RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 ANGP03950 147 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 RBX1P62877 108 aa4.94□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 SS18Q15532 418 aa4.94□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 LINC00173Q6ZV60 143 aa4.94□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa4.94□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 F8VRH5 84 aa4.93□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 SIVA1O15304 175 aa4.93□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 IGKCP01834 107 aa4.93□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 SMIM6P0DI80 62 aa4.93□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 HERVK_113P61574 105 aa4.93□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 LINC01545Q5VT33 79 aa4.93□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 Q6ZUT4 128 aa4.93□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 C10orf126Q8N4M7 172 aa4.93□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 AMELXQ99217 191 aa4.93□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 APLNQ9ULZ1 77 aa4.93□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa4.92□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 H3BRM9 83 aa4.92□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 MPV17L2Q567V2 206 aa4.92□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 LINC01556Q5JQF7 62 aa4.92□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 Q8N976 141 aa4.92□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 UPK3BQ9BT76 320 aa4.92□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 LINC00588Q9Y4M8 146 aa4.92□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa4.91□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa4.91□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa4.91□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa4.91□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 IGHV3-30P01768 117 aa4.91□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 IGHV3-33P01772 117 aa4.91□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 DNAH10OSP0CZ25 163 aa4.91□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa4.91□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa4.91□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 HERVK_113P63121 156 aa4.91□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 TTC32Q5I0X7 151 aa4.91□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa4.91□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 LINC00269Q8N2A0 174 aa4.91□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 RMI2Q96E14 147 aa4.91□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 VAMP8Q9BV40 100 aa4.91□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 KLK12Q9UKR0 248 aa4.91□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 PKD1P98161 4303 aa4.91□□□□□ -1.62
HERC3-210ENST00000512194 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa4.9□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 IGLC3P0DOY3 106 aa4.9□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 UBE2D1P51668 147 aa4.9□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 REG3AQ06141 175 aa4.9□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 MIAQ16674 131 aa4.9□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 PYY3Q5JQD4 70 aa4.9□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 TMEM170BQ5T4T1 132 aa4.9□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 WFDC10BQ8IUB3 73 aa4.9□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 UBE2WQ96B02 151 aa4.9□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 PMCHL2Q9BQD1 86 aa4.9□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 CHAC1Q9BUX1 264 aa4.9□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 A0A0J9YXV3 536 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 C11orf86A6NJI1 115 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 HERV-K104P63124 156 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 LINC00469Q8N7U9 141 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 APOMO95445 188 aa4.88□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 LY6G6CO95867 125 aa4.88□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 CLPSL2Q6UWE3 100 aa4.88□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 ATOH7Q8N100 152 aa4.88□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 C12orf57Q99622 126 aa4.88□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 PRR34Q9NV39 138 aa4.88□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa4.87□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 NDUFAF8A1L188 74 aa4.87□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa4.87□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 COX7A2LO14548 114 aa4.87□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 XCL1P47992 114 aa4.87□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 SPATA45Q537H7 98 aa4.87□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 LINC00242Q5T6M2 205 aa4.87□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 LINC01561Q8N1V8 128 aa4.87□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 FAM104AQ969W3 186 aa4.87□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 PLEKHB2Q96CS7 222 aa4.87□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa4.86□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 LINC00518Q8N0U6 118 aa4.86□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa4.85□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 TMEM223A0PJW6 202 aa4.85□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 E9PLD3 99 aa4.85□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 TSTD3H0UI37 97 aa4.85□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 LEPROTO15243 131 aa4.85□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 NMUP48645 174 aa4.85□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 COX6A2Q02221 97 aa4.85□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 SFTA2Q6UW10 78 aa4.85□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 ENHOQ6UWT2 76 aa4.85□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 C5orf38Q86SI9 138 aa4.85□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 Q9HAA7 133 aa4.85□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa4.85□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 APOBP04114 4563 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 LRP1BQ9NZR2 4599 aa4.85□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa4.84□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa4.84□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa4.84□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 PSCAO43653 123 aa4.84□□□□□ -1.63
HERC3-210ENST00000512194 SPINK8P0C7L1 97 aa4.84□□□□□ -1.63
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