RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556496.2

NRXN3-213, Transcript of neurexin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NRXN3, Length 2,737 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3-213ENST00000556496 ATP5G1P05496 136 aa7.29□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa7.29□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.29□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 UBE2WQ96B02 151 aa7.29□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.29□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 CRPP02741 224 aa7.29□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 HTN3P15516 51 aa7.29□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 Q8N3U1 123 aa7.29□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.28□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 SCGB1A1P11684 91 aa7.28□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 CCL18P55774 89 aa7.28□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 XGP55808 180 aa7.28□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.28□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.28□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 IGKV2D-28P01615 120 aa7.28□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 MT-ATP8P03928 68 aa7.28□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 ANGP03950 147 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
NRXN3-213ENST00000556496 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa7.27□□□□□ -1.25
NRXN3-213ENST00000556496 WIPF1O43516 503 aa7.27□□□□□ -1.25
NRXN3-213ENST00000556496 REG3AQ06141 175 aa7.26□□□□□ -1.25
NRXN3-213ENST00000556496 Q8IZM0 81 aa7.26□□□□□ -1.25
NRXN3-213ENST00000556496 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
NRXN3-213ENST00000556496 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.26□□□□□ -1.25
NRXN3-213ENST00000556496 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
NRXN3-213ENST00000556496 F8P00451 2351 aa7.25□□□□□ -1.25
NRXN3-213ENST00000556496 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
NRXN3-213ENST00000556496 CKS1BP61024 79 aa7.25□□□□□ -1.25
NRXN3-213ENST00000556496 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.25□□□□□ -1.25
NRXN3-213ENST00000556496 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.24□□□□□ -1.25
NRXN3-213ENST00000556496 TRACP01848 142 aa7.24□□□□□ -1.25
NRXN3-213ENST00000556496 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.24□□□□□ -1.25
NRXN3-213ENST00000556496 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.24□□□□□ -1.25
NRXN3-213ENST00000556496 MALP21145 153 aa7.23□□□□□ -1.25
NRXN3-213ENST00000556496 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.23□□□□□ -1.25
NRXN3-213ENST00000556496 LELP1Q5T871 98 aa7.22□□□□□ -1.25
NRXN3-213ENST00000556496 CFAP161Q6P656 301 aa7.22□□□□□ -1.25
NRXN3-213ENST00000556496 KIAA0087Q14695 138 aa7.22□□□□□ -1.25
NRXN3-213ENST00000556496 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.22□□□□□ -1.25
NRXN3-213ENST00000556496 SVIPQ8NHG7 77 aa7.22□□□□□ -1.25
NRXN3-213ENST00000556496 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.21□□□□□ -1.26
NRXN3-213ENST00000556496 Q9HAA7 133 aa7.21□□□□□ -1.26
NRXN3-213ENST00000556496 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
NRXN3-213ENST00000556496 DEFB121Q5J5C9 76 aa7.21□□□□□ -1.26
NRXN3-213ENST00000556496 RETNQ9HD89 108 aa7.21□□□□□ -1.26
NRXN3-213ENST00000556496 CXCL5P42830 114 aa7.2□□□□□ -1.26
NRXN3-213ENST00000556496 KRTAP10-11P60412 298 aa7.2□□□□□ -1.26
NRXN3-213ENST00000556496 KLK12Q9UKR0 248 aa7.2□□□□□ -1.26
NRXN3-213ENST00000556496 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
