RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552253.1

PTPRB-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 2,373 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-211ENST00000552253 C5orf38Q86SI9 138 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRB-211ENST00000552253 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRB-211ENST00000552253 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRB-211ENST00000552253 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRB-211ENST00000552253 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRB-211ENST00000552253 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRB-211ENST00000552253 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRB-211ENST00000552253 CHCHD5Q9BSY4 110 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRB-211ENST00000552253 TOMM7Q9P0U1 55 aa4.09□□□□□ -1.75
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PTPRB-211ENST00000552253 A0A1B0GUV1 79 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRB-211ENST00000552253 CCDC179H3BU77 68 aa4.09□□□□□ -1.76
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PTPRB-211ENST00000552253 DEFB130AP0DP74 79 aa4.09□□□□□ -1.76
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PTPRB-211ENST00000552253 Q9HAA7 133 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRB-211ENST00000552253 INAFM2P0DMQ5 153 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRB-211ENST00000552253 LINC00158P58513 81 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRB-211ENST00000552253 LINC00643Q86TS7 51 aa4.08□□□□□ -1.76
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PTPRB-211ENST00000552253 GYPEP15421 78 aa4.07□□□□□ -1.76
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PTPRB-211ENST00000552253 H0YGX0 51 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRB-211ENST00000552253 XCL1P47992 114 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRB-211ENST00000552253 Q8IZM0 81 aa4.06□□□□□ -1.76
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PTPRB-211ENST00000552253 Q8N3U1 123 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRB-211ENST00000552253 PRO0255Q9UI72 69 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRB-211ENST00000552253 ITPR2Q14571 2701 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRB-211ENST00000552253 FN1P02751 2386 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRB-211ENST00000552253 SS18Q15532 418 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRB-211ENST00000552253 C6orf226Q5I0X4 101 aa4.05□□□□□ -1.76
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PTPRB-211ENST00000552253 A0A096LPF7 62 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRB-211ENST00000552253 UQCRQO14949 82 aa4.05□□□□□ -1.76
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PTPRB-211ENST00000552253 CLPSL2Q6UWE3 100 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRB-211ENST00000552253 LINC00167Q96N53 147 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRB-211ENST00000552253 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
PTPRB-211ENST00000552253 LECT2O14960 151 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRB-211ENST00000552253 SLPIP03973 132 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRB-211ENST00000552253 LINC00269Q8N2A0 174 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRB-211ENST00000552253 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa4.03□□□□□ -1.76
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PTPRB-211ENST00000552253 C3orf22Q8N5N4 141 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRB-211ENST00000552253 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRB-211ENST00000552253 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRB-211ENST00000552253 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa4.03□□□□□ -1.76
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PTPRB-211ENST00000552253 DNAL4O96015 105 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRB-211ENST00000552253 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRB-211ENST00000552253 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRB-211ENST00000552253 C14orf132Q9NPU4 83 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRB-211ENST00000552253 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRB-211ENST00000552253 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRB-211ENST00000552253 ATOX1O00244 68 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRB-211ENST00000552253 NDUFC2O95298 119 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRB-211ENST00000552253 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRB-211ENST00000552253 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRB-211ENST00000552253 C9orf153Q5TBE3 101 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRB-211ENST00000552253 OR13C6PQ8NH95 151 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRB-211ENST00000552253 LINC00526Q96FQ7 95 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRB-211ENST00000552253 CELA1Q9UNI1 258 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRB-211ENST00000552253 NCR3O14931 201 aa4.02□□□□□ -1.77
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PTPRB-211ENST00000552253 DEFB135Q30KP9 77 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRB-211ENST00000552253 S100A7L2Q5SY68 101 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRB-211ENST00000552253 Q8NAQ8 132 aa4.02□□□□□ -1.77
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PTPRB-211ENST00000552253 UNC79Q9P2D8 2635 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRB-211ENST00000552253 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRB-211ENST00000552253 REG3AQ06141 175 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRB-211ENST00000552253 COX17Q14061 63 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRB-211ENST00000552253 C10orf25Q5T742 122 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRB-211ENST00000552253 J3QKU1 62 aa4□□□□□ -1.77
PTPRB-211ENST00000552253 C9orf66Q5T8R8 295 aa4□□□□□ -1.77
PTPRB-211ENST00000552253 Q8N814 137 aa4□□□□□ -1.77
PTPRB-211ENST00000552253 C2orf48Q96LS8 159 aa4□□□□□ -1.77
PTPRB-211ENST00000552253 A0A1B0GX51 115 aa4□□□□□ -1.77
PTPRB-211ENST00000552253 ANGP03950 147 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PTPRB-211ENST00000552253 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa4□□□□□ -1.77
PTPRB-211ENST00000552253 C6orf223Q8N319 242 aa4□□□□□ -1.77
PTPRB-211ENST00000552253 J3KT08 172 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRB-211ENST00000552253 COX7CP15954 63 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRB-211ENST00000552253 Q6JHZ5 121 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRB-211ENST00000552253 PRR34Q9NV39 138 aa3.99□□□□□ -1.77
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