RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495787.1

ECHDC3-204, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene ECHDC3, Length 505 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-204ENST00000495787 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM238C9JI98 176 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 K7EP13 123 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 APOMO95445 188 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 GCSHP23434 173 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 SFTA2Q6UW10 78 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 TM2D2Q9BX73 214 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 KMT2AQ03164 3969 aa7.2□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 PRSS2P07478 247 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.19□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 CXCL5P42830 114 aa7.18□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 KIAA0087Q14695 138 aa7.18□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 CFAP161Q6P656 301 aa7.18□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 Q6ZVH6 145 aa7.18□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 LITAFQ99732 161 aa7.18□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.18□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 SPANXCQ9NY87 97 aa7.18□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.17□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.17□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 A6NDN8 102 aa7.17□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 PTTG1IPP53801 180 aa7.17□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 FXYD2P54710 66 aa7.17□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 RMI2Q96E14 147 aa7.17□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.16□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.16□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.15□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 A6NJY4 79 aa7.15□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 IFITM1P13164 125 aa7.15□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 CKS1BP61024 79 aa7.15□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 SPAG11BQ08648 103 aa7.15□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 Q9HAA7 133 aa7.15□□□□□ -1.26
ECHDC3-204ENST00000495787 SMIM13P0DJ93 91 aa7.14□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.14□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 C2orf82Q6UX34 121 aa7.13□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 COPS9Q8WXC6 57 aa7.13□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 ERG28Q9UKR5 140 aa7.13□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 COX11Q9Y6N1 276 aa7.13□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 A0A1B0GWB2 263 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 F8WDY8 70 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 TAX1BP3O14907 124 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 TTC32Q5I0X7 151 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 C15orf56Q8N910 161 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.12□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.11□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 A0A0U1RRA0 63 aa7.11□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.11□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 LINC00158P58513 81 aa7.11□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 C6orf223Q8N319 242 aa7.11□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 DAND5Q8N907 189 aa7.11□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.11□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 C2orf48Q96LS8 159 aa7.11□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.11□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 A4D1N5 150 aa7.1□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 COX17Q14061 63 aa7.1□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.1□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.1□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 A0A1B0GV90 55 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 K7ERJ3 54 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 PFN2P35080 140 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 NPC2P61916 151 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 C10orf25Q5T742 122 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.09□□□□□ -1.27
ECHDC3-204ENST00000495787 A0A0B4J2C4 111 aa7.08□□□□□ -1.28
ECHDC3-204ENST00000495787 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.08□□□□□ -1.28
ECHDC3-204ENST00000495787 C9orf118A6NHY6 69 aa7.08□□□□□ -1.28
ECHDC3-204ENST00000495787 CFC1BP0CG36 223 aa7.08□□□□□ -1.28
ECHDC3-204ENST00000495787 CFC1P0CG37 223 aa7.08□□□□□ -1.28
ECHDC3-204ENST00000495787 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.08□□□□□ -1.28
ECHDC3-204ENST00000495787 RAB37Q96AX2 223 aa7.08□□□□□ -1.28
ECHDC3-204ENST00000495787 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.08□□□□□ -1.28
ECHDC3-204ENST00000495787 USP17L23D6RBM5 183 aa7.07□□□□□ -1.28
ECHDC3-204ENST00000495787 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
ECHDC3-204ENST00000495787 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.07□□□□□ -1.28
ECHDC3-204ENST00000495787 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.06□□□□□ -1.28
ECHDC3-204ENST00000495787 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
ECHDC3-204ENST00000495787 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.06□□□□□ -1.28
ECHDC3-204ENST00000495787 SYCNQ0VAF6 134 aa7.05□□□□□ -1.28
ECHDC3-204ENST00000495787 Q6ZRU5 148 aa7.05□□□□□ -1.28
ECHDC3-204ENST00000495787 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.05□□□□□ -1.28
ECHDC3-204ENST00000495787 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.05□□□□□ -1.28
ECHDC3-204ENST00000495787 DNAH11Q96DT5 4516 aa7.05□□□□□ -1.28
ECHDC3-204ENST00000495787 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
ECHDC3-204ENST00000495787 PKHD1P08F94 4074 aa7.05□□□□□ -1.28
ECHDC3-204ENST00000495787 H3BUT2 72 aa7.04□□□□□ -1.28
ECHDC3-204ENST00000495787 PSCAO43653 123 aa7.04□□□□□ -1.28
ECHDC3-204ENST00000495787 RNF151Q2KHN1 245 aa7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms