RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557356.5

PSEN1-222, Transcript of presenilin 1, human

TSL 4

Gene PSEN1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSEN1-222	ENST00000557356	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		5	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		5	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		5	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	SCGB1D1	O95968	90 aa		5	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	HBD	P02042	147 aa		5	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356		Q6ZRU5	148 aa		5	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		5	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		5	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	STPG4	Q8N801	248 aa		5	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	CST9L	Q9H4G1	147 aa		5	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356		A0A096LNI7	61 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356		H3BRM9	83 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	SERF1A	O75920	110 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	CXCL5	P42830	114 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356		Q8IZM0	81 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	C20orf202	A1L168	122 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	PANO1	I0J062	215 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356		M0R143	59 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	CHTF8	P0CG12	524 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	LINC00310	P59036	64 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	PRO1933	Q9H354	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	PKD1	P98161	4303 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356		A0A0J9YXV3	536 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	NUPR1	O60356	82 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	PMCHL1	Q16048	86 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	VAMP8	Q9BV40	100 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	DNAH2	Q9P225	4427 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PSEN1-222	ENST00000557356	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356		A6NJY4	79 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356		F8VRH5	84 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	HSBP1	O75506	76 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	SFTA2	Q6UW10	78 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	OXT	P01178	125 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	C2orf82	Q6UX34	121 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356		A0A096LNJ9	63 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	IGLC3	P0DOY3	106 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	ODF1	Q14990	250 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356		Q6ZRP5	223 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	COX7B2	Q8TF08	81 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	KRTDAP	P60985	99 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356		A0A1B0GV90	55 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356		A0A1W2PNN7	141 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	SPINK8	P0C7L1	97 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	C3orf79	P0CE67	100 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	LEPROTL1	O95214	131 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	COX17	Q14061	63 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	SPATA45	Q537H7	98 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	PET117	Q6UWS5	81 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	PKHD1	P08F94	4074 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PSEN1-222	ENST00000557356	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	C11orf86	A6NJI1	115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	UBE2B	P63146	152 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	HERC2	O95714	4834 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSEN1-222	ENST00000557356	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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