RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527333.5

CKAP5-208, Transcript of cytoskeleton associated protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene CKAP5, Length 498 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5-208ENST00000527333 A0A0J9YXY3 114 aa6.14□□□□□ -1.43
CKAP5-208ENST00000527333 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.14□□□□□ -1.43
CKAP5-208ENST00000527333 UBE2L6O14933 153 aa6.14□□□□□ -1.43
CKAP5-208ENST00000527333 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.14□□□□□ -1.43
CKAP5-208ENST00000527333 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.14□□□□□ -1.43
CKAP5-208ENST00000527333 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.14□□□□□ -1.43
CKAP5-208ENST00000527333 APLNQ9ULZ1 77 aa6.14□□□□□ -1.43
CKAP5-208ENST00000527333 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.13□□□□□ -1.43
CKAP5-208ENST00000527333 IGHV3-30P01768 117 aa6.13□□□□□ -1.43
CKAP5-208ENST00000527333 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.13□□□□□ -1.43
CKAP5-208ENST00000527333 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
CKAP5-208ENST00000527333 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
CKAP5-208ENST00000527333 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.13□□□□□ -1.43
CKAP5-208ENST00000527333 C3orf84H3BNL1 204 aa6.12□□□□□ -1.43
CKAP5-208ENST00000527333 H3BRM9 83 aa6.12□□□□□ -1.43
CKAP5-208ENST00000527333 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CKAP5-208ENST00000527333 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.12□□□□□ -1.43
CKAP5-208ENST00000527333 PRR34Q9NV39 138 aa6.12□□□□□ -1.43
CKAP5-208ENST00000527333 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.12□□□□□ -1.43
CKAP5-208ENST00000527333 A0A087WZ39 114 aa6.11□□□□□ -1.43
CKAP5-208ENST00000527333 NDUFA1O15239 70 aa6.11□□□□□ -1.43
CKAP5-208ENST00000527333 ESRGQ1W209 222 aa6.11□□□□□ -1.43
CKAP5-208ENST00000527333 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.11□□□□□ -1.43
CKAP5-208ENST00000527333 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.11□□□□□ -1.43
CKAP5-208ENST00000527333 CCL25O15444 150 aa6.1□□□□□ -1.43
CKAP5-208ENST00000527333 TIMM17BO60830 172 aa6.1□□□□□ -1.43
CKAP5-208ENST00000527333 CCL18P55774 89 aa6.1□□□□□ -1.43
CKAP5-208ENST00000527333 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.1□□□□□ -1.43
CKAP5-208ENST00000527333 TMEM262E9PQX1 116 aa6.09□□□□□ -1.43
CKAP5-208ENST00000527333 KIAA0087Q14695 138 aa6.09□□□□□ -1.43
CKAP5-208ENST00000527333 CASC10Q5T4H9 136 aa6.09□□□□□ -1.43
CKAP5-208ENST00000527333 ENHOQ6UWT2 76 aa6.09□□□□□ -1.43
CKAP5-208ENST00000527333 HIST1H4GQ99525 98 aa6.09□□□□□ -1.43
CKAP5-208ENST00000527333 UPK3BQ9BT76 320 aa6.09□□□□□ -1.43
CKAP5-208ENST00000527333 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.09□□□□□ -1.43
CKAP5-208ENST00000527333 SPANXCQ9NY87 97 aa6.09□□□□□ -1.43
CKAP5-208ENST00000527333 LYSTQ99698 3801 aa6.08□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.08□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.08□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.08□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 A6NDN8 102 aa6.07□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 K7ERJ3 54 aa6.07□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 CFC1BP0CG36 223 aa6.07□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 CFC1P0CG37 223 aa6.07□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 SMIM13P0DJ93 91 aa6.07□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 REG3AQ06141 175 aa6.07□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.07□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 C5orf38Q86SI9 138 aa6.07□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.07□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.07□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.07□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 Q9H8V8 135 aa6.07□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.06□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 SS18Q15532 418 aa6.06□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 COX7B2Q8TF08 81 aa6.06□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.05□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 MIAQ16674 131 aa6.05□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.05□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.05□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.05□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.05□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 A4D1N5 150 aa6.04□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 TMEM238C9JI98 176 aa6.04□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 XCL1P47992 114 aa6.04□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 HERV-K104P63124 156 aa6.04□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 KLK12Q9UKR0 248 aa6.04□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 A0A0B4J2C4 111 aa6.03□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 A0A1W2PPM0 123 aa6.03□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 H3BUT2 72 aa6.03□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 IFITM1P13164 125 aa6.03□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 UBE2V1Q13404 147 aa6.03□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 Q8IZM0 81 aa6.03□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 RAB37Q96AX2 223 aa6.03□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CKAP5-208ENST00000527333 IGHV3-33P01772 117 aa6.02□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.02□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.02□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.01□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.01□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 COX7A2LO14548 114 aa6.01□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 TSPAN13O95857 204 aa6.01□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 K7EP34 96 aa6□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 TTC32Q5I0X7 151 aa6□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 ARL17AQ8IVW1 177 aa6□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 DAND5Q8N907 189 aa6□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 KMT2AQ03164 3969 aa6□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 APOMO95445 188 aa5.99□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 C2orf82Q6UX34 121 aa5.99□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 UBE2WQ96B02 151 aa5.99□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 TOMM7Q9P0U1 55 aa5.99□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 PRO1854Q9UHT4 67 aa5.99□□□□□ -1.45
CKAP5-208ENST00000527333 DNAH2Q9P225 4427 aa5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 134.2 ms