RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		7.82	□□□□□ -1.16
SH3BP2-222	ENST00000512014	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		7.82	□□□□□ -1.16
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		7.81	□□□□□ -1.16
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		7.81	□□□□□ -1.16
SH3BP2-222	ENST00000512014	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		7.81	□□□□□ -1.16
SH3BP2-222	ENST00000512014	LINC01600	Q96MT4	127 aa		7.81	□□□□□ -1.16
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A096LNJ9	63 aa		7.8	□□□□□ -1.16
SH3BP2-222	ENST00000512014	G0S2	P27469	103 aa		7.8	□□□□□ -1.16
SH3BP2-222	ENST00000512014	HERVK_113	P63121	156 aa		7.8	□□□□□ -1.16
SH3BP2-222	ENST00000512014	GAGE2E	Q4V326	116 aa		7.8	□□□□□ -1.16
SH3BP2-222	ENST00000512014	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	7.8	□□□□□ -1.16
SH3BP2-222	ENST00000512014	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		7.8	□□□□□ -1.16
SH3BP2-222	ENST00000512014	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		7.8	□□□□□ -1.16
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		7.79	□□□□□ -1.16
SH3BP2-222	ENST00000512014	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		7.79	□□□□□ -1.16
SH3BP2-222	ENST00000512014	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		7.79	□□□□□ -1.16
SH3BP2-222	ENST00000512014		Q8IZM0	81 aa		7.79	□□□□□ -1.16
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRTAP10-8	P60410	259 aa		7.78	□□□□□ -1.16
SH3BP2-222	ENST00000512014	ODF1	Q14990	250 aa		7.78	□□□□□ -1.16
SH3BP2-222	ENST00000512014	CST9L	Q9H4G1	147 aa		7.78	□□□□□ -1.16
SH3BP2-222	ENST00000512014	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		7.78	□□□□□ -1.16
SH3BP2-222	ENST00000512014	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		7.77	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		7.77	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	SEC11A	P67812	179 aa		7.77	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	7.77	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		7.77	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	7.77	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	7.77	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		7.76	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	FA2H	Q7L5A8	372 aa		7.76	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	LINC01549	A6NIU2	74 aa		7.75	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRSS2	P07478	247 aa		7.75	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAB5B	P61020	215 aa		7.75	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	PMVK	Q15126	192 aa		7.75	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	C1orf137	Q5JT78	98 aa		7.75	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		7.75	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		7.75	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014		M0QXV9	152 aa		7.74	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	CKS1B	P61024	79 aa		7.74	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	BAGE3	Q86Y29	109 aa		7.74	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRP2	P98164	4655 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014		F8VRH5	84 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	HIST1H2BK	O60814	126 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGLV7-43	P04211	117 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	HIST1H2BO	P23527	126 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	HIST1H2BB	P33778	126 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	HIST1H2BD	P58876	126 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	HIST1H2BC	P62807	126 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	7.73	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	REG3G	Q6UW15	175 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		7.72	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPINK8	P0C7L1	97 aa		7.72	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	LINC00614	P0C842	121 aa		7.72	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	PMCHL1	Q16048	86 aa		7.72	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	COX7B2	Q8TF08	81 aa		7.72	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		7.72	□□□□□ -1.17
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGLC3	P0DOY3	106 aa		7.71	□□□□□ -1.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	CXCL5	P42830	114 aa		7.71	□□□□□ -1.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	NDUFA6	P56556	154 aa		7.71	□□□□□ -1.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		7.7	□□□□□ -1.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	C22orf24	Q9Y442	160 aa		7.7	□□□□□ -1.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	SERF1A	O75920	110 aa		7.69	□□□□□ -1.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	HBD	P02042	147 aa		7.69	□□□□□ -1.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	S100A6	P06703	90 aa		7.69	□□□□□ -1.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	7.69	□□□□□ -1.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	7.69	□□□□□ -1.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	HSBP1	O75506	76 aa		7.68	□□□□□ -1.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
SH3BP2-222	ENST00000512014		H0Y9J4	135 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	UBE2B	P63146	152 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	DIRC1	Q969H9	104 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	C11orf86	A6NJI1	115 aa		7.66	□□□□□ -1.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	7.66	□□□□□ -1.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		7.66	□□□□□ -1.18
SH3BP2-222	ENST00000512014		H3BRM9	83 aa		7.65	□□□□□ -1.18
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		7.64	□□□□□ -1.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	NUPR1	O60356	82 aa		7.64	□□□□□ -1.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATP5L	O75964	103 aa		7.64	□□□□□ -1.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	7.64	□□□□□ -1.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		7.64	□□□□□ -1.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		7.64	□□□□□ -1.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	LINC00310	P59036	64 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	LINC00167	Q96N53	147 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	LPA	P08519	4548 aa		7.63	□□□□□ -1.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF861P	O60384	105 aa		7.62	□□□□□ -1.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	7.62	□□□□□ -1.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	FABP4	P15090	132 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	S100A2	P29034	98 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP2-222	ENST00000512014		Q8NDZ9	215 aa		7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		7.6	□□□□□ -1.19
SH3BP2-222	ENST00000512014	C5orf52	A6NGY3	159 aa		7.6	□□□□□ -1.19

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