RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 VWFP04275 2813 aa1.27□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 hDV103S1A0JD37 113 aa1.27□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 TIMM17BO60830 172 aa1.27□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 NMSQ5H8A3 153 aa1.27□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 SPANXN5Q5MJ07 72 aa1.27□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 DYNLRB2Q8TF09 96 aa1.27□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 HIGD1BQ9P298 99 aa1.27□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 ABCA1O95477 2261 aa1.27□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa1.27□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa1.27□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa1.27□□□□□ -2.21
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PDE4D-218ENST00000509368 GNRH2O43555 120 aa1.27□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP1.27□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 CLPSP04118 112 aa1.27□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 IGKV1-16P04430 117 aa1.27□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 CCKP06307 115 aa1.27□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP1.27□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 KLKP1Q107X0 134 aa1.27□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 KISS1Q15726 138 aa1.27□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 DEFB134Q4QY38 66 aa1.27□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa1.27□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 CFAP126Q5VTH2 177 aa1.27□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 LINC00643Q86TS7 51 aa1.27□□□□□ -2.21
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PDE4D-218ENST00000509368 Q8NDZ9 215 aa1.27□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM141Q96I45 108 aa1.27□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 C20orf78Q9BR46 151 aa1.27□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF407Q9C0G0 2248 aa1.26□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 PRR14LQ5THK1 2151 aa1.26□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa1.26□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa1.26□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 A0A1W2PQD3 144 aa1.26□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 ERC2-IT1O76042 136 aa1.26□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 SIX6O95475 246 aa1.26□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 SFTA3P0C7M3 94 aa1.26□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 BAALC-AS2P0C853 105 aa1.26□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 SMIM13P0DJ93 91 aa1.26□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP1.26□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 DYNLT1P63172 113 aa1.26□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 PRR9Q5T870 116 aa1.26□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 C2orf91Q6ZV80 131 aa1.26□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa1.26□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 TIMM21Q9BVV7 248 aa1.26□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 DYNLRB1Q9NP97 96 aa1.26□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 R4GN34 69 aa1.26□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa1.26□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa1.26□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa1.26□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 B4DSR2 109 aa1.26□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 CCL22O00626 93 aa1.26□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 INSL4Q14641 139 aa1.26□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 SS18Q15532 418 aa1.26□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa1.26□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 NABP2Q9BQ15 211 aa1.26□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 HHLA3Q9XRX5 114 aa1.26□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa1.26□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 DNAJC13O75165 2243 aa1.26□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 CMYA5Q8N3K9 4069 aa1.26□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 MPDZO75970 2070 aa1.26□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 BIRC6Q9NR09 4857 aa1.25□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 K7ERJ3 54 aa1.25□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 XAF1Q6GPH4 301 aa1.25□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 IGFL1Q6UW32 110 aa1.25□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 VMO1Q7Z5L0 202 aa1.25□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 CLEC2BQ92478 149 aa1.25□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 DSCR8Q96T75 97 aa1.25□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 SMIM7Q9BQ49 75 aa1.25□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 DNAH1Q9P2D7 4330 aa1.25□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa1.25□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa1.25□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 E7EUB6 86 aa1.25□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 NUPR1O60356 82 aa1.25□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 COX6CP09669 75 aa1.25□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 MIFP14174 115 aa1.25□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP1.25□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 FAUP35544 74 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 GNG11P61952 73 aa1.25□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 MOBPQ13875 183 aa1.25□□□□□ -2.21
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PDE4D-218ENST00000509368 Q9BRP9 147 aa1.25□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 FREM1Q5H8C1 2179 aa1.25□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 TRAV7A0A075B6U4 112 aa1.25□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 MUC21A0A140T8X8 626 aa1.25□□□□□ -2.21
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PDE4D-218ENST00000509368 LCE1CQ5T751 118 aa1.25□□□□□ -2.21
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PDE4D-218ENST00000509368 LCE3AQ5TA76 89 aa1.25□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa1.25□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa1.25□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 TVP23CQ96ET8 276 aa1.25□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 AMELYQ99218 206 aa1.25□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 RETNLBQ9BQ08 111 aa1.25□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 C22orf24Q9Y442 160 aa1.25□□□□□ -2.21
PDE4D-218ENST00000509368 V9GYH0 126 aa1.25□□□□□ -2.21
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