RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494396.5

SYP-208, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 2

Gene SYP, Length 2,062 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-208ENST00000494396 BAHCC1Q9P281 2608 aa11.75□□□□□ -0.53
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SYP-208ENST00000494396 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa11.74□□□□□ -0.53
SYP-208ENST00000494396 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa11.74□□□□□ -0.53
SYP-208ENST00000494396 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
SYP-208ENST00000494396 Q9HAA7 133 aa11.74□□□□□ -0.53
SYP-208ENST00000494396 LINC00337Q8N6G1 96 aa11.73□□□□□ -0.53
SYP-208ENST00000494396 K7EQD1 137 aa11.72□□□□□ -0.53
SYP-208ENST00000494396 LINC00482Q8N8I6 264 aa11.72□□□□□ -0.53
SYP-208ENST00000494396 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa11.72□□□□□ -0.53
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SYP-208ENST00000494396 IGKV2D-28P01615 120 aa11.71□□□□□ -0.53
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SYP-208ENST00000494396 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa11.71□□□□□ -0.54
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SYP-208ENST00000494396 UBE2L6O14933 153 aa11.69□□□□□ -0.54
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SYP-208ENST00000494396 ORMDL1Q9P0S3 153 aa11.67□□□□□ -0.54
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SYP-208ENST00000494396 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa11.65□□□□□ -0.54
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SYP-208ENST00000494396 C1orf158Q8N1D5 194 aa11.64□□□□□ -0.55
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SYP-208ENST00000494396 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa11.64□□□□□ -0.55
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SYP-208ENST00000494396 C19orf73Q9NVV2 129 aa11.64□□□□□ -0.55
SYP-208ENST00000494396 BCE1O60756 84 aa11.63□□□□□ -0.55
SYP-208ENST00000494396 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa11.63□□□□□ -0.55
SYP-208ENST00000494396 C9orf66Q5T8R8 295 aa11.63□□□□□ -0.55
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SYP-208ENST00000494396 A0A087WZ39 114 aa11.61□□□□□ -0.55
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SYP-208ENST00000494396 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa11.6□□□□□ -0.55
SYP-208ENST00000494396 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa11.59□□□□□ -0.55
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SYP-208ENST00000494396 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
SYP-208ENST00000494396 NOTCH3Q9UM47 2321 aa11.59□□□□□ -0.55
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SYP-208ENST00000494396 PAX4O43316 350 aa11.58□□□□□ -0.56
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SYP-208ENST00000494396 SPATA3Q8NHX4 192 aa11.58□□□□□ -0.56
SYP-208ENST00000494396 CYSTM1Q9H1C7 97 aa11.58□□□□□ -0.56
SYP-208ENST00000494396 TOMM7Q9P0U1 55 aa11.58□□□□□ -0.56
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SYP-208ENST00000494396 SS18Q15532 418 aa11.56□□□□□ -0.56
SYP-208ENST00000494396 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa11.56□□□□□ -0.56
SYP-208ENST00000494396 Q6ZTI0 123 aa11.56□□□□□ -0.56
SYP-208ENST00000494396 WFDC9Q8NEX5 89 aa11.55□□□□□ -0.56
SYP-208ENST00000494396 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa11.54□□□□□ -0.56
SYP-208ENST00000494396 UBL5Q9BZL1 73 aa11.54□□□□□ -0.56
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SYP-208ENST00000494396 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa11.53□□□□□ -0.56
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SYP-208ENST00000494396 C6orf226Q5I0X4 101 aa11.51□□□□□ -0.57
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SYP-208ENST00000494396 H3BQ85 93 aa11.5□□□□□ -0.57
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SYP-208ENST00000494396 Q5XG85 94 aa11.48□□□□□ -0.57
SYP-208ENST00000494396 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
SYP-208ENST00000494396 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa11.47□□□□□ -0.57
SYP-208ENST00000494396 MRAPQ8TCY5 172 aa11.47□□□□□ -0.57
SYP-208ENST00000494396 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa11.47□□□□□ -0.57
SYP-208ENST00000494396 TRAV7A0A075B6U4 112 aa11.47□□□□□ -0.57
SYP-208ENST00000494396 OXTP01178 125 aa11.47□□□□□ -0.57
SYP-208ENST00000494396 EPM2AB3EWF7 344 aa11.46□□□□□ -0.57
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