RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493536.5

SNHG16-202, Transcript of small nucleolar RNA host gene 16, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG16, Length 2,424 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG16-202ENST00000493536 NPC2P61916 151 aa5.95□□□□□ -1.46
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SNHG16-202ENST00000493536 COX11Q9Y6N1 276 aa5.95□□□□□ -1.46
SNHG16-202ENST00000493536 DAND5Q8N907 189 aa5.94□□□□□ -1.46
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SNHG16-202ENST00000493536 LINC00158P58513 81 aa5.93□□□□□ -1.46
SNHG16-202ENST00000493536 C2orf82Q6UX34 121 aa5.93□□□□□ -1.46
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SNHG16-202ENST00000493536 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa5.91□□□□□ -1.46
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SNHG16-202ENST00000493536 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa5.9□□□□□ -1.47
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SNHG16-202ENST00000493536 PRO1854Q9UHT4 67 aa5.89□□□□□ -1.47
SNHG16-202ENST00000493536 C6orf223Q8N319 242 aa5.89□□□□□ -1.47
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SNHG16-202ENST00000493536 CSMD3Q7Z407 3707 aa5.89□□□□□ -1.47
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SNHG16-202ENST00000493536 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa5.88□□□□□ -1.47
SNHG16-202ENST00000493536 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
SNHG16-202ENST00000493536 FABP2P12104 132 aa5.88□□□□□ -1.47
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SNHG16-202ENST00000493536 COX17Q14061 63 aa5.87□□□□□ -1.47
SNHG16-202ENST00000493536 Q1RN00 199 aa5.87□□□□□ -1.47
SNHG16-202ENST00000493536 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa5.87□□□□□ -1.47
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SNHG16-202ENST00000493536 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
SNHG16-202ENST00000493536 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa5.87□□□□□ -1.47
SNHG16-202ENST00000493536 CAMK2N2Q96S95 79 aa5.87□□□□□ -1.47
SNHG16-202ENST00000493536 TGP01266 2768 aa5.87□□□□□ -1.47
SNHG16-202ENST00000493536 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
SNHG16-202ENST00000493536 LYSTQ99698 3801 aa5.86□□□□□ -1.47
SNHG16-202ENST00000493536 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.86□□□□□ -1.47
SNHG16-202ENST00000493536 GAGE10A6NGK3 116 aa5.86□□□□□ -1.47
SNHG16-202ENST00000493536 TSPAN13O95857 204 aa5.86□□□□□ -1.47
SNHG16-202ENST00000493536 C10orf25Q5T742 122 aa5.86□□□□□ -1.47
SNHG16-202ENST00000493536 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.86□□□□□ -1.47
SNHG16-202ENST00000493536 C15orf56Q8N910 161 aa5.86□□□□□ -1.47
SNHG16-202ENST00000493536 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.86□□□□□ -1.47
SNHG16-202ENST00000493536 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa5.85□□□□□ -1.47
SNHG16-202ENST00000493536 SPCS1Q9Y6A9 102 aa5.85□□□□□ -1.47
SNHG16-202ENST00000493536 PSMB2P49721 201 aa5.85□□□□□ -1.47
SNHG16-202ENST00000493536 UBE2V1Q13404 147 aa5.85□□□□□ -1.47
SNHG16-202ENST00000493536 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5.84□□□□□ -1.47
SNHG16-202ENST00000493536 PSCAO43653 123 aa5.84□□□□□ -1.48
SNHG16-202ENST00000493536 SCGB1C2P0DMR2 95 aa5.84□□□□□ -1.48
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SNHG16-202ENST00000493536 C2orf48Q96LS8 159 aa5.83□□□□□ -1.48
SNHG16-202ENST00000493536 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.83□□□□□ -1.48
SNHG16-202ENST00000493536 C6orf48Q9UBA6 75 aa5.83□□□□□ -1.48
SNHG16-202ENST00000493536 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa5.83□□□□□ -1.48
SNHG16-202ENST00000493536 USP17L23D6RBM5 183 aa5.83□□□□□ -1.48
SNHG16-202ENST00000493536 K7EP34 96 aa5.83□□□□□ -1.48
SNHG16-202ENST00000493536 MUC7Q8TAX7 377 aa5.83□□□□□ -1.48
SNHG16-202ENST00000493536 DNAH7Q8WXX0 4024 aa5.82□□□□□ -1.48
SNHG16-202ENST00000493536 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa5.82□□□□□ -1.48
SNHG16-202ENST00000493536 TTC32Q5I0X7 151 aa5.82□□□□□ -1.48
SNHG16-202ENST00000493536 CASC10Q5T4H9 136 aa5.82□□□□□ -1.48
SNHG16-202ENST00000493536 Q6ZRU5 148 aa5.82□□□□□ -1.48
SNHG16-202ENST00000493536 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
SNHG16-202ENST00000493536 F8WDY8 70 aa5.82□□□□□ -1.48
SNHG16-202ENST00000493536 LECT2O14960 151 aa5.82□□□□□ -1.48
SNHG16-202ENST00000493536 SYCNQ0VAF6 134 aa5.82□□□□□ -1.48
SNHG16-202ENST00000493536 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa5.8□□□□□ -1.48
SNHG16-202ENST00000493536 COX6CP09669 75 aa5.8□□□□□ -1.48
SNHG16-202ENST00000493536 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
SNHG16-202ENST00000493536 OR13C6PQ8NH95 151 aa5.8□□□□□ -1.48
SNHG16-202ENST00000493536 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa5.79□□□□□ -1.48
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