RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567780.1

HOXC-AS3-204, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

Gene HOXC-AS3, Length 2,816 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PAX4O43316 350 aa8.63□□□□□ -1.03
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.62□□□□□ -1.03
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FAM218AQ96MZ4 157 aa8.62□□□□□ -1.03
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa8.62□□□□□ -1.03
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGKV2D-28P01615 120 aa8.62□□□□□ -1.03
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CCL18P55774 89 aa8.62□□□□□ -1.03
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SS18Q15532 418 aa8.62□□□□□ -1.03
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.62□□□□□ -1.03
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.62□□□□□ -1.03
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TTC32Q5I0X7 151 aa8.61□□□□□ -1.03
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C9orf66Q5T8R8 295 aa8.61□□□□□ -1.03
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa8.6□□□□□ -1.03
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GAGE2BQ13066 116 aa8.6□□□□□ -1.03
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GAGE2EQ4V326 116 aa8.6□□□□□ -1.03
HOXC-AS3-204ENST00000567780 OR13C6PQ8NH95 151 aa8.6□□□□□ -1.03
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.6□□□□□ -1.03
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.6□□□□□ -1.03
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.6□□□□□ -1.03
HOXC-AS3-204ENST00000567780 BAALC-AS2P0C853 105 aa8.6□□□□□ -1.03
HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q8N3U1 123 aa8.6□□□□□ -1.03
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.59□□□□□ -1.03
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HTN3P15516 51 aa8.59□□□□□ -1.03
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.58□□□□□ -1.04
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.58□□□□□ -1.04
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRACP01848 142 aa8.58□□□□□ -1.04
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DAD1P61803 113 aa8.58□□□□□ -1.04
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A0A1B0GUV1 79 aa8.58□□□□□ -1.04
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ANGP03950 147 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LYRM9A8MSI8 78 aa8.57□□□□□ -1.04
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM126AQ9H061 195 aa8.57□□□□□ -1.04
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CELA1Q9UNI1 258 aa8.56□□□□□ -1.04
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ATP5G1P05496 136 aa8.56□□□□□ -1.04
HOXC-AS3-204ENST00000567780 APOC4P55056 127 aa8.56□□□□□ -1.04
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A0A087WYN8 130 aa8.55□□□□□ -1.04
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DNAL4O96015 105 aa8.55□□□□□ -1.04
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DEFB121Q5J5C9 76 aa8.55□□□□□ -1.04
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HIVEP1P15822 2718 aa8.55□□□□□ -1.04
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MALP21145 153 aa8.54□□□□□ -1.04
HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q8IZM0 81 aa8.54□□□□□ -1.04
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
HOXC-AS3-204ENST00000567780 REG3AQ06141 175 aa8.53□□□□□ -1.04
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa8.53□□□□□ -1.04
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.52□□□□□ -1.05
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C22orf24Q9Y442 160 aa8.52□□□□□ -1.05
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LECT2O14960 151 aa8.52□□□□□ -1.05
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.51□□□□□ -1.05
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q6Q795 121 aa8.49□□□□□ -1.05
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MIFP14174 115 aa8.49□□□□□ -1.05
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KIAA0087Q14695 138 aa8.49□□□□□ -1.05
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 C3orf56Q8N813 242 aa8.48□□□□□ -1.05
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.48□□□□□ -1.05
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 INAFM2P0DMQ5 153 aa8.48□□□□□ -1.05
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.48□□□□□ -1.05
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KLK12Q9UKR0 248 aa8.48□□□□□ -1.05
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C6orf223Q8N319 242 aa8.47□□□□□ -1.05
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.47□□□□□ -1.05
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 SPAG11BQ08648 103 aa8.45□□□□□ -1.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C10orf25Q5T742 122 aa8.45□□□□□ -1.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.45□□□□□ -1.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LELP1Q5T871 98 aa8.44□□□□□ -1.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 J3KT08 172 aa8.43□□□□□ -1.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 COX17Q14061 63 aa8.43□□□□□ -1.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.43□□□□□ -1.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RETNQ9HD89 108 aa8.43□□□□□ -1.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q8NDZ9 215 aa8.43□□□□□ -1.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ORMDL1Q9P0S3 153 aa8.43□□□□□ -1.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 F8P00451 2351 aa8.42□□□□□ -1.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.42□□□□□ -1.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LINC00643Q86TS7 51 aa8.42□□□□□ -1.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.42□□□□□ -1.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CYSRT1A8MQ03 144 aa8.42□□□□□ -1.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 WFDC9Q8NEX5 89 aa8.42□□□□□ -1.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa8.41□□□□□ -1.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa8.41□□□□□ -1.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NDUFC2O95298 119 aa8.4□□□□□ -1.06
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C6orf99Q4VX62 202 aa8.4□□□□□ -1.06
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