RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556374.5

ATXN3-241, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 1,083 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-241ENST00000556374 NPC2P61916 151 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 TTC32Q5I0X7 151 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 C10orf99Q6UWK7 81 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 TMEM61Q8N0U2 210 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 RNF183Q96D59 192 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 CHCHD7Q9BUK0 85 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa3.15□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 TRAV4A0A0B4J268 109 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 LST1O00453 97 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 DNAL4O96015 105 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 CRPP02741 224 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 ACYP1P07311 99 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 RBMY1CP0DJD4 496 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 DEFB136Q30KP8 78 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 Q6Q795 121 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 TMEM86BQ8N661 226 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 C16orf74Q96GX8 76 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 TMEM243Q9BU79 118 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 Q9H8V8 135 aa3.14□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 TRGV2A0A075B6R0 118 aa3.13□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa3.13□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa3.13□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa3.13□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 COX7A2LO14548 114 aa3.13□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 INAFM2P0DMQ5 153 aa3.13□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 GAGE4Q13068 117 aa3.13□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 GAGE5Q13069 117 aa3.13□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 DEFB114Q30KQ6 69 aa3.13□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 FAM222AQ5U5X8 452 aa3.13□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 Q8N2B8 174 aa3.13□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 C11orf72Q8NBR9 251 aa3.13□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 LINC01600Q96MT4 127 aa3.13□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 LITAFQ99732 161 aa3.13□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 XCL2Q9UBD3 114 aa3.13□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa3.12□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa3.12□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa3.12□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 SMIM1B2RUZ4 78 aa3.12□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 H7C423 109 aa3.12□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 C15orf53Q8NAA6 179 aa3.12□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 LINC00308Q8TCZ7 52 aa3.12□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 CLEC2BQ92478 149 aa3.12□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 PPDPFQ9H3Y8 114 aa3.12□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa3.12□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 TENM3Q9P273 2699 aa3.12□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 MUC4Q99102 2169 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 HERC2O95714 4834 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 CCL24O00175 119 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 GAGE7O76087 117 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 TRACP01848 142 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 GAGE12FP0CL80 117 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 GAGE12GP0CL81 117 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 GAGE12IP0CL82 117 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 GAGE6Q13070 117 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 COX7B2Q8TF08 81 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 CITED1Q99966 193 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 TOMM7Q9P0U1 55 aa3.11□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 A0A0U1RRA0 63 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 A8MZ25 164 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 ATP5G1P05496 136 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 LINC00242Q5T6M2 205 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 DAND5Q8N907 189 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 CHCHD5Q9BSY4 110 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 RYR1P21817 5038 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 NOTCH3Q9UM47 2321 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 SACSQ9NZJ4 4579 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 LINC00158P58513 81 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 SS18Q15532 418 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 DEFB121Q5J5C9 76 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 Q6ZTI0 123 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 LINC00643Q86TS7 51 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 C1orf158Q8N1D5 194 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 IMUPQ9GZP8 106 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-241ENST00000556374 AGRNO00468 2067 aa3.08□□□□□ -1.92
ATXN3-241ENST00000556374 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.2 ms