RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 LINC00469Q8N7U9 141 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP5-208ENST00000459627 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SH3BP5-208ENST00000459627 CST9LQ9H4G1 147 aa14.8□□□□□ -0.04
SH3BP5-208ENST00000459627 A0A096LNJ9 63 aa14.79□□□□□ -0.04
SH3BP5-208ENST00000459627 C6orf226Q5I0X4 101 aa14.79□□□□□ -0.04
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SH3BP5-208ENST00000459627 SEC11AP67812 179 aa14.78□□□□□ -0.04
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SH3BP5-208ENST00000459627 UBE2BP63146 152 aa14.63□□□□□ -0.07
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SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
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SH3BP5-208ENST00000459627 DIRC1Q969H9 104 aa14.48□□□□□ -0.09
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SH3BP5-208ENST00000459627 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa14.41□□□□□ -0.1
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SH3BP5-208ENST00000459627 LEPROTL1O95214 131 aa14.37□□□□□ -0.11
SH3BP5-208ENST00000459627 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP5-208ENST00000459627 IGKV2D-28P01615 120 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP5-208ENST00000459627 VPREB1P12018 145 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP5-208ENST00000459627 LINC00158P58513 81 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP5-208ENST00000459627 BCE1O60756 84 aa14.34□□□□□ -0.11
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SH3BP5-208ENST00000459627 SMIM13P0DJ93 91 aa14.31□□□□□ -0.12
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