RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493853.1

RBM39-238, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 4

Gene RBM39, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-238	ENST00000493853	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	TMEM141	Q96I45	108 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	PRSS2	P07478	247 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	CKS1B	P61024	79 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	UBE2B	P63146	152 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	FAM104A	Q969W3	186 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	VCX2	Q9H322	139 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	FAM168B	A1KXE4	195 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	IGLV7-43	P04211	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	G0S2	P27469	103 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853		M0QXV9	152 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	UBE2D1	P51668	147 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	C2orf82	Q6UX34	121 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853		Q8N8P6	123 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853		K7EMI3	77 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	SEC11A	P67812	179 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-238	ENST00000493853		H0Y9J4	135 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	HERVK_113	P63121	156 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853		Q8IZM0	81 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	AMELX	Q99217	191 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	IGIP	A6NJ69	53 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853		F8VRH5	84 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	S100P	P25815	95 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	CXCL5	P42830	114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	ERAS	Q7Z444	233 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	TOMM6	Q96B49	74 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	TIMM17A	Q99595	171 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	C22orf24	Q9Y442	160 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853		A0A0A0MQY5	61 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	LINC01549	A6NIU2	74 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	NUPR1	O60356	82 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	ZNF861P	O60384	105 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	GAGE10	A6NGK3	116 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	RAB5B	P61020	215 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	PRR4	Q16378	134 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	CLLU1	Q5K131	121 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	COX7B2	Q8TF08	81 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	TNXB	P22105	4242 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBM39-238	ENST00000493853	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBM39-238	ENST00000493853	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RBM39-238	ENST00000493853	UQCC3	Q6UW78	93 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBM39-238	ENST00000493853	FA2H	Q7L5A8	372 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBM39-238	ENST00000493853	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBM39-238	ENST00000493853	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBM39-238	ENST00000493853	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBM39-238	ENST00000493853	LRP2	P98164	4655 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBM39-238	ENST00000493853	TMEM218	A2RU14	115 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RBM39-238	ENST00000493853	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RBM39-238	ENST00000493853	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RBM39-238	ENST00000493853		H3BRM9	83 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RBM39-238	ENST00000493853	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RBM39-238	ENST00000493853	SPINK8	P0C7L1	97 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RBM39-238	ENST00000493853	NDUFA6	P56556	154 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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