RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532928.1

DDX25-208, Transcript of DEAD-box helicase 25, human

TSL 3

Gene DDX25, Length 726 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX25-208	ENST00000532928	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928		A0A096LNJ9	63 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	G0S2	P27469	103 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		4.64	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928		M0QXV9	152 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	NDUFA1	O15239	70 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	UBE2D1	P51668	147 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	UBE2B	P63146	152 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	ERAS	Q7Z444	233 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	TIMM17A	Q99595	171 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	LINC01549	A6NIU2	74 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	TSPAN13	O95857	204 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	S100A1	P23297	94 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	RAB5B	P61020	215 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	C2orf82	Q6UX34	121 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	FA2H	Q7L5A8	372 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	TMEM141	Q96I45	108 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	VCX2	Q9H322	139 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	NUPR1	O60356	82 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	LINC00310	P59036	64 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	CST9L	Q9H4G1	147 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	ATP6V1G1	O75348	118 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		4.6	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928		F8WDY8	70 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	PMCHL1	Q16048	86 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		4.59	□□□□□ -1.67
DDX25-208	ENST00000532928		A0A087X002	238 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928		A0A0U1RQV1	116 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	HBD	P02042	147 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	PMVK	Q15126	192 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	BAGE3	Q86Y29	109 aa		4.58	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	ZNF861P	O60384	105 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	HIST1H2BK	O60814	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	SERF1A	O75920	110 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	ATP5L	O75964	103 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	HIST1H2BO	P23527	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	HIST1H2BB	P33778	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	HIST1H2BD	P58876	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	HIST1H2BC	P62807	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928		Q6ZN92	141 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	SEC11A	P67812	179 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	C22orf24	Q9Y442	160 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	MUC17	Q685J3	4493 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	HSBP1	O75506	76 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	IGLC3	P0DOY3	106 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	HERVK_113	P63121	156 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	PRSS2	P07478	247 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	NDUFA6	P56556	154 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	CKS1B	P61024	79 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		4.53	□□□□□ -1.68
DDX25-208	ENST00000532928	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DDX25-208	ENST00000532928	GAGE10	A6NGK3	116 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DDX25-208	ENST00000532928	C11orf86	A6NJI1	115 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DDX25-208	ENST00000532928	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.52	□□□□□ -1.69
DDX25-208	ENST00000532928	BCE1	O60756	84 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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