RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491166.1

TMCO3-208, Transcript of transmembrane and coiled-coil domains 3, human

TSL 2

Gene TMCO3, Length 595 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMCO3-208	ENST00000491166	AMELX	Q99217	191 aa		7.69	□□□□□ -1.18
TMCO3-208	ENST00000491166	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	7.68	□□□□□ -1.18
TMCO3-208	ENST00000491166	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		7.68	□□□□□ -1.18
TMCO3-208	ENST00000491166	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	7.68	□□□□□ -1.18
TMCO3-208	ENST00000491166	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		7.68	□□□□□ -1.18
TMCO3-208	ENST00000491166	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		7.68	□□□□□ -1.18
TMCO3-208	ENST00000491166	LINC00614	P0C842	121 aa		7.67	□□□□□ -1.18
TMCO3-208	ENST00000491166		Q6ZN92	141 aa		7.67	□□□□□ -1.18
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		7.67	□□□□□ -1.18
TMCO3-208	ENST00000491166	VCX2	Q9H322	139 aa		7.67	□□□□□ -1.18
TMCO3-208	ENST00000491166	C1orf137	Q5JT78	98 aa		7.66	□□□□□ -1.18
TMCO3-208	ENST00000491166	ERAS	Q7Z444	233 aa		7.66	□□□□□ -1.18
TMCO3-208	ENST00000491166	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		7.66	□□□□□ -1.18
TMCO3-208	ENST00000491166	TIMM17A	Q99595	171 aa		7.66	□□□□□ -1.18
TMCO3-208	ENST00000491166	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		7.66	□□□□□ -1.18
TMCO3-208	ENST00000491166		F8WDY8	70 aa		7.65	□□□□□ -1.18
TMCO3-208	ENST00000491166	LINC00310	P59036	64 aa		7.65	□□□□□ -1.18
TMCO3-208	ENST00000491166	REG3G	Q6UW15	175 aa		7.65	□□□□□ -1.18
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		7.65	□□□□□ -1.18
TMCO3-208	ENST00000491166	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		7.64	□□□□□ -1.19
TMCO3-208	ENST00000491166	NUPR1	O60356	82 aa		7.63	□□□□□ -1.19
TMCO3-208	ENST00000491166	NPS	P0C0P6	89 aa		7.63	□□□□□ -1.19
TMCO3-208	ENST00000491166	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		7.63	□□□□□ -1.19
TMCO3-208	ENST00000491166	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	7.63	□□□□□ -1.19
TMCO3-208	ENST00000491166	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		7.62	□□□□□ -1.19
TMCO3-208	ENST00000491166		M0QXV9	152 aa		7.62	□□□□□ -1.19
TMCO3-208	ENST00000491166	HBD	P02042	147 aa		7.62	□□□□□ -1.19
TMCO3-208	ENST00000491166	PRSS2	P07478	247 aa		7.62	□□□□□ -1.19
TMCO3-208	ENST00000491166	G0S2	P27469	103 aa		7.62	□□□□□ -1.19
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP10-8	P60410	259 aa		7.62	□□□□□ -1.19
TMCO3-208	ENST00000491166	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
TMCO3-208	ENST00000491166	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		7.62	□□□□□ -1.19
TMCO3-208	ENST00000491166	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		7.62	□□□□□ -1.19
TMCO3-208	ENST00000491166	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		7.62	□□□□□ -1.19
TMCO3-208	ENST00000491166	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TMCO3-208	ENST00000491166	ATP6V1G1	O75348	118 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TMCO3-208	ENST00000491166	CKS1B	P61024	79 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TMCO3-208	ENST00000491166	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TMCO3-208	ENST00000491166	CST9L	Q9H4G1	147 aa		7.61	□□□□□ -1.19
TMCO3-208	ENST00000491166	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
TMCO3-208	ENST00000491166	SERF1A	O75920	110 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TMCO3-208	ENST00000491166	IGLV7-43	P04211	117 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TMCO3-208	ENST00000491166	RAB5B	P61020	215 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TMCO3-208	ENST00000491166	UBE2B	P63146	152 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TMCO3-208	ENST00000491166	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TMCO3-208	ENST00000491166	BAGE3	Q86Y29	109 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TMCO3-208	ENST00000491166	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TMCO3-208	ENST00000491166	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
TMCO3-208	ENST00000491166	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		7.6	□□□□□ -1.19
