RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492403.1

EPHB4-208, Transcript of EPH receptor B4, humanhuman

TSL 2

Gene EPHB4, Length 812 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4-208ENST00000492403 C12orf74Q32Q52 190 aa7.1□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 Q6ZUT4 128 aa7.1□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.1□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.1□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.1□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 SACSQ9NZJ4 4579 aa7.1□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 A0A0J9YXY3 114 aa7.09□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 A0A0J9YY99 117 aa7.09□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 A0A1B0GWB2 263 aa7.09□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 A0A1W2PPM0 123 aa7.09□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 H3BUT2 72 aa7.09□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 ATP5G1P05496 136 aa7.09□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.09□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 IFITM1P13164 125 aa7.09□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 FXYD2P54710 66 aa7.09□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.09□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.09□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.09□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.09□□□□□ -1.27
EPHB4-208ENST00000492403 FAM222AQ5U5X8 452 aa7.08□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 RAB37Q96AX2 223 aa7.08□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 K7EP34 96 aa7.07□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 CELA1Q9UNI1 258 aa7.07□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.07□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.06□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.06□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.06□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 A0A1B0GUV1 79 aa7.06□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 TMEM262E9PQX1 116 aa7.06□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 M0R2N4 97 aa7.06□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 SS18Q15532 418 aa7.06□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.06□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.06□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 Q9UF83 564 aa7.06□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.06□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.05□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 NDUFA1O15239 70 aa7.05□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 SPINK8P0C7L1 97 aa7.05□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 LINC00694P0DN24 101 aa7.05□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.05□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.05□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.05□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 Q9HAA7 133 aa7.05□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 SPANXCQ9NY87 97 aa7.05□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.05□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 NACAE9PAV3 2078 aa7.04□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 IGHV3-30P01768 117 aa7.04□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.04□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.04□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.04□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.03□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 A0A0B4J2C4 111 aa7.03□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 F5H768 121 aa7.03□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 COX6CP09669 75 aa7.03□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 MIAQ16674 131 aa7.03□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.03□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 FAM104AQ969W3 186 aa7.03□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.03□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 ERG28Q9UKR5 140 aa7.03□□□□□ -1.28
EPHB4-208ENST00000492403 F8W1H4 67 aa7.02□□□□□ -1.29
EPHB4-208ENST00000492403 H3BNG1 76 aa7.02□□□□□ -1.29
EPHB4-208ENST00000492403 K7EP13 123 aa7.02□□□□□ -1.29
EPHB4-208ENST00000492403 K7ERU9 68 aa7.02□□□□□ -1.29
EPHB4-208ENST00000492403 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.02□□□□□ -1.29
EPHB4-208ENST00000492403 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.02□□□□□ -1.29
EPHB4-208ENST00000492403 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.01□□□□□ -1.29
EPHB4-208ENST00000492403 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.01□□□□□ -1.29
EPHB4-208ENST00000492403 J3QR89 54 aa7.01□□□□□ -1.29
EPHB4-208ENST00000492403 APOMO95445 188 aa7.01□□□□□ -1.29
EPHB4-208ENST00000492403 SLPIP03973 132 aa7.01□□□□□ -1.29
EPHB4-208ENST00000492403 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.01□□□□□ -1.29
EPHB4-208ENST00000492403 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
EPHB4-208ENST00000492403 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.01□□□□□ -1.29
EPHB4-208ENST00000492403 K7ERJ3 54 aa7□□□□□ -1.29
EPHB4-208ENST00000492403 PSMB2P49721 201 aa7□□□□□ -1.29
EPHB4-208ENST00000492403 MEIG1Q5JSS6 88 aa7□□□□□ -1.29
EPHB4-208ENST00000492403 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7□□□□□ -1.29
EPHB4-208ENST00000492403 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHB4-208ENST00000492403 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHB4-208ENST00000492403 CCL18P55774 89 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHB4-208ENST00000492403 RBX1P62877 108 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHB4-208ENST00000492403 COX6A2Q02221 97 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHB4-208ENST00000492403 Q1RN00 199 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHB4-208ENST00000492403 LELP1Q5T871 98 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHB4-208ENST00000492403 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHB4-208ENST00000492403 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHB4-208ENST00000492403 COX7B2Q8TF08 81 aa6.99□□□□□ -1.29
EPHB4-208ENST00000492403 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.98□□□□□ -1.29
EPHB4-208ENST00000492403 CFC1BP0CG36 223 aa6.98□□□□□ -1.29
EPHB4-208ENST00000492403 CFC1P0CG37 223 aa6.98□□□□□ -1.29
EPHB4-208ENST00000492403 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.98□□□□□ -1.29
EPHB4-208ENST00000492403 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
EPHB4-208ENST00000492403 CXCL5P42830 114 aa6.97□□□□□ -1.29
EPHB4-208ENST00000492403 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.96□□□□□ -1.3
EPHB4-208ENST00000492403 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.96□□□□□ -1.3
EPHB4-208ENST00000492403 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.96□□□□□ -1.3
EPHB4-208ENST00000492403 TSPAN13O95857 204 aa6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms