.25
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