RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589232.5

GTF3C2-AS1-206, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 254 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa2.8□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa2.8□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 LINC01549A6NIU2 74 aa2.8□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 C8orf87E5RJ46 101 aa2.8□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 H3BMM0 161 aa2.8□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 UQCRQO14949 82 aa2.8□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GAS8-AS1O95177 125 aa2.8□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 APOMO95445 188 aa2.8□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 LINC00315P59091 139 aa2.8□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 KRTAP10-1P60331 282 aa2.8□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FOXI1Q12951 378 aa2.8□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RRN3P1Q2M238 152 aa2.8□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ORMDL2Q53FV1 153 aa2.8□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SLC25A34Q6PIV7 304 aa2.8□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa2.8□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RAB37Q96AX2 223 aa2.8□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PMCHL2Q9BQD1 86 aa2.8□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa2.8□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 IMUPQ9GZP8 106 aa2.8□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa2.8□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa2.8□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa2.8□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa2.79□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GNRH2O43555 120 aa2.79□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 COX8AP10176 69 aa2.79□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DEFB131AP59861 70 aa2.79□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SPINK13Q1W4C9 94 aa2.79□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 C9orf153Q5TBE3 101 aa2.79□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 C6orf223Q8N319 242 aa2.79□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 C10orf126Q8N4M7 172 aa2.79□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 COPS9Q8WXC6 57 aa2.79□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 LINC00526Q96FQ7 95 aa2.79□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DPH3Q96FX2 82 aa2.79□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 LINC00467Q9BRT7 94 aa2.79□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa2.79□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa2.78□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa2.78□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa2.78□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa2.78□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa2.78□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa2.78□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 hDV102S1A0JD36 115 aa2.78□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 C9orf118A6NHY6 69 aa2.78□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 IGKV3-20P01619 116 aa2.78□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PRSS1P07477 247 aa2.78□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MGPP08493 103 aa2.78□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PLNP26678 52 aa2.78□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PSMB2P49721 201 aa2.78□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SEC11AP67812 179 aa2.78□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP2.78□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ZNF876PQ49A33 203 aa2.78□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SUMO4Q6EEV6 95 aa2.78□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 C3orf22Q8N5N4 141 aa2.78□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TOMM6Q96B49 74 aa2.78□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa2.77□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa2.77□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa2.77□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 A8MWV9 139 aa2.77□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 H3BRM9 83 aa2.77□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 M0QY20 66 aa2.77□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 M0R2P5 195 aa2.77□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NDUFS5O43920 106 aa2.77□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SNCGO76070 127 aa2.77□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 INSP01308 110 aa2.77□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 IGKCP01834 107 aa2.77□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MT-ATP8P03928 68 aa2.77□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CRYGAP11844 174 aa2.77□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NMUP48645 174 aa2.77□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FXYD7P58549 80 aa2.77□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RHOHQ15669 191 aa2.77□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa2.77□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 C2orf66Q6UXQ4 117 aa2.77□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SCGB3A1Q96QR1 104 aa2.77□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DKK2Q9UBU2 259 aa2.77□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 HHLA3Q9XRX5 114 aa2.77□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 LRP2P98164 4655 aa2.77□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa2.76□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa2.76□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SDHAF1A6NFY7 115 aa2.76□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa2.76□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 F8VRH5 84 aa2.76□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TRACP01848 142 aa2.76□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 HTN3P15516 51 aa2.76□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ZNF56Q15929 161 aa2.76□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FAM74A4Q5TZK3 123 aa2.76□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FAM222AQ5U5X8 452 aa2.76□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 C2orf91Q6ZV80 131 aa2.76□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 C11orf72Q8NBR9 251 aa2.76□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa2.76□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa2.76□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 BRK1Q8WUW1 75 aa2.76□□□□□ -1.97
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TMEM141Q96I45 108 aa2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms