RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 ALKAL2Q6UX46 152 aa4.93□□□□□ -1.62
CTPS1-208ENST00000479480 SPANXA1Q9NS26 97 aa4.93□□□□□ -1.62
CTPS1-208ENST00000479480 NPYP01303 97 aa4.92□□□□□ -1.62
CTPS1-208ENST00000479480 FAM74A3Q4VXF1 159 aa4.92□□□□□ -1.62
CTPS1-208ENST00000479480 TCTE3Q8IZS6 198 aa4.92□□□□□ -1.62
CTPS1-208ENST00000479480 TYMSOSQ8TAI1 123 aa4.92□□□□□ -1.62
CTPS1-208ENST00000479480 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.92□□□□□ -1.62
CTPS1-208ENST00000479480 SMIM2Q9BVW6 85 aa4.92□□□□□ -1.62
CTPS1-208ENST00000479480 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CTPS1-208ENST00000479480 XAGE1AQ9HD64 81 aa4.92□□□□□ -1.62
CTPS1-208ENST00000479480 NAT8BQ9UHF3 227 aa4.92□□□□□ -1.62
CTPS1-208ENST00000479480 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa4.91□□□□□ -1.62
CTPS1-208ENST00000479480 A0A0A0MQY5 61 aa4.91□□□□□ -1.62
CTPS1-208ENST00000479480 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa4.91□□□□□ -1.62
CTPS1-208ENST00000479480 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa4.91□□□□□ -1.62
CTPS1-208ENST00000479480 D6R8Y8 96 aa4.91□□□□□ -1.62
CTPS1-208ENST00000479480 RPL23P62829 140 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CTPS1-208ENST00000479480 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.91□□□□□ -1.62
CTPS1-208ENST00000479480 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
CTPS1-208ENST00000479480 NUPR1O60356 82 aa4.9□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 CRYGAP11844 174 aa4.9□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 C9JQL5 133 aa4.89□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 BCE1O60756 84 aa4.89□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 LINC00173Q6ZV60 143 aa4.89□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 TOMM7Q9P0U1 55 aa4.89□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa4.89□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 RPL37AP8A6NKH3 93 aa4.88□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 C6orf226Q5I0X4 101 aa4.88□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 LINC01561Q8N1V8 128 aa4.88□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM141Q96I45 108 aa4.88□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 LINC00167Q96N53 147 aa4.88□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa4.87□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 A0A1B0GXF2 115 aa4.87□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 RAB5AP20339 215 aa4.87□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 RPL28P46779 137 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 CKS1BP61024 79 aa4.87□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 ADIRFQ15847 76 aa4.87□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 Q6ZN92 141 aa4.87□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM136Q6ZRR5 245 aa4.87□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 AMELXQ99217 191 aa4.87□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 A0A1B0GW15 77 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 PRSS2P07478 247 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 C2orf66Q6UXQ4 117 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 TEX43Q6ZNM6 134 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 PRELID3AQ96N28 172 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 TP73-AS1Q9UF72 201 aa4.86□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 F8W036 122 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 PPBPP02775 128 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 TPRXLQ17RH7 258 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 Q8IZM0 81 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 VCX2Q9H322 139 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa4.85□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 IGIPA6NJ69 53 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 SCO1O75880 301 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 ORMDL3Q8N138 153 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 NAT8Q9UHE5 227 aa4.84□□□□□ -1.63
CTPS1-208ENST00000479480 F8VRH5 84 aa4.83□□□□□ -1.64
CTPS1-208ENST00000479480 S100A8P05109 93 aa4.83□□□□□ -1.64
CTPS1-208ENST00000479480 Q8N8P6 123 aa4.83□□□□□ -1.64
CTPS1-208ENST00000479480 C2orf88Q9BSF0 95 aa4.83□□□□□ -1.64
CTPS1-208ENST00000479480 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.83□□□□□ -1.64
CTPS1-208ENST00000479480 PPDPFQ9H3Y8 114 aa4.83□□□□□ -1.64
CTPS1-208ENST00000479480 CYSLTR1Q9Y271 337 aa4.83□□□□□ -1.64
CTPS1-208ENST00000479480 UBE2AP49459 152 aa4.82□□□□□ -1.64
CTPS1-208ENST00000479480 RAB5BP61020 215 aa4.82□□□□□ -1.64
CTPS1-208ENST00000479480 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CTPS1-208ENST00000479480 FAM229BQ4G0N7 80 aa4.82□□□□□ -1.64
CTPS1-208ENST00000479480 C3orf22Q8N5N4 141 aa4.82□□□□□ -1.64
CTPS1-208ENST00000479480 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.81□□□□□ -1.64
CTPS1-208ENST00000479480 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa4.81□□□□□ -1.64
CTPS1-208ENST00000479480 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa4.8□□□□□ -1.64
CTPS1-208ENST00000479480 IGKV2D-28P01615 120 aa4.8□□□□□ -1.64
CTPS1-208ENST00000479480 HERVK_113P63121 156 aa4.8□□□□□ -1.64
CTPS1-208ENST00000479480 PRLHP81277 87 aa4.8□□□□□ -1.64
CTPS1-208ENST00000479480 AKAP14Q86UN6 197 aa4.8□□□□□ -1.64
CTPS1-208ENST00000479480 MAP1LC3AQ9H492 121 aa4.8□□□□□ -1.64
CTPS1-208ENST00000479480 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.8□□□□□ -1.64
CTPS1-208ENST00000479480 SMIM1B2RUZ4 78 aa4.79□□□□□ -1.64
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM238C9JI98 176 aa4.79□□□□□ -1.64
CTPS1-208ENST00000479480 PEA15Q15121 130 aa4.79□□□□□ -1.64
CTPS1-208ENST00000479480 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa4.79□□□□□ -1.64
CTPS1-208ENST00000479480 COX7B2Q8TF08 81 aa4.79□□□□□ -1.64
CTPS1-208ENST00000479480 PLEKHB2Q96CS7 222 aa4.79□□□□□ -1.64
CTPS1-208ENST00000479480 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CTPS1-208ENST00000479480 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.79□□□□□ -1.64
CTPS1-208ENST00000479480 ADCYAP1P18509 176 aa4.78□□□□□ -1.64
CTPS1-208ENST00000479480 CXCL5P42830 114 aa4.78□□□□□ -1.64
CTPS1-208ENST00000479480 ORMDL2Q53FV1 153 aa4.78□□□□□ -1.64
CTPS1-208ENST00000479480 PDZD11Q5EBL8 140 aa4.78□□□□□ -1.64
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