RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 Q6ZRP5 223 aa6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM168BA1KXE4 195 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 F8WDY8 70 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 K7EMI3 77 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 G0S2P27469 103 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 RNF151Q2KHN1 245 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.63□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 IGIPA6NJ69 53 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 CKS1BP61024 79 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 FA2HQ7L5A8 372 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 TOMM6Q96B49 74 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 AMELXQ99217 191 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.62□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 HERVK_113P63121 156 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 KIAA0087Q14695 138 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 RHEBQ15382 184 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 C1orf137Q5JT78 98 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 TIMM17AQ99595 171 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.61□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 NPSP0C0P6 89 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 MT1HL1P0DM35 61 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 UBE2BP63146 152 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 SEC11AP67812 179 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 REG3GQ6UW15 175 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.6□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 M0QXV9 152 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 APOC3P02656 99 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 COX19Q49B96 90 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 ERASQ7Z444 233 aa6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
EFTUD2-209ENST00000587957 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-209ENST00000587957 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-209ENST00000587957 NDUFA6P56556 154 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-209ENST00000587957 NDUFA5Q16718 116 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-209ENST00000587957 Q8IZM0 81 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-209ENST00000587957 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.58□□□□□ -1.36
EFTUD2-209ENST00000587957 ODF1Q14990 250 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-209ENST00000587957 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-209ENST00000587957 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.57□□□□□ -1.36
EFTUD2-209ENST00000587957 SPINK8P0C7L1 97 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-209ENST00000587957 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-209ENST00000587957 LINC01600Q96MT4 127 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-209ENST00000587957 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.56□□□□□ -1.36
EFTUD2-209ENST00000587957 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-209ENST00000587957 LINC01549A6NIU2 74 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-209ENST00000587957 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-209ENST00000587957 F8VRH5 84 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-209ENST00000587957 SNAPINO95295 136 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-209ENST00000587957 PMVKQ15126 192 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-209ENST00000587957 PMCHL1Q16048 86 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-209ENST00000587957 COX7B2Q8TF08 81 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-209ENST00000587957 CST9LQ9H4G1 147 aa6.55□□□□□ -1.36
EFTUD2-209ENST00000587957 CXCL5P42830 114 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-209ENST00000587957 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-209ENST00000587957 SVBPQ8N300 66 aa6.54□□□□□ -1.36
EFTUD2-209ENST00000587957 LINC01546A6NGU7 62 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-209ENST00000587957 H3BRM9 83 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-209ENST00000587957 IGLV7-43P04211 117 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-209ENST00000587957 RAB5BP61020 215 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-209ENST00000587957 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-209ENST00000587957 HBDP02042 147 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-209ENST00000587957 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-209ENST00000587957 DIRC1Q969H9 104 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-209ENST00000587957 LINC00614P0C842 121 aa6.51□□□□□ -1.37
EFTUD2-209ENST00000587957 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-209ENST00000587957 A0A096LNJ9 63 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-209ENST00000587957 ATP5LO75964 103 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-209ENST00000587957 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-209ENST00000587957 C22orf24Q9Y442 160 aa6.5□□□□□ -1.37
EFTUD2-209ENST00000587957 TNXBP22105 4242 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-209ENST00000587957 GAGE10A6NGK3 116 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-209ENST00000587957 H0Y9J4 135 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-209ENST00000587957 IGLC3P0DOY3 106 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-209ENST00000587957 PFN2P35080 140 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-209ENST00000587957 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-209ENST00000587957 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.49□□□□□ -1.37
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
EFTUD2-209ENST00000587957 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
EFTUD2-209ENST00000587957 BAGE3Q86Y29 109 aa6.48□□□□□ -1.37
EFTUD2-209ENST00000587957 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.48□□□□□ -1.37
EFTUD2-209ENST00000587957 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.47□□□□□ -1.37
EFTUD2-209ENST00000587957 KRTAP10-8P60410 259 aa6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms