RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543184.5

PRAME-214, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-214ENST00000543184 PEMTQ9UBM1 199 aa10.01□□□□□ -0.81
PRAME-214ENST00000543184 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PRAME-214ENST00000543184 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-214ENST00000543184 CRPP02741 224 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-214ENST00000543184 MALP21145 153 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-214ENST00000543184 LINC00643Q86TS7 51 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-214ENST00000543184 SPATA3Q8NHX4 192 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-214ENST00000543184 TRGV2A0A075B6R0 118 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-214ENST00000543184 A0A087WVE0 104 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-214ENST00000543184 TRACP01848 142 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-214ENST00000543184 OR13C6PQ8NH95 151 aa9.99□□□□□ -0.81
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PRAME-214ENST00000543184 CYSTM1Q9H1C7 97 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-214ENST00000543184 CLPSL2Q6UWE3 100 aa9.98□□□□□ -0.81
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PRAME-214ENST00000543184 C3orf22Q8N5N4 141 aa9.96□□□□□ -0.82
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PRAME-214ENST00000543184 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa9.94□□□□□ -0.82
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PRAME-214ENST00000543184 WFDC9Q8NEX5 89 aa9.93□□□□□ -0.82
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PRAME-214ENST00000543184 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa9.92□□□□□ -0.82
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PRAME-214ENST00000543184 PF4P02776 101 aa9.88□□□□□ -0.83
PRAME-214ENST00000543184 CXCL5P42830 114 aa9.88□□□□□ -0.83
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PRAME-214ENST00000543184 Q8N3U1 123 aa9.87□□□□□ -0.83
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PRAME-214ENST00000543184 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-214ENST00000543184 FHL2Q14192 279 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-214ENST00000543184 SS18Q15532 418 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-214ENST00000543184 LINC01561Q8N1V8 128 aa9.85□□□□□ -0.83
PRAME-214ENST00000543184 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa9.84□□□□□ -0.83
PRAME-214ENST00000543184 A0A087WZ39 114 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAME-214ENST00000543184 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAME-214ENST00000543184 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-214ENST00000543184 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
PRAME-214ENST00000543184 C16orf74Q96GX8 76 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-214ENST00000543184 H0YGX0 51 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-214ENST00000543184 DEFB4AO15263 64 aa9.81□□□□□ -0.84
PRAME-214ENST00000543184 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PRAME-214ENST00000543184 C5orf47Q569G3 176 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-214ENST00000543184 OXLD1Q5BKU9 147 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-214ENST00000543184 SMIM9A6NGZ8 99 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-214ENST00000543184 GYPEP15421 78 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-214ENST00000543184 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-214ENST00000543184 Q8NDZ9 215 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-214ENST00000543184 CMYA5Q8N3K9 4069 aa9.8□□□□□ -0.84
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PRAME-214ENST00000543184 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
PRAME-214ENST00000543184 ORMDL1Q9P0S3 153 aa9.8□□□□□ -0.84
PRAME-214ENST00000543184 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa9.79□□□□□ -0.84
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PRAME-214ENST00000543184 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-214ENST00000543184 DSCR8Q96T75 97 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-214ENST00000543184 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-214ENST00000543184 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PRAME-214ENST00000543184 C19orf73Q9NVV2 129 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-214ENST00000543184 TRAV25A0A0B4J276 109 aa9.77□□□□□ -0.84
PRAME-214ENST00000543184 CRYGAP11844 174 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-214ENST00000543184 Q6JHZ5 121 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-214ENST00000543184 LINC00269Q8N2A0 174 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-214ENST00000543184 LINC00482Q8N8I6 264 aa9.77□□□□□ -0.85
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