RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489318.1

C9orf3-220, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-220ENST00000489318 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
C9orf3-220ENST00000489318 TM2D2Q9BX73 214 aa7.6□□□□□ -1.19
C9orf3-220ENST00000489318 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.6□□□□□ -1.19
C9orf3-220ENST00000489318 SPANXCQ9NY87 97 aa7.6□□□□□ -1.19
C9orf3-220ENST00000489318 F8WDY8 70 aa7.59□□□□□ -1.19
C9orf3-220ENST00000489318 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.59□□□□□ -1.19
C9orf3-220ENST00000489318 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
C9orf3-220ENST00000489318 C2orf48Q96LS8 159 aa7.59□□□□□ -1.19
C9orf3-220ENST00000489318 DNAH6Q9C0G6 4158 aa7.59□□□□□ -1.2
C9orf3-220ENST00000489318 M0R143 59 aa7.58□□□□□ -1.2
C9orf3-220ENST00000489318 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.58□□□□□ -1.2
C9orf3-220ENST00000489318 C2orf82Q6UX34 121 aa7.58□□□□□ -1.2
C9orf3-220ENST00000489318 Q6ZVH6 145 aa7.58□□□□□ -1.2
C9orf3-220ENST00000489318 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.58□□□□□ -1.2
C9orf3-220ENST00000489318 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.58□□□□□ -1.2
C9orf3-220ENST00000489318 EREGO14944 169 aa7.57□□□□□ -1.2
C9orf3-220ENST00000489318 PTTG1IPP53801 180 aa7.57□□□□□ -1.2
C9orf3-220ENST00000489318 CKS1BP61024 79 aa7.57□□□□□ -1.2
C9orf3-220ENST00000489318 USP17L23D6RBM5 183 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf3-220ENST00000489318 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
C9orf3-220ENST00000489318 COX17Q14061 63 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf3-220ENST00000489318 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf3-220ENST00000489318 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf3-220ENST00000489318 CEND1Q8N111 149 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf3-220ENST00000489318 C6orf223Q8N319 242 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf3-220ENST00000489318 HIST1H4GQ99525 98 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf3-220ENST00000489318 ERG28Q9UKR5 140 aa7.56□□□□□ -1.2
C9orf3-220ENST00000489318 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf3-220ENST00000489318 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
C9orf3-220ENST00000489318 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.55□□□□□ -1.2
C9orf3-220ENST00000489318 SMIM13P0DJ93 91 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf3-220ENST00000489318 IFITM1P13164 125 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf3-220ENST00000489318 FXYD2P54710 66 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf3-220ENST00000489318 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
C9orf3-220ENST00000489318 C10orf25Q5T742 122 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf3-220ENST00000489318 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf3-220ENST00000489318 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf3-220ENST00000489318 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.54□□□□□ -1.2
C9orf3-220ENST00000489318 LY6G6CO95867 125 aa7.53□□□□□ -1.2
C9orf3-220ENST00000489318 GCSHP23434 173 aa7.53□□□□□ -1.2
C9orf3-220ENST00000489318 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
C9orf3-220ENST00000489318 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.53□□□□□ -1.2
C9orf3-220ENST00000489318 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.52□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.52□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 PSCAO43653 123 aa7.52□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 WFDC2Q14508 124 aa7.52□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 RNF151Q2KHN1 245 aa7.52□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 Q6ZRU5 148 aa7.52□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.52□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.52□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.52□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 COPS9Q8WXC6 57 aa7.52□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.51□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 A0A1B0GWB2 263 aa7.51□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 A6NJY4 79 aa7.51□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 SYCNQ0VAF6 134 aa7.51□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 C14orf177Q52M58 125 aa7.51□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.51□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.51□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 DAND5Q8N907 189 aa7.51□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.5□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 A6NDN8 102 aa7.5□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 M0R2N4 97 aa7.5□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 SLPIP03973 132 aa7.5□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 PFN2P35080 140 aa7.5□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 LINC00158P58513 81 aa7.5□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 BATFQ16520 125 aa7.5□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 A0A0U1RRA0 63 aa7.49□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.49□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 CARD19Q96LW7 228 aa7.49□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 A4D1N5 150 aa7.48□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 LECT2O14960 151 aa7.48□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.48□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 KMT2AQ03164 3969 aa7.47□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 A0A0B4J2C4 111 aa7.47□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.47□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.47□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
C9orf3-220ENST00000489318 NPC2P61916 151 aa7.46□□□□□ -1.22
C9orf3-220ENST00000489318 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.46□□□□□ -1.22
C9orf3-220ENST00000489318 DNAH2Q9P225 4427 aa7.46□□□□□ -1.22
C9orf3-220ENST00000489318 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.46□□□□□ -1.22
C9orf3-220ENST00000489318 A0A087WTM6 91 aa7.45□□□□□ -1.22
C9orf3-220ENST00000489318 LCE6AA0A183 80 aa7.45□□□□□ -1.22
C9orf3-220ENST00000489318 NDUFC2O95298 119 aa7.45□□□□□ -1.22
C9orf3-220ENST00000489318 CFC1BP0CG36 223 aa7.45□□□□□ -1.22
C9orf3-220ENST00000489318 CFC1P0CG37 223 aa7.45□□□□□ -1.22
C9orf3-220ENST00000489318 Q8N814 137 aa7.45□□□□□ -1.22
C9orf3-220ENST00000489318 K7ERJ3 54 aa7.44□□□□□ -1.22
C9orf3-220ENST00000489318 TAX1BP3O14907 124 aa7.44□□□□□ -1.22
C9orf3-220ENST00000489318 Q6ZRP5 223 aa7.43□□□□□ -1.22
C9orf3-220ENST00000489318 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf3-220ENST00000489318 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf3-220ENST00000489318 IGKV2D-28P01615 120 aa7.42□□□□□ -1.22
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