TMCO3-208	ENST00000491166	HERVK_113	P63121	156 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TMCO3-208	ENST00000491166		Q8IZM0	81 aa		7.59	□□□□□ -1.19
TMCO3-208	ENST00000491166	LPA	P08519	4548 aa		7.59	□□□□□ -1.2
TMCO3-208	ENST00000491166	PMVK	Q15126	192 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TMCO3-208	ENST00000491166	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		7.58	□□□□□ -1.2
TMCO3-208	ENST00000491166	LINC01549	A6NIU2	74 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TMCO3-208	ENST00000491166	HIST1H2BK	O60814	126 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TMCO3-208	ENST00000491166	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TMCO3-208	ENST00000491166	HIST1H2BO	P23527	126 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TMCO3-208	ENST00000491166	HIST1H2BB	P33778	126 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TMCO3-208	ENST00000491166	NDUFA6	P56556	154 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TMCO3-208	ENST00000491166	HIST1H2BD	P58876	126 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TMCO3-208	ENST00000491166	HIST1H2BC	P62807	126 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TMCO3-208	ENST00000491166	SEC11A	P67812	179 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TMCO3-208	ENST00000491166	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TMCO3-208	ENST00000491166	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
TMCO3-208	ENST00000491166	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TMCO3-208	ENST00000491166	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TMCO3-208	ENST00000491166	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		7.57	□□□□□ -1.2
TMCO3-208	ENST00000491166	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TMCO3-208	ENST00000491166	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TMCO3-208	ENST00000491166	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TMCO3-208	ENST00000491166	HSBP1	O75506	76 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TMCO3-208	ENST00000491166	SPINK8	P0C7L1	97 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TMCO3-208	ENST00000491166	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TMCO3-208	ENST00000491166	DIRC1	Q969H9	104 aa		7.56	□□□□□ -1.2
TMCO3-208	ENST00000491166		F8VRH5	84 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TMCO3-208	ENST00000491166	ATP5L	O75964	103 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TMCO3-208	ENST00000491166	IGLC3	P0DOY3	106 aa		7.55	□□□□□ -1.2
TMCO3-208	ENST00000491166	C11orf86	A6NJI1	115 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TMCO3-208	ENST00000491166		H0Y9J4	135 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TMCO3-208	ENST00000491166	S100A1	P23297	94 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TMCO3-208	ENST00000491166	COX7B2	Q8TF08	81 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TMCO3-208	ENST00000491166	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TMCO3-208	ENST00000491166	MUC2	Q02817	5179 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TMCO3-208	ENST00000491166	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
TMCO3-208	ENST00000491166	C22orf24	Q9Y442	160 aa		7.53	□□□□□ -1.2
TMCO3-208	ENST00000491166	CXCL5	P42830	114 aa		7.52	□□□□□ -1.21
TMCO3-208	ENST00000491166	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TMCO3-208	ENST00000491166	FABP4	P15090	132 aa		7.51	□□□□□ -1.21
TMCO3-208	ENST00000491166	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
TMCO3-208	ENST00000491166	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TMCO3-208	ENST00000491166		H0Y8G0	127 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TMCO3-208	ENST00000491166	LEPROTL1	O95214	131 aa		7.5	□□□□□ -1.21
TMCO3-208	ENST00000491166	GAGE10	A6NGK3	116 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TMCO3-208	ENST00000491166	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		7.49	□□□□□ -1.21
TMCO3-208	ENST00000491166	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
TMCO3-208	ENST00000491166	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TMCO3-208	ENST00000491166	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
TMCO3-208	ENST00000491166	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TMCO3-208	ENST00000491166	ZNF861P	O60384	105 aa		7.47	□□□□□ -1.21

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