NRXN3-213ENST00000556496 A0A087WYN8 130 aa7.19□□□□□ -1.26
NRXN3-213ENST00000556496 H0YGX0 51 aa7.18□□□□□ -1.26
NRXN3-213ENST00000556496 SNCGO76070 127 aa7.18□□□□□ -1.26
NRXN3-213ENST00000556496 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
NRXN3-213ENST00000556496 COX17Q14061 63 aa7.18□□□□□ -1.26
NRXN3-213ENST00000556496 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.18□□□□□ -1.26
NRXN3-213ENST00000556496 DNAL4O96015 105 aa7.18□□□□□ -1.26
NRXN3-213ENST00000556496 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.18□□□□□ -1.26
NRXN3-213ENST00000556496 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa7.17□□□□□ -1.26
NRXN3-213ENST00000556496 PRR34Q9NV39 138 aa7.17□□□□□ -1.26
NRXN3-213ENST00000556496 SPAG11BQ08648 103 aa7.17□□□□□ -1.26
NRXN3-213ENST00000556496 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.17□□□□□ -1.26
NRXN3-213ENST00000556496 C22orf24Q9Y442 160 aa7.17□□□□□ -1.26
NRXN3-213ENST00000556496 ENHOQ6UWT2 76 aa7.16□□□□□ -1.26
NRXN3-213ENST00000556496 C6orf223Q8N319 242 aa7.16□□□□□ -1.26
NRXN3-213ENST00000556496 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.16□□□□□ -1.26
NRXN3-213ENST00000556496 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
NRXN3-213ENST00000556496 A0A1B0GV72 72 aa7.15□□□□□ -1.26
NRXN3-213ENST00000556496 LECT2O14960 151 aa7.15□□□□□ -1.26
NRXN3-213ENST00000556496 C10orf25Q5T742 122 aa7.15□□□□□ -1.26
NRXN3-213ENST00000556496 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
NRXN3-213ENST00000556496 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.15□□□□□ -1.26
NRXN3-213ENST00000556496 C3orf56Q8N813 242 aa7.15□□□□□ -1.26
NRXN3-213ENST00000556496 Q6ZTC4 211 aa7.15□□□□□ -1.26
NRXN3-213ENST00000556496 NDUFC2O95298 119 aa7.14□□□□□ -1.27
NRXN3-213ENST00000556496 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa7.14□□□□□ -1.27
NRXN3-213ENST00000556496 GAGE2BQ13066 116 aa7.14□□□□□ -1.27
NRXN3-213ENST00000556496 GAGE2EQ4V326 116 aa7.14□□□□□ -1.27
NRXN3-213ENST00000556496 TTC32Q5I0X7 151 aa7.14□□□□□ -1.27
NRXN3-213ENST00000556496 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.14□□□□□ -1.27
NRXN3-213ENST00000556496 STAB1Q9NY15 2570 aa7.14□□□□□ -1.27
NRXN3-213ENST00000556496 CYSRT1A8MQ03 144 aa7.14□□□□□ -1.27
NRXN3-213ENST00000556496 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
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NRXN3-213ENST00000556496 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
NRXN3-213ENST00000556496 H3BNG1 76 aa7.13□□□□□ -1.27
NRXN3-213ENST00000556496 TMEM126AQ9H061 195 aa7.13□□□□□ -1.27
NRXN3-213ENST00000556496 ACYP1P07311 99 aa7.13□□□□□ -1.27
NRXN3-213ENST00000556496 INAFM2P0DMQ5 153 aa7.13□□□□□ -1.27
NRXN3-213ENST00000556496 Q8NDZ9 215 aa7.13□□□□□ -1.27
NRXN3-213ENST00000556496 NCR3O14931 201 aa7.12□□□□□ -1.27
NRXN3-213ENST00000556496 SLPIP03973 132 aa7.12□□□□□ -1.27
NRXN3-213ENST00000556496 A0A0J9YWU9 116 aa7.12□□□□□ -1.27
NRXN3-213ENST00000556496 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.12□□□□□ -1.27
NRXN3-213ENST00000556496 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
NRXN3-213ENST00000556496 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.1□□□□□ -1.27
NRXN3-213ENST00000556496 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.1□□□□□ -1.27
NRXN3-213ENST00000556496 MAST4O15021 2626 aa7.1□□□□□ -1.27
NRXN3-213ENST00000556496 ESRGQ1W209 222 aa7.09□□□□□ -1.27
NRXN3-213ENST00000556496 Q6Q795 121 aa7.09□□□□□ -1.27
NRXN3-213ENST00000556496 MUC7Q8TAX7 377 aa7.09□□□□□ -1.27
NRXN3-213ENST00000556496 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.09□□□□□ -1.27
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