RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
CTDSPL-208ENST00000486978 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
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CTDSPL-208ENST00000486978 TLX1NBP0CAT3 122 aa3.98□□□□□ -1.77
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CTDSPL-208ENST00000486978 GAGE2DQ9UEU5 116 aa3.96□□□□□ -1.78
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CTDSPL-208ENST00000486978 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP3.95□□□□□ -1.787e-6■■■■□ 19.5
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CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
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CTDSPL-208ENST00000486978 DIRC1Q969H9 104 aa3.9□□□□□ -1.79
CTDSPL-208ENST00000486978 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa3.89□□□□□ -1.79
CTDSPL-208ENST00000486978 H0Y9J4 135 aa3.89□□□□□ -1.79
CTDSPL-208ENST00000486978 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
CTDSPL-208ENST00000486978 LCE4AQ5TA78 99 aa3.89□□□□□ -1.79
CTDSPL-208ENST00000486978 BAGE3Q86Y29 109 aa3.89□□□□□ -1.79
CTDSPL-208ENST00000486978 TP73-AS1Q9UF72 201 aa3.89□□□□□ -1.79
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