RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.05□□□□□ -1.44
SMAD3-215ENST00000560424 RMI2Q96E14 147 aa6.05□□□□□ -1.44
SMAD3-215ENST00000560424 hDV102S1A0JD36 115 aa6.04□□□□□ -1.44
SMAD3-215ENST00000560424 E9PLD3 99 aa6.04□□□□□ -1.44
SMAD3-215ENST00000560424 DLEU1O43261 78 aa6.04□□□□□ -1.44
SMAD3-215ENST00000560424 RBX1P62877 108 aa6.04□□□□□ -1.44
SMAD3-215ENST00000560424 HERVK_113P63121 156 aa6.04□□□□□ -1.44
SMAD3-215ENST00000560424 MAJINQ3KP22 176 aa6.04□□□□□ -1.44
SMAD3-215ENST00000560424 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.03□□□□□ -1.44
SMAD3-215ENST00000560424 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.03□□□□□ -1.44
SMAD3-215ENST00000560424 COX8AP10176 69 aa6.03□□□□□ -1.44
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
SMAD3-215ENST00000560424 GAGE6Q13070 117 aa6.03□□□□□ -1.44
SMAD3-215ENST00000560424 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.03□□□□□ -1.44
SMAD3-215ENST00000560424 MPV17L2Q567V2 206 aa6.03□□□□□ -1.44
SMAD3-215ENST00000560424 STPG4Q8N801 248 aa6.03□□□□□ -1.44
SMAD3-215ENST00000560424 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.02□□□□□ -1.45
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SMAD3-215ENST00000560424 HERVK_113P61574 105 aa6.02□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 BATFQ16520 125 aa6.02□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.02□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.02□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 PRR34Q9NV39 138 aa6.02□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM223A0PJW6 202 aa6.01□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM262E9PQX1 116 aa6.01□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 C14orf177Q52M58 125 aa6.01□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.01□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.01□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.01□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 H3BRM9 83 aa6□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.99□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa5.99□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa5.99□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa5.99□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 PLEKHB2Q96CS7 222 aa5.99□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa5.99□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 TNXBP22105 4242 aa5.98□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 A0A087WZ39 114 aa5.98□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa5.98□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 LEPROTO15243 131 aa5.98□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 ANGP03950 147 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 REG3AQ06141 175 aa5.98□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 SS18Q15532 418 aa5.98□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 HIGD1BQ9P298 99 aa5.98□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.97□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 A6NDN8 102 aa5.97□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 NMUP48645 174 aa5.97□□□□□ -1.45
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SMAD3-215ENST00000560424 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa5.97□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 CD164L2Q6UWJ8 174 aa5.97□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 PCP2Q8IVA1 136 aa5.97□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 LINC00269Q8N2A0 174 aa5.97□□□□□ -1.45
SMAD3-215ENST00000560424 Q8N3U1 123 aa5.97□□□□□ -1.45
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SMAD3-215ENST00000560424 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5.96□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 SMIM1B2RUZ4 78 aa5.96□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 J3QQQ9 107 aa5.96□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 MIAQ16674 131 aa5.96□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 UBE2WQ96B02 151 aa5.96□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 HSD52Q0P140 79 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 SFTA2Q6UW10 78 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 ENHOQ6UWT2 76 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 C2orf91Q6ZV80 131 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 KLK12Q9UKR0 248 aa5.95□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 CRPP02741 224 aa5.94□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.94□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 UBE2V1Q13404 147 aa5.94□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 TAL2Q16559 108 aa5.94□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 LINC01600Q96MT4 127 aa5.94□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.94□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF815PA8K554 130 aa5.93□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 TAX1BP3O14907 124 aa5.93□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 SPINK8P0C7L1 97 aa5.93□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 FOXI1Q12951 378 aa5.93□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 TTTY13Q9BZ97 58 aa5.93□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa5.92□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa5.92□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 A6NJY4 79 aa5.92□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 COX7A2LO14548 114 aa5.92□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 NDUFA1O15239 70 aa5.92□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 XCL1P47992 114 aa5.92□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 PTTG1IPP53801 180 aa5.92□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 HERV-K104P63124 156 aa5.92□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa5.92□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 Q8IZM0 81 aa5.92□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 C7orf33Q8WU49 177 aa5.92□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 NDUFA12Q9UI09 145 aa5.92□□□□□ -1.46
SMAD3-215ENST00000560424 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa5.91□□□□□ -1.46
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