RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478988.2

PDZRN3-AS1-201, PDZRN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PDZRN3-AS1, Length 961 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 C12orf57Q99622 126 aa3.56□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 VAMP8Q9BV40 100 aa3.56□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.56□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa3.55□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa3.55□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.55□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 C11orf86A6NJI1 115 aa3.55□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 REG3AQ06141 175 aa3.55□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MIAQ16674 131 aa3.55□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TMEM170BQ5T4T1 132 aa3.55□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa3.55□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 Q5VSD8 79 aa3.55□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LINC00518Q8N0U6 118 aa3.55□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 Q8N976 141 aa3.55□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PMCHL2Q9BQD1 86 aa3.55□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa3.54□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa3.54□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP3.54□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LINC01561Q8N1V8 128 aa3.54□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LINC00269Q8N2A0 174 aa3.54□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LINC00469Q8N7U9 141 aa3.54□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 Q8N814 137 aa3.54□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FAM104AQ969W3 186 aa3.54□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CHAC1Q9BUX1 264 aa3.54□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PRR34Q9NV39 138 aa3.54□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PAM16Q9Y3D7 125 aa3.54□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FAT3Q8TDW7 4589 aa3.53□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa3.53□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa3.53□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa3.53□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 A0A0J9YXV3 536 aa3.53□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 E9PLD3 99 aa3.53□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TSTD3H0UI37 97 aa3.53□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 APOMO95445 188 aa3.53□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IGHV3-30P01768 117 aa3.53□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IGHV3-33P01772 117 aa3.53□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 INAFM2P0DMQ5 153 aa3.53□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa3.53□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa3.53□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SPATA45Q537H7 98 aa3.53□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LINC00242Q5T6M2 205 aa3.53□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SFTA2Q6UW10 78 aa3.53□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CD164L2Q6UWJ8 174 aa3.53□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 Q6ZSA8 131 aa3.53□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ATOH7Q8N100 152 aa3.53□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 UBE2WQ96B02 151 aa3.53□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RMI2Q96E14 147 aa3.53□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KLK12Q9UKR0 248 aa3.53□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 COX11Q9Y6N1 276 aa3.53□□□□□ -1.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 A0A087WZ39 114 aa3.52□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa3.52□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 hDV102S1A0JD36 115 aa3.52□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TMEM223A0PJW6 202 aa3.52□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 GAGE10A6NGK3 116 aa3.52□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 COX7A2LO14548 114 aa3.52□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PSCAO43653 123 aa3.52□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ENHOQ6UWT2 76 aa3.52□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PLEKHB2Q96CS7 222 aa3.52□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TM2D2Q9BX73 214 aa3.52□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa3.52□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa3.51□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LEPROTO15243 131 aa3.51□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 COX8AP10176 69 aa3.51□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 XCL1P47992 114 aa3.51□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NMUP48645 174 aa3.51□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 COX6A2Q02221 97 aa3.51□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SLC25A34Q6PIV7 304 aa3.51□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CLPSL2Q6UWE3 100 aa3.51□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 STPG4Q8N801 248 aa3.51□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 Q9HAA7 133 aa3.51□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 UQCR10Q9UDW1 63 aa3.51□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa3.5□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa3.5□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa3.5□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa3.5□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LINC00587B1AMM8 73 aa3.5□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 J3QQQ9 107 aa3.5□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DLEU1O43261 78 aa3.5□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PRSS2P07478 247 aa3.5□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SPINK8P0C7L1 97 aa3.5□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FOXI1Q12951 378 aa3.5□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 WFDC2Q14508 124 aa3.5□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MAJINQ3KP22 176 aa3.5□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 Q8IZM0 81 aa3.5□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa3.49□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZNF815PA8K554 130 aa3.49□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SMIM1B2RUZ4 78 aa3.49□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 F8WDY8 70 aa3.49□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CXCL5P42830 114 aa3.49□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 HERV-K104P63124 156 aa3.49□□□□□ -1.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms