RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 COX6CP09669 75 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 FDCSPQ8NFU4 85 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 USMG5Q96IX5 58 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 MANBALQ9NQG1 85 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 CHD1O14646 1710 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 LAMA5O15230 3695 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-377P-201ENST00000515965 ARHGAP5Q13017 1502 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 NLRP1Q9C000 1473 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 MXRA5Q9NR99 2828 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPRR2AP35326 72 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRO1854Q9UHT4 67 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 PKD1P98161 4303 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 MAPKBP1O60336 1514 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 SNAPC5O75971 98 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 A0A1B0GWA3 101 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 NAP1L6A6NFF2 107 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRAPPC2P0DI81 140 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRAPPC2BP0DI82 140 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 SFTA2Q6UW10 78 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 LINC00846Q9NV44 126 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 COL4A6Q14031 1691 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 DLEU1O43261 78 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 GNG4P50150 75 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 REV3LO60673 3130 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 PCLOQ9Y6V0 5065 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAT1Q14517 4588 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 PZPP20742 1482 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCDC141Q6ZP82 1450 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 EFCAB10A6NFE3 127 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 SEC11AP67812 179 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 C12orf57Q99622 126 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 H3BQ15 152 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 PPP3R1P63098 170 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 SVBPQ8N300 66 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 APLNQ9ULZ1 77 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-377P-201ENST00000515965 A0A1B0GV90 55 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-377P-201ENST00000515965 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-377P-201ENST00000515965 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-377P-201ENST00000515965 CORTO00230 105 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-377P-201ENST00000515965 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-377P-201ENST00000515965 DNAH6Q9C0G6 4158 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-377P-201ENST00000515965 A0A087WVE0 104 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-377P-201ENST00000515965 DEFB135Q30KP9 77 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-377P-201ENST00000515965 EPG5Q9HCE0 2579 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-377P-201ENST00000515965 LRRC37AA6NMS7 1700 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-377P-201ENST00000515965 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-377P-201ENST00000515965 A0A1B0GU69 56 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPRR2EP22531 72 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-377P-201ENST00000515965 AKAP13Q12802 2813 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-377P-201ENST00000515965 ABCA3Q99758 1704 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-377P-201ENST00000515965 SHPRHQ149N8 1683 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLIT1O75093 1534 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-377P-201ENST00000515965 CGREF1Q99674 301 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRANK1O15050 2925 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPTBN4Q9H254 2564 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-377P-201ENST00000515965 KRTDAPP60985 99 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-377P-201ENST00000515965 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-377P-201ENST00000515965 C6orf201Q7Z4U5 140 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-377P-201ENST00000515965 NBASA2RRP1 2371 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM135AQ9P2D6 1515 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-377P-201ENST00000515965 C2orf88Q9BSF0 95 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-377P-201ENST00000515965 ANKRD36A6QL64 1941 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-377P-201ENST00000515965 KNDC1Q76NI1 1749 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-377P-201ENST00000515965 ABCC5O15440 1437 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.55
RNU6-377P-201ENST00000515965 hADV29S1A0JD25 119 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 S100A1P23297 94 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 SNCAP37840 140 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 CRIPTQ9P021 101 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 KNL1Q8NG31 2342 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 CUX1P39880 1505 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM262E9PQX1 116 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 H0Y9P7 68 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 H3BQF6 201 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 I3L3M4 83 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 HSD52Q0P140 79 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 C9orf62Q8N4C0 152 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM203Q969S6 136 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAT3Q8TDW7 4589 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 STARD9Q9P2P6 4700 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 C7orf77A4D0Y5 90 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 GNG8Q9UK08 70 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPG11Q96JI7 2443 aa-0.93□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms