RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRR3P79522 188 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 Q6ZRP5 223 aa11.94□□□□□ -0.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 ODF1Q14990 250 aa11.93□□□□□ -0.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 GAGE2EQ4V326 116 aa11.93□□□□□ -0.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 GAGE2DQ9UEU5 116 aa11.93□□□□□ -0.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRSS2P07478 247 aa11.92□□□□□ -0.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRTAP10-8P60410 259 aa11.92□□□□□ -0.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 SEC11AP67812 179 aa11.92□□□□□ -0.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 YPEL4Q96NS1 127 aa11.92□□□□□ -0.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 A0A096LNJ9 63 aa11.91□□□□□ -0.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM168BA1KXE4 195 aa11.91□□□□□ -0.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 TLX1NBP0CAT3 122 aa11.91□□□□□ -0.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 LINC00469Q8N7U9 141 aa11.91□□□□□ -0.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 CST9LQ9H4G1 147 aa11.91□□□□□ -0.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa11.9□□□□□ -0.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 LINC01549A6NIU2 74 aa11.9□□□□□ -0.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 LINC00614P0C842 121 aa11.9□□□□□ -0.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 PMCHL1Q16048 86 aa11.9□□□□□ -0.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 C6orf226Q5I0X4 101 aa11.9□□□□□ -0.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
CD27-AS1-208ENST00000538616 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa11.89□□□□□ -0.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 PMVKQ15126 192 aa11.89□□□□□ -0.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 REG3GQ6UW15 175 aa11.89□□□□□ -0.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 Q8IZM0 81 aa11.89□□□□□ -0.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa11.89□□□□□ -0.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 CKS1BP61024 79 aa11.88□□□□□ -0.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 CBLN2Q8IUK8 224 aa11.88□□□□□ -0.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 SMIM1B2RUZ4 78 aa11.86□□□□□ -0.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 NDUFA6P56556 154 aa11.86□□□□□ -0.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa11.85□□□□□ -0.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa11.85□□□□□ -0.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 HBDP02042 147 aa11.85□□□□□ -0.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 SPINK8P0C7L1 97 aa11.85□□□□□ -0.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa11.85□□□□□ -0.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa11.84□□□□□ -0.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 SPINK6Q6UWN8 80 aa11.84□□□□□ -0.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa11.84□□□□□ -0.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 A0A0U1RQV1 116 aa11.83□□□□□ -0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 PDZD11Q5EBL8 140 aa11.83□□□□□ -0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 RAB5BP61020 215 aa11.82□□□□□ -0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa11.82□□□□□ -0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 COX7B2Q8TF08 81 aa11.82□□□□□ -0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 F8VRH5 84 aa11.81□□□□□ -0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 IGLC3P0DOY3 106 aa11.8□□□□□ -0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP11.8□□□□□ -0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 C1orf137Q5JT78 98 aa11.79□□□□□ -0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 XAGE1AQ9HD64 81 aa11.79□□□□□ -0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 MUC2Q02817 5179 aa11.79□□□□□ -0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 M0QXV9 152 aa11.78□□□□□ -0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 CXCL5P42830 114 aa11.78□□□□□ -0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 H3BRM9 83 aa11.77□□□□□ -0.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 ATP5LO75964 103 aa11.77□□□□□ -0.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 BAGE3Q86Y29 109 aa11.77□□□□□ -0.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 LPAP08519 4548 aa11.76□□□□□ -0.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRGC2P03986 189 aa11.76□□□□□ -0.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 C11orf86A6NJI1 115 aa11.74□□□□□ -0.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 UBE2BP63146 152 aa11.73□□□□□ -0.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM19A2Q8N3H0 131 aa11.73□□□□□ -0.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa11.72□□□□□ -0.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 IGLV7-43P04211 117 aa11.71□□□□□ -0.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMEM170BQ5T4T1 132 aa11.71□□□□□ -0.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 IFI27L1Q96BM0 104 aa11.71□□□□□ -0.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 C22orf24Q9Y442 160 aa11.71□□□□□ -0.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 HSBP1O75506 76 aa11.69□□□□□ -0.54
CD27-AS1-208ENST00000538616 COLCA2A8K830 154 aa11.68□□□□□ -0.54
CD27-AS1-208ENST00000538616 PFN2P35080 140 aa11.67□□□□□ -0.54
CD27-AS1-208ENST00000538616 LINC00310P59036 64 aa11.67□□□□□ -0.54
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAT4Q6V0I7 4981 aa11.67□□□□□ -0.54
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa11.66□□□□□ -0.54
CD27-AS1-208ENST00000538616 SERF1AO75920 110 aa11.66□□□□□ -0.54
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CD27-AS1-208ENST00000538616 H0Y8G0 127 aa11.64□□□□□ -0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 NUPR1O60356 82 aa11.64□□□□□ -0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 SCO1O75880 301 aa11.64□□□□□ -0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMEM223A0PJW6 202 aa11.63□□□□□ -0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 ERG28Q9UKR5 140 aa11.63□□□□□ -0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 DIRC1Q969H9 104 aa11.62□□□□□ -0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 TP73-AS1Q9UF72 201 aa11.62□□□□□ -0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 GAGE10A6NGK3 116 aa11.61□□□□□ -0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 RPL37AP8A6NKH3 93 aa11.61□□□□□ -0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 LINC00167Q96N53 147 aa11.61□□□□□ -0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 H0Y9J4 135 aa11.6□□□□□ -0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 LEPROTL1O95214 131 aa11.6□□□□□ -0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 FABP4P15090 132 aa11.59□□□□□ -0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa11.59□□□□□ -0.55
CD27-AS1-208ENST00000538616 NKAPP1Q8N9T2 125 aa11.58□□□□□ -0.56
CD27-AS1-208ENST00000538616 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa11.57□□□□□ -0.56
CD27-AS1-208ENST00000538616 A0A0U1RRA0 63 aa11.56□□□□□ -0.56
CD27-AS1-208ENST00000538616 COX17Q14061 63 aa11.56□□□□□ -0.56
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF861PO60384 105 aa11.55□□□□□ -0.56
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRR26Q8N8Z3 221 aa11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms