RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541990.5

THBS3-211, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 2,928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-211ENST00000541990 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 MALP21145 153 aa6.46□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 XCL2Q9UBD3 114 aa6.46□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.46□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 F5H768 121 aa6.46□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 IGKV2D-28P01615 120 aa6.46□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.45□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.45□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 OXTP01178 125 aa6.45□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.45□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 MAP6D1Q9H9H5 199 aa6.45□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 LINC00846Q9NV44 126 aa6.45□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 ZNF415Q09FC8 603 aa6.44□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 SLPIP03973 132 aa6.44□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 CRYGAP11844 174 aa6.44□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 CXCL5P42830 114 aa6.44□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.44□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.43□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.43□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.43□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 NCR3O14931 201 aa6.43□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.43□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.43□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 DSCR8Q96T75 97 aa6.43□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.43□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 DNAL4O96015 105 aa6.42□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.42□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 CRPP02741 224 aa6.42□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.42□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.42□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.41□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.41□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 ATOX1O00244 68 aa6.41□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 LECT2O14960 151 aa6.41□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 WFDC9Q8NEX5 89 aa6.41□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.41□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 UPK3BQ9BT76 320 aa6.4□□□□□ -1.38
THBS3-211ENST00000541990 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.39□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 Q6ZTI0 123 aa6.39□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 A8MTW9 85 aa6.39□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 DEFB4AO15263 64 aa6.39□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 CCL18P55774 89 aa6.39□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.39□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 SS18Q15532 418 aa6.39□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.39□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 STHQ8IWL8 128 aa6.39□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 IGLV1-51P01701 117 aa6.38□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 PFN2P35080 140 aa6.38□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 LINC00158P58513 81 aa6.38□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 DPH3Q96FX2 82 aa6.38□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 USP17L23D6RBM5 183 aa6.38□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.38□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 TENM3Q9P273 2699 aa6.37□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 COX7B2Q8TF08 81 aa6.37□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 COPS9Q8WXC6 57 aa6.37□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 K7EQD1 137 aa6.37□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 TMEM258P61165 79 aa6.37□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 C4orf26Q17RF5 130 aa6.37□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 Q6JHZ5 121 aa6.37□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 DNHD1Q96M86 4753 aa6.37□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 INSP01308 110 aa6.36□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 SERP2Q8N6R1 65 aa6.36□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.36□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.36□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.36□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 FHL2Q14192 279 aa6.36□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 MDFIQ99750 246 aa6.36□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 PAX4O43316 350 aa6.35□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.35□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 IL17DQ8TAD2 202 aa6.34□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.34□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 UBE2L6O14933 153 aa6.34□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.34□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
THBS3-211ENST00000541990 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.34□□□□□ -1.4
THBS3-211ENST00000541990 TMEM243Q9BU79 118 aa6.33□□□□□ -1.4
THBS3-211ENST00000541990 Q5XG85 94 aa6.33□□□□□ -1.4
THBS3-211ENST00000541990 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.32□□□□□ -1.4
THBS3-211ENST00000541990 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.32□□□□□ -1.4
THBS3-211ENST00000541990 GHRHP01286 108 aa6.32□□□□□ -1.4
THBS3-211ENST00000541990 KRTAP10-11P60412 298 aa6.32□□□□□ -1.4
THBS3-211ENST00000541990 DEFB135Q30KP9 77 aa6.32□□□□□ -1.4
THBS3-211ENST00000541990 ENHOQ6UWT2 76 aa6.32□□□□□ -1.4
THBS3-211ENST00000541990 H0YGX0 51 aa6.31□□□□□ -1.4
THBS3-211ENST00000541990 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
THBS3-211ENST00000541990 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.31□□□□□ -1.4
THBS3-211ENST00000541990 RETNQ9HD89 108 aa6.31□□□□□ -1.4
THBS3-211ENST00000541990 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.3□□□□□ -1.4
THBS3-211ENST00000541990 CCKP06307 115 aa6.3□□□□□ -1.4
THBS3-211ENST00000541990 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.3□□□□□ -1.4
THBS3-211ENST00000541990 MRAPQ8TCY5 172 aa6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms