RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520837.5

TSPAN18-208, Transcript of tetraspanin 18, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN18, Length 565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18-208ENST00000520837 TMEM223A0PJW6 202 aa6.29□□□□□ -1.4
TSPAN18-208ENST00000520837 SPINK8P0C7L1 97 aa6.29□□□□□ -1.4
TSPAN18-208ENST00000520837 COX8AP10176 69 aa6.29□□□□□ -1.4
TSPAN18-208ENST00000520837 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
TSPAN18-208ENST00000520837 XCL1P47992 114 aa6.29□□□□□ -1.4
TSPAN18-208ENST00000520837 REG3AQ06141 175 aa6.29□□□□□ -1.4
TSPAN18-208ENST00000520837 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.29□□□□□ -1.4
TSPAN18-208ENST00000520837 Q8N3U1 123 aa6.29□□□□□ -1.4
TSPAN18-208ENST00000520837 UBE2WQ96B02 151 aa6.29□□□□□ -1.4
TSPAN18-208ENST00000520837 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.29□□□□□ -1.4
TSPAN18-208ENST00000520837 PKHD1P08F94 4074 aa6.29□□□□□ -1.4
TSPAN18-208ENST00000520837 E9PLD3 99 aa6.28□□□□□ -1.4
TSPAN18-208ENST00000520837 LEPROTO15243 131 aa6.28□□□□□ -1.4
TSPAN18-208ENST00000520837 SEC61GP60059 68 aa6.28□□□□□ -1.4
TSPAN18-208ENST00000520837 COX6A2Q02221 97 aa6.28□□□□□ -1.4
TSPAN18-208ENST00000520837 Q6ZR54 194 aa6.28□□□□□ -1.4
TSPAN18-208ENST00000520837 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.28□□□□□ -1.4
TSPAN18-208ENST00000520837 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.27□□□□□ -1.4
TSPAN18-208ENST00000520837 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.27□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.27□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.27□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 J3QQQ9 107 aa6.27□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 SIVA1O15304 175 aa6.27□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.27□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 Q75L30 129 aa6.27□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.27□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 PCP2Q8IVA1 136 aa6.27□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.26□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.26□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.26□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 ZNF815PA8K554 130 aa6.26□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 COX7A2LO14548 114 aa6.26□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 RTL8CO15255 209 aa6.26□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 TTC32Q5I0X7 151 aa6.26□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.26□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 C5orf38Q86SI9 138 aa6.26□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 C6orf223Q8N319 242 aa6.26□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 UPK3BQ9BT76 320 aa6.26□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.25□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.25□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.25□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.25□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 MIAQ16674 131 aa6.25□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.25□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.25□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 PRSS2P07478 247 aa6.24□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 VAMP3Q15836 100 aa6.24□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 LINC01620Q4KN68 170 aa6.24□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.24□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 ENHOQ6UWT2 76 aa6.24□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.24□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.24□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.24□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 PRR34Q9NV39 138 aa6.24□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.24□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 A0A087WZ39 114 aa6.23□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.23□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 A6NDN8 102 aa6.23□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.23□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 APOMO95445 188 aa6.23□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.23□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 COX7B2Q8TF08 81 aa6.23□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 RMI2Q96E14 147 aa6.23□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 Q9HAA7 133 aa6.23□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.23□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.22□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.22□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.22□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.22□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.22□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.22□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.22□□□□□ -1.41
TSPAN18-208ENST00000520837 K7ERU9 68 aa6.21□□□□□ -1.42
TSPAN18-208ENST00000520837 TAX1BP3O14907 124 aa6.21□□□□□ -1.42
TSPAN18-208ENST00000520837 FOXI1Q12951 378 aa6.21□□□□□ -1.42
TSPAN18-208ENST00000520837 RYR1P21817 5038 aa6.2□□□□□ -1.42
TSPAN18-208ENST00000520837 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.2□□□□□ -1.42
TSPAN18-208ENST00000520837 CKS1BP61024 79 aa6.2□□□□□ -1.42
TSPAN18-208ENST00000520837 HSD52Q0P140 79 aa6.2□□□□□ -1.42
TSPAN18-208ENST00000520837 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
TSPAN18-208ENST00000520837 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
TSPAN18-208ENST00000520837 HIST1H4GQ99525 98 aa6.2□□□□□ -1.42
TSPAN18-208ENST00000520837 HIGD1BQ9P298 99 aa6.2□□□□□ -1.42
TSPAN18-208ENST00000520837 A0A1B0GVY2 172 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN18-208ENST00000520837 NDUFA1O15239 70 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN18-208ENST00000520837 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
TSPAN18-208ENST00000520837 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.19□□□□□ -1.42
TSPAN18-208ENST00000520837 SPAG11BQ08648 103 aa6.18□□□□□ -1.42
TSPAN18-208ENST00000520837 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.18□□□□□ -1.42
TSPAN18-208ENST00000520837 SFTA2Q6UW10 78 aa6.18□□□□□ -1.42
TSPAN18-208ENST00000520837 A0A0J9YXY3 114 aa6.17□□□□□ -1.42
TSPAN18-208ENST00000520837 TMEM238C9JI98 176 aa6.17□□□□□ -1.42
TSPAN18-208ENST00000520837 Q8IZM0 81 aa6.17□□□□□ -1.42
TSPAN18-208ENST00000520837 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
TSPAN18-208ENST00000520837 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.17□□□□□ -1.42
TSPAN18-208ENST00000520837 PSCAO43653 123 aa6.16□□□□□ -1.42
TSPAN18-208ENST00000520837 CXCL5P42830 114 aa6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms