RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.75□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.74□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.74□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 NPC2P61916 151 aa6.74□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 GAGE5Q13069 117 aa6.74□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 GAGE6Q13070 117 aa6.74□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.74□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 CLEC2BQ92478 149 aa6.74□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.74□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 Q9UF83 564 aa6.74□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.73□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 F5H768 121 aa6.73□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 CRPP02741 224 aa6.73□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.73□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 COX6A2Q02221 97 aa6.73□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 DEFB135Q30KP9 77 aa6.73□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 Q8NAQ8 132 aa6.73□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 IMUPQ9GZP8 106 aa6.73□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.72□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 MIFP14174 115 aa6.72□□□□□ -1.33
POLR1A-208ENST00000486964 GAGE12JA6NER3 117 aa6.71□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 LYRM9A8MSI8 78 aa6.71□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 GAGE7O76087 117 aa6.71□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 GAGE12FP0CL80 117 aa6.71□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 GAGE12GP0CL81 117 aa6.71□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 GAGE12IP0CL82 117 aa6.71□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 GAGE4Q13068 117 aa6.71□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 FHL2Q14192 279 aa6.71□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.7□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.7□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 LINC00694P0DN24 101 aa6.7□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.7□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 DAND5Q8N907 189 aa6.7□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 COX7B2Q8TF08 81 aa6.7□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 ATP5G1P05496 136 aa6.69□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 NACAE9PAV3 2078 aa6.69□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.68□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.68□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.68□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 LINC00643Q86TS7 51 aa6.68□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 H0YGX0 51 aa6.67□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 K7EIL1 84 aa6.67□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 DNAL4O96015 105 aa6.67□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.67□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 DEFB130BP0DP73 79 aa6.67□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 DEFB130AP0DP74 79 aa6.67□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.67□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 A0A087WZ39 114 aa6.66□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 DEFB4AO15263 64 aa6.66□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.66□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.66□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 CXCL5P42830 114 aa6.66□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.66□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 CELA1Q9UNI1 258 aa6.66□□□□□ -1.34
POLR1A-208ENST00000486964 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.65□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.65□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.65□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.64□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 A0A0U1RRA0 63 aa6.64□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 MALP21145 153 aa6.64□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 LINC00158P58513 81 aa6.64□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 RETNQ9HD89 108 aa6.64□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 PRO0255Q9UI72 69 aa6.64□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.63□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 DAD1P61803 113 aa6.63□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.63□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.63□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 RYR3Q15413 4870 aa6.63□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 A0A1B0GX51 115 aa6.62□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 SS18Q15532 418 aa6.62□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.62□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 A0A1B0GUV1 79 aa6.61□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 B5MCH6 92 aa6.61□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 Q8IZM0 81 aa6.61□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.61□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM126AQ9H061 195 aa6.61□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.6□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.6□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 IGKV2D-28P01615 120 aa6.6□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 CCL18P55774 89 aa6.6□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 MUC7Q8TAX7 377 aa6.6□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.6□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 PAX4O43316 350 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 GYPEP15421 78 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 SVIPQ8NHG7 77 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.59□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.59□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.59□□□□□ -1.36
POLR1A-208ENST00000486964 H3BNG1 76 aa6.59□□□□□ -1.36